| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,966,876 | A→C | 8.1% | T154P (ACT→CCT) | rho → | transcription termination factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,966,876 | 0 | A | C | 8.1% | 317.7 / 13.9 | 109 | T154P (ACT→CCT) | rho | transcription termination factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/56); new base C (4/5); total (48/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.00e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |