| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,458,110 | C→A | 100% | T578T (ACC→ACA) | gspD → | general secretory pathway component, cryptic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,458,110 | 0 | C | A | 100.0% | 783.5 / NA | 202 | T578T (ACC→ACA) | gspD | general secretory pathway component, cryptic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (102/100); total (102/100) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
TACTATTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACCGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCTGGT > NC_000913/3457963‑3458256 | tACTATTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGa < 1:120827/150‑1 (MQ=255) tATTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcg > 1:1718145/1‑150 (MQ=255) ttCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgcg > 1:2334714/1‑150 (MQ=255) ttCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgcg > 1:1059431/1‑150 (MQ=255) ttCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgcg > 1:1059467/1‑150 (MQ=255) tCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAgcgcgc < 2:810150/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTaaa < 2:1116171/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTaaa < 2:2083896/150‑1 (MQ=255) aCGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAAc < 1:358518/150‑1 (MQ=255) cGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACg < 1:2692692/150‑1 (MQ=255) cGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACg > 1:2028678/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCaa < 2:2601733/150‑1 (MQ=255) tGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAAcc > 1:1053434/1‑150 (MQ=255) ggTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGAt < 1:1000098/150‑1 (MQ=255) cGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAt > 1:2875445/1‑150 (MQ=255) ggTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtc > 2:1907309/1‑150 (MQ=255) ggTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtc > 2:300387/1‑150 (MQ=255) gTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtcc < 2:2829976/150‑1 (MQ=255) gTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtcc > 1:647024/1‑150 (MQ=255) tGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtccg > 2:741569/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtccgtc > 1:2570742/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTAtccgtc > 2:2017885/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCcga < 2:2184219/150‑1 (MQ=255) ggtggtCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCcgac < 1:1870945/150‑1 (MQ=255) ggtggtCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCcgac < 1:2725749/150‑1 (MQ=255) ggtggtCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCcgac < 1:597898/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATc < 2:2566072/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCATTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATc < 1:1372861/150‑1 (MQ=255) ggCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGt < 1:936443/150‑1 (MQ=255) ggCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGt < 1:2670628/150‑1 (MQ=255) cGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGa > 2:2534895/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACga > 2:471947/1‑150 (MQ=255) gCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACCCAACATGATGGAATTTATCCTACCGAGAATAAACCGTGACgaggt > 1:1734629/1‑147 (MQ=255) cTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACgatgat < 2:1408893/150‑1 (MQ=255) cTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACgatgat < 2:588025/150‑1 (MQ=255) tGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGatgatg < 2:2167745/150‑1 (MQ=255) tGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGatgatg > 1:1859788/1‑150 (MQ=255) gatgatTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCTCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGtt < 2:591689/150‑1 (MQ=255) gatgatTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGtt < 2:8363/150‑1 (MQ=255) gatgatTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGtt > 1:2908503/1‑150 (MQ=255) atgatTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGttt < 2:2912003/150‑1 (MQ=255) tgatTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTa > 1:2113083/1‑150 (MQ=255) gatTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTAt < 1:627510/150‑1 (MQ=255) tttttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCGCAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCg > 1:2428329/1‑150 (MQ=255) ttttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGc > 1:462867/1‑150 (MQ=255) tttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCt < 2:2621463/150‑1 (MQ=255) tttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCt > 1:1440961/1‑150 (MQ=255) ttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTc > 2:1050624/1‑150 (MQ=255) ttCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTc > 2:1760053/1‑150 (MQ=255) tCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCa < 2:19679/150‑1 (MQ=255) tAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACt < 2:1229050/150‑1 (MQ=255) tAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACt < 2:1838374/150‑1 (MQ=255) tAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACt > 2:641015/1‑150 (MQ=255) 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tctGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTa > 1:1522461/1‑150 (MQ=255) tGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTAcc < 2:1524769/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTc > 1:437274/1‑150 (MQ=255) ttGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTc < 2:2118748/150‑1 (MQ=255) tGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCa < 1:792907/150‑1 (MQ=255) ggCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAg < 2:335505/150‑1 (MQ=255) ggCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAg > 1:559932/1‑150 (MQ=255) gCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAgg > 2:2852351/1‑150 (MQ=255) ccTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGcaacaa > 2:2239691/1‑150 (MQ=255) cTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCaacaac > 1:277888/1‑150 (MQ=255) cTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCaacaac > 1:1850077/1‑150 (MQ=255) tttAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAacaaca > 1:760947/1‑150 (MQ=255) tttAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAacaaca > 1:1597495/1‑150 (MQ=255) aGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCg > 2:2858609/1‑150 (MQ=255) tGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGa > 1:528725/1‑150 (MQ=255) tGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGa > 2:1018390/1‑150 (MQ=255) tGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGa < 2:2741169/150‑1 (MQ=255) ggCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCg > 1:719449/1‑150 (MQ=255) ggCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCg > 1:1814100/1‑150 (MQ=255) ggCAACTCTTCCGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCg > 2:1453037/1‑150 (MQ=255) 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cGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCa > 2:421726/1‑150 (MQ=255) cGCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGAGGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAACGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGaccgca > 2:522647/1‑145 (MQ=255) gCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCaa > 1:2602286/1‑150 (MQ=255) gCTATACCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCaa > 2:2106645/1‑150 (MQ=255) aCCTCCACAGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAgcg < 2:909610/150‑1 (MQ=255) 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cacaGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCTGGt > 2:2669177/1‑150 (MQ=255) cacaGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCTGGt > 2:234467/1‑150 (MQ=255) | TACTATTCAAAACGCCGTGCTGGTCAAAACCGGTGAAACGGTGGTCCTGGGCGGATTGCTGGATGATTTTTCTAAAGAGCAAGTGTCAAAGGTTCCTCTGCTTGGCGATATTCCTTTAGTGGGGCAACTCTTCCGCTATACCTCCACCGAGCGCGCTAAACGCAACCTGATGGTATTTATCCGTCCGACGATTATCCGTGACGATGATGTTTATCGCTCACTGTCAAAAGAGAAATACACCCGTTACCGTCAGGAGCAACAACAGCGGATCGACGGGAAATCAAAAGCGCTGGT > NC_000913/3457963‑3458256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |