| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,411,408 | 0 | A | T | 5.3% | 328.3 / 5.8 | 113 | intergenic (‑56/+31) | yfbS/yfbT | putative transporter/sugar phosphatas |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/62); new base T (4/2); total (49/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CAAAGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCGTTAACCGCAATG > NC_000913/2411260‑2411556 | caaaGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTGAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCcgac > 2:561953/1‑150 (MQ=255) aaaGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCcgacg < 2:556128/150‑1 (MQ=255) gACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACg > 2:1579424/1‑150 (MQ=255) 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cTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGcc < 1:1691663/150‑1 (MQ=255) gCCATCAAAACGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCgg < 2:158293/150‑1 (MQ=255) ccATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGa > 1:712900/1‑150 (MQ=255) tgatttaGCCCCGTCTCGTCGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCg > 2:1045494/7‑150 (MQ=255) tgatttaGCCCCGTCTCGTCGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCg > 1:1358664/7‑150 (MQ=255) 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gacgaGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGGATCTGCCGGAGCGTTAACCGCAatg < 1:60274/150‑1 (MQ=255) gacgaGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGGTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCGTTAACCGCAatg < 1:1152953/150‑1 (MQ=255) | CAAAGCGACCGCATCCATACGCACTCTGCCCGTCGCAAACAAGACGATGGCAACGGCCAGTAATGAAAGAACCCAAATCAATTCACCGTTCACAACTTATCCTTGTTAATTGAGGGGGATGACTTGATTCTGCCATAAAAAAGCCCCGACGAGACGGGGCTAAATCATGATCAGGTGTTTCACTGAATAATAACATCGCCATTTGGCTGTTTGGTCACAGTAATTTGCTCCAGACTGTGGAGGACCAAATCGACCTCATTCAGGCGCGGGGTATCTGCCGGAGCGTTAACCGCAATG > NC_000913/2411260‑2411556 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |