| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,546,696 | 0 | A | T | 6.3% | 699.0 / 25.8 | 191 | S158R (AGT→AGA) | yddG | aromatic amino acid exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (86/93); new base T (6/6); total (92/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TCTGGTTGTGGCGTAAGAAAATAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGG > NC_000913/1546547‑1546841 | tCTGGTTGTGGCGTAAGAAAATAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATaa < 2:892685/150‑1 (MQ=255)tCTGGTTGTGGCGTAAGAAAATAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATaa < 2:683770/150‑1 (MQ=255)tCTGGTTGTGGCGTAAGAAAATAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATaa < 1:2364180/150‑1 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cAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGAc < 2:1676017/150‑1 (MQ=255) aTGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCa > 1:1024280/1‑150 (MQ=255) tGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATCATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCAt < 2:864750/150‑1 (MQ=255) tGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCAt > 2:2351943/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTaa > 2:513043/1‑150 (MQ=255) aGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGa < 1:1103965/150‑1 (MQ=255) ggAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGaa < 1:2451884/150‑1 (MQ=255) | TCTGGTTGTGGCGTAAGAAAATAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGG > NC_000913/1546547‑1546841 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |