| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3932697 = | 221 (1.270) | 5 (0.030) | 3/264 | NT | 2.6% | coding (1382/1869 nt) | kup | potassium transporter |
| ? | NC_000913 | 3932769 = | 161 (0.980) | coding (1454/1869 nt) | kup | potassium transporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GTTCACCGCTAACCTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTGATTCTGTTAACTCTGC > NC_000913/3932548‑3932846 | gTTCACCGCTAACCTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTCCTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCgat > 1:655691/1‑150 (MQ=255)gTTCACCGCGAACCTCGATACCCTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCgat < 2:21623/150‑1 (MQ=255) cACCGCTAACCTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCgatgat < 1:894396/150‑1 (MQ=255) cACCGCTAACCTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCgatgat < 1:1666503/150‑1 (MQ=255) aaagtgggcgacagttgttcaatctgtacccgacggacgttatggacatatggagcgtcttcggtgcgcagagttaacagaatcacccgctcatgcaataccttgttatgtttaaggttatgcatcagcgcaaagggaatgacgtTGAtt > 1:1421362‑M1/146‑150 (MQ=255) aCCTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCAATCATCGCTTcca < 2:1706234/150‑3 (MQ=255) ccTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCt > 1:1039960/1‑150 (MQ=255) ccTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCt < 2:322021/150‑1 (MQ=255) ccTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCt < 1:928418/150‑1 (MQ=255) ccTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCt > 1:2500321/1‑150 (MQ=255) ccTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCt > 1:1145320/1‑150 (MQ=255) ccTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCt < 2:825594/150‑1 (MQ=255) cTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTg > 2:1850975/1‑150 (MQ=255) 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ccGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCt > 1:2087730/1‑150 (MQ=255) gCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTa > 1:1187383/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTaaa < 2:1972749/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTaaa < 1:2553727/150‑1 (MQ=255) ctgcGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACAt > 1:1687639/1‑150 (MQ=255) ctgcGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTGTGCGCTGATGCATAACCTTAAACAt > 2:664530/1‑150 (MQ=255) gcggATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACaa < 1:691110/150‑1 (MQ=255) aTGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTa < 2:2076007/150‑1 (MQ=255) aTGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTa < 2:67891/150‑1 (MQ=255) aTGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTa > 1:2146022/1‑150 (MQ=255) tGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTAt > 1:2471750/1‑150 (MQ=255) gCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTAtt < 2:2642771/150‑1 (MQ=255) cATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTg < 2:2725673/150‑1 (MQ=255) aTGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAATCATAACTAGGTATTGc > 1:1714339/1‑150 (MQ=255) aTGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGc > 1:2590732/1‑150 (MQ=255) aTGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGGGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGc > 2:2192931/1‑150 (MQ=255) aCTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTGa < 2:552739/150‑1 (MQ=255) tGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTGATTCTGt > 2:1549845/1‑150 (MQ=255) tGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTGATTCTGt < 1:1212116/150‑1 (MQ=255) aaGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTGATTCTGTTaa < 1:75058/150‑1 (MQ=255) gatgatTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTGATTCTGTTAActct < 1:1875938/150‑1 (MQ=255) gatgatTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGGTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTGATTCTGTTAActct > 1:1983947/1‑150 (MQ=255) | GTTCACCGCTAACCTCGATAAACTGCTCTCCGGCGGCTGGTTGCCATTGAGCCTCGGTACTGTGATGTTTATCGTGATGACCACCTGGAAGAGCGAGCGTTTCCGCTTGCTGCGGCGGATGCATGAACATGGTAACTCTCTGGAAGCGATGATTGCTTCGCTGGAGAAATCACCGCCTGTTCGCGTGCCCGGGACCGCGGTGTATATGTCGCGTGCAATCAACGTCATTCCCTTTGCGCTGATGCATAACCTTAAACATAACAAGGTATTGCATGAGCGGGTGATTCTGTTAACTCTGC > NC_000913/3932548‑3932846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |