Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 756,886 | T→G | L327R (CTG→CGG) | sdhA → | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 756,886 | 0 | T | G | 94.3% | 378.2 / 6.4 | 124 | L327R (CTG→CGG) | sdhA | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
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ccAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAAACCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATGACCTGGGTAAAGAACGTCTCGAATCCCCTCGGCCGGGtt > 1:1433581/1‑149 (MQ=255) aaccccTGGGGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGCAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAAGTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCGGCCGGGTATcc < 1:833780/146‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAg < 1:1728542/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCt > 2:1251809/1‑150 (MQ=255) cGGGCCGTGACGTGGGTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGCCGCGGCTGGGATGGGCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCttt < 2:1328362/150‑1 (MQ=255) 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gTTCTCGAATCCCGTCGGCCGGGAATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACtgtg < 1:234025/150‑1 (MQ=255) ttCTCGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGa < 1:245706/150‑1 (MQ=255) tctgGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGaa > 1:212093/1‑150 (MQ=255) tctcGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCAGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCACGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTACGACCAAAGTTACCTCTCAGGCAATTACTGTGaa > 2:1618948/1‑150 (MQ=255) ctcGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACAGGTCAGGCACTGACTGTGAAt > 2:1752153/1‑150 (MQ=255) tcGACTCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGCGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATg < 2:1182505/150‑1 (MQ=255) tcGAATCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTTCCGGTCAGGCACTGACTGTGAATg < 2:2166964/150‑1 (MQ=255) aaTCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATgaga < 2:250704/150‑1 (MQ=255) aaTCCCGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATgaga < 2:770701/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAgg < 1:376885/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGAGTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAgg > 1:269608/1‑150 (MQ=255) cGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGc < 2:467529/150‑1 (MQ=255) | CGAACGCCAAAGACCTGGCGGGCCGTGACGTGGTTGCGCGTTCCATCATGATCGAAATCCGTGAAGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGC > NC_000913/756739‑757031 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |