| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 756,886 | T→G | 87.0% | L327R (CTG→CGG) | sdhA → | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 756,886 | 0 | T | G | 87.0% | 259.0 / 31.3 | 108 | L327R (CTG→CGG) | sdhA | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/6); new base G (51/43); total (59/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-02 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GCCAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGC > NC_000913/756744‑757031 | tacAAAGACCTGGCGGGACGGGACGTTGTCGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTTAAGGTCGCGGCTGTTAGGGTCCGTGGGGTCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTATAGAAGTTCTCGAATCCCGTCGTCCGGGt < 1:355009/148‑1 (MQ=255) ccAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCGGCCGGGTa > 2:1249337/1‑150 (MQ=255) aaaGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAATCTCGATCAGCTGGGTAAAGATGTTCTCGAATCCCGTCGGCCGGGTaac > 1:53818/1‑148 (MQ=255) aGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCt < 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tcGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATg < 2:416852/150‑1 (MQ=255) cGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATga > 1:429760/1‑150 (MQ=255) cGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTCCCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCCCCCGGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATga > 2:1190854/1‑150 (MQ=255) gAATCCCGTCGGCCGGGTTTCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCTATCCGCTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACAAGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATgag < 2:1155676/150‑1 (MQ=255) cccGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAg < 1:1089978/150‑1 (MQ=255) 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cGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTTCCGGTCAGGACCTGACTGTGATTGAGAAAGGc > 2:139365/1‑150 (MQ=255) | GCCAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGC > NC_000913/756744‑757031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |