New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2858336 | 128 (0.840) | 3 (0.020) | 3/268 | NT | 2.3% | coding (1244/2562 nt) | mutS | methyl‑directed mismatch repair protein |
? | NC_000913 | = 2858358 | 132 (0.890) | coding (1266/2562 nt) | mutS | methyl‑directed mismatch repair protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CAGCAACTGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTAATGCGGTG > NC_000913/2858209‑2858502 | cAGCAACTGCCGGAGCTGCGTGCGCATTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGAAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACggt < 1:122864/150‑1 (MQ=255) cAGCAACTGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACCGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACggt > 1:1396989/1‑150 (MQ=255) cAGCAACTGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACggt > 2:1121814/1‑150 (MQ=255) cAGCAACTGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACggt < 1:735697/150‑1 (MQ=255) cAGCAACTGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACggt > 2:2179146/1‑150 (MQ=255) cAACTGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTggt > 1:2511104‑M2/1‑147 (MQ=255) aaCTGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTggtg > 1:1044297‑M2/1‑146 (MQ=255) tGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTa < 2:662222/150‑1 (MQ=255) 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acacCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTg > 2:1271816/1‑150 (MQ=255) acCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTggtgtgtcgatgattgctcgctccagcagatcgcgcagctcggcaaactcgcccatcttctcacgta < 2:15212‑M2/92‑68 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGaaa > 1:2024510/1‑150 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGaaa > 1:2024509/1‑150 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGaaa < 1:1809038/150‑1 (MQ=255) ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGaaa < 2:1494609/150‑1 (MQ=255) cgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAg > 1:1698169/1‑150 (MQ=255) cgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAg > 1:1698167/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTgg < 2:852620/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTgg < 2:1459415/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGc < 1:606362/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGc > 2:2101396/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGTAAGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGc > 2:2048041/1‑150 (MQ=255) tGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTa > 2:957887/1‑150 (MQ=255) tGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTa > 1:899856/1‑150 (MQ=255) gTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGAGACCGATTATCAGGAGCGTCTGGAAGACAGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAATGTAGGCTTTAAt > 2:528165/1‑150 (MQ=255) aCGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTAATGc < 2:738733/150‑1 (MQ=255) aCGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTAATGc < 1:1659833/150‑1 (MQ=255) aCGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTAATGc < 2:1815080/150‑1 (MQ=255) aCGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTAATGc < 2:1428646/150‑1 (MQ=255) gcgACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGACGAGCTGGAGGAGGGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGAGTATCTGGAGCGGCGGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGACAGTTGGCTGTCATGCgg > 2:2475007/1‑150 (MQ=255) gcgACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTAATGCgg > 2:1827457/1‑150 (MQ=255) | CAGCAACTGCCGGAGCTGCGTGCGCAGTTAGAAACTGTCGATAGTGCACCGGTACAGGCGCTACGTGAGAAGATGGGCGAGTTTGCCGAGCTGCGCGATCTGCTGGAGCGAGCAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTGGATGAGTGGCGCGCGCTGGCTGACGGCGCGACCGATTATCTGGAGCGTCTGGAAGTCCGCGAGCGTGAACGTACCGGCCTGGACACGCTGAAAGTTGGCTTTAATGCGGTG > NC_000913/2858209‑2858502 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |