| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 613,549 | T→G | 5.6% | R271R (CGT→CGG) | fes → | enterobactin/ferrienterobactin esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 613,549 | 0 | T | G | 5.6% | 364.8 / 5.7 | 131 | R271R (CGT→CGG) | fes | enterobactin/ferrienterobactin esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (73/48); new base G (4/5); total (78/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTT > NC_000913/613402‑613698 | gCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGc < 2:1505009/150‑1 (MQ=255)gCAACTTCCTCCCGCCGGGTATGTGTTGATCGACTCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTTGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGc < 1:1329955/150‑1 (MQ=255) cAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGcc < 1:979737/150‑1 (MQ=255) 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gCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGgggcggg > 1:1521185/1‑150 (MQ=255) cccTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGgca > 2:110401/1‑150 (MQ=255) cccTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGgca > 1:865781/1‑150 (MQ=255) tttAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGCCTGCACTGGCCTGCACGCTTTGGCTGTGTAGTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCaa > 1:289565/1‑150 (MQ=255) cggtgCGATCGGCACGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCaa > 2:1260389/5‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |