Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,162,152 | G→C | 5.5% | intergenic (+22/+18) | yijD → / ← trmA | DUF1422 family inner membrane protein/tRNA m(5)U54 methyltransferase, SAM‑dependent; tmRNA m(5)U341 methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,162,152 | 0 | G | C | 5.5% | 739.4 / 27.5 | 199 | intergenic (+22/+18) | yijD/trmA | DUF1422 family inner membrane protein/tRNA m(5)U54 methyltransferase, SAM‑dependent; tmRNA m(5)U341 methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (100/88); new base C (3/8); total (103/96) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
CAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACA > NC_000913/4162004‑4162301 | cAGCACGGTAGTTCGTGCGGACTATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGgc > 2:202346/1‑150 (MQ=255) cAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGgc < 1:224142/150‑1 (MQ=255) cAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGgc < 2:1374715/150‑1 (MQ=255) ggTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATcc < 1:2292737/150‑1 (MQ=255) tAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCgg < 2:663905/150‑1 (MQ=255) tAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCGCCAGCATCCgg < 2:1583264/150‑1 (MQ=255) tAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCGCCAGCATCCgg < 2:1010371/150‑1 (MQ=255) tAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTACTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCgg < 2:1905950/150‑1 (MQ=255) gaGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCGCCAGCATCCgg < 2:131663/149‑1 (MQ=255) tCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATg < 1:1611159/150‑1 (MQ=255) cGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGttt < 1:1284695/150‑1 (MQ=255) gAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTa < 1:465925/150‑1 (MQ=255) gAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTa < 2:533397/150‑1 (MQ=255) gAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTa > 1:2450102/1‑150 (MQ=255) aaTATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTAc > 1:1787189/1‑150 (MQ=255) atatCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACt > 2:1857936/1‑150 (MQ=255) atCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTc < 1:1621444/150‑1 (MQ=255) tCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTcg > 2:1161878/1‑150 (MQ=255) tCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTcg > 1:981950/1‑150 (MQ=255) tCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTcg > 2:1291167/1‑150 (MQ=255) ccGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTcgc < 2:519430/150‑1 (MQ=255) cGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTcgcg < 1:1538400/150‑1 (MQ=255) cGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTcgcg < 1:343019/150‑1 (MQ=255) ggATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCgg > 1:1743448/1‑150 (MQ=255) tatCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCa < 2:2003767/150‑1 (MQ=255) ctctAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATa > 1:1528919/1‑150 (MQ=255) ctctAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATa > 2:1922352/1‑150 (MQ=255) tctAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATAc > 1:965710/1‑150 (MQ=255) tAACTTCGTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATAcgc < 2:955691/150‑1 (MQ=255) ttcttcCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCa < 2:863730/150‑1 (MQ=255) ttcCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTc > 2:370484/1‑150 (MQ=255) cccGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCa < 2:450882/150‑1 (MQ=255) cccGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCa < 1:1182942/150‑1 (MQ=255) cccGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCa > 2:2514770/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCat > 1:444100/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCat > 1:924995/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCata > 1:1855627/1‑150 (MQ=255) tACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGc > 1:1866475/1‑150 (MQ=255) tACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGc > 2:1663072/1‑150 (MQ=255) tcCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTa > 1:1453391/1‑150 (MQ=255) tcCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTa > 2:555661/1‑150 (MQ=255) tcCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTAGTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTa > 2:2098834/1‑150 (MQ=255) cGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAgg > 2:2294268/1‑150 (MQ=255) gTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAggg < 2:591345/150‑1 (MQ=255) gTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAggg > 1:1247180/1‑150 (MQ=255) tCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAgggg > 2:430719/1‑150 (MQ=255) ttATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAAc < 1:419312/150‑1 (MQ=255) tATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACt > 1:2214415/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGAt < 2:47772/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGAt < 2:260851/150‑1 (MQ=255) tgtTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGAtga < 2:1062286/150‑3 (MQ=255) ttCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCaaa < 1:2433941/150‑1 (MQ=255) ttCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCaaa < 1:370484/150‑1 (MQ=255) tCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCAGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAAc > 1:1712923/1‑150 (MQ=255) cTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACa > 1:1023634/1‑150 (MQ=255) tGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACag > 2:2341090/1‑150 (MQ=255) tGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACag > 2:478662/1‑150 (MQ=255) tGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACag > 2:711627/1‑150 (MQ=255) tGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACag > 1:1760562/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGc < 1:748157/150‑1 (MQ=255) ggCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAg < 2:1338446/150‑1 (MQ=255) gcgcGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCATGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGa < 1:2559179/150‑1 (MQ=255) gATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGa < 2:1108258/150‑1 (MQ=255) gATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGa < 1:1117862/150‑1 (MQ=255) gATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGa < 1:1283627/150‑1 (MQ=255) aTGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGAc < 1:1642903/150‑1 (MQ=255) tGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGAcc > 2:2027145/1‑150 (MQ=255) tGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGAcc > 2:2066516/1‑150 (MQ=255) gCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCt > 2:2388717/1‑150 (MQ=255) tAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTtgt > 2:918123/1‑150 (MQ=255) tAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTtgt > 2:1199892/1‑150 (MQ=255) cGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGt > 1:1043208/1‑150 (MQ=255) cGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGt > 1:2110891/1‑150 (MQ=255) gTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTc < 1:1922352/150‑1 (MQ=255) gTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTc > 2:4163/1‑150 (MQ=255) tAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCt < 2:843893/150‑1 (MQ=255) tAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCt > 2:1011571/1‑150 (MQ=255) aGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTgg < 1:2504377/150‑1 (MQ=255) aGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTgg < 2:1456394/150‑1 (MQ=255) gCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGc < 1:1228835/150‑1 (MQ=255) aGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCtt > 2:1148879/1‑150 (MQ=255) aGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCtt > 2:1688812/1‑150 (MQ=255) aGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCAAATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCATGTGCGTCTGGCtt > 1:603637/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGCAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTaa < 1:1899509/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGt < 2:1290979/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGt < 2:2445342/150‑1 (MQ=255) tGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGttt < 1:140567/150‑1 (MQ=255) tGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCa > 2:2295364/1‑150 (MQ=255) attatGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGTGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATa < 2:1442/150‑1 (MQ=255) attatGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATa < 1:586746/150‑1 (MQ=255) atGCCGGATGCGCCAGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACg > 1:2577320/1‑150 (MQ=255) atGCCGGATGCGCCAGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACg > 1:1953616/1‑150 (MQ=255) ccGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGttt > 2:2273843/1‑150 (MQ=255) gATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCg > 2:2451821/1‑150 (MQ=255) gATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCg > 2:2238200/1‑150 (MQ=255) gATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCg > 2:2451732/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCggg > 1:910403/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGtt > 2:1747736/1‑150 (MQ=255) tGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTa < 2:1228520/150‑1 (MQ=255) gcgcATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACa > 1:1590392/1‑150 (MQ=255) | CAGCACGGTAGTTCGTGCGGAATATCCGGATATCGGCTCTAACTTCTTCCCGGCAGTACTCTCCGTCATTATGGTGTTCTGGATTGGCGCGAAGATGCGTAACCGTAAGCAGGAAGTTGCTGAGTAATCGGTATTATGCCGGATGCTGGCGCATCCGGCATGGGTTTTACTTCGCGGTCAGTAATACGCCGCACTCCATATGGTGCGTGTAGGGGAACTGATCAAACAGAGCCAGACGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACA > NC_000913/4162004‑4162301 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |