| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,426,706 | G→T | 5.8% | pseudogene (253/933 nt) | tmpR → | Rac prophage; pseudogene, tail protein family;Phage or Prophage Related; putative alpha helix protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,426,706 | 0 | G | T | 5.8% | 504.5 / 14.9 | 137 | pseudogene (253/933 nt) | tmpR | Rac prophage; pseudogene, tail protein family;Phage or Prophage Related; putative alpha helix protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (71/58); new base T (4/4); total (75/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GGAAACTGCTGCAAATAGCGCAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAGCGCAGGCTCA > NC_000913/1426558‑1426854 | ggAAACTGCTGCAAATAGCGCAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGa < 1:1343895/150‑1 (MQ=255) aaaCTGCTGCAAATAGCGCAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATa > 2:1812744/1‑150 (MQ=255) tgctgcAAATAGCGCAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAgg > 2:856385/1‑150 (MQ=255) tgcAAATAGCGCAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCt < 2:1964024/150‑1 (MQ=255) aaaTAGCGCAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTAt < 2:2271364/150‑1 (MQ=255) gcAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATaaa > 2:2575178/1‑150 (MQ=255) gcAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATaaa > 2:1491447/1‑150 (MQ=255) aaaGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAgaagaa < 2:1806818/150‑1 (MQ=255) aaGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCTATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAat > 1:2779955/1‑150 (MQ=255) aaGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCTATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAat > 1:1529826/1‑150 (MQ=255) aaGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCTATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAat > 1:1579728/1‑150 (MQ=255) aGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAata < 2:1631508/150‑1 (MQ=255) aGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAata < 2:549038/150‑1 (MQ=255) aCTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGaa > 2:1904888/1‑150 (MQ=255) aCTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGaa > 2:1790847/1‑150 (MQ=255) aCTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGaa > 2:2607696/1‑150 (MQ=255) tAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAAtt > 1:1190767/1‑150 (MQ=255) tAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAAtt > 1:1578479/1‑150 (MQ=255) tAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAAtt > 1:2685791/1‑150 (MQ=255) tAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAAtt > 1:1458577/1‑150 (MQ=255) ggCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATTCTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCt < 1:247063/150‑1 (MQ=255) aCAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTc < 2:2667003/150‑1 (MQ=255) agaagaTGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCg > 1:455326/1‑150 (MQ=255) agaagaTGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCg > 1:1545647/1‑150 (MQ=255) agaTGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTaa < 1:2907807/150‑1 (MQ=255) gaTGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTaaa > 2:1461933/1‑150 (MQ=255) tGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACt > 1:2067869/1‑150 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa < 1:2177562/150‑1 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa < 1:2177962/150‑1 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa > 2:1440933/1‑150 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa > 1:1838539/1‑150 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa < 2:423131/150‑1 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa > 1:2597798/1‑150 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa < 1:1479796/150‑1 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa < 1:1240069/150‑1 (MQ=255) gaagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTaa < 1:708198/150‑1 (MQ=255) aagaaCGCTCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCTCAATTGATACTGTCGTTCGACGATATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAAt < 2:2284569/150‑1 (MQ=255) aagaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAAt > 1:473737/1‑150 (MQ=255) gaaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGa > 2:1589131/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGaa > 1:2595564/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGaa < 2:2558673/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGaaa < 2:2382969/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGaaa < 2:708110/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAAcc > 2:689307/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAAcc > 1:2055098/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAAcc > 1:2487686/1‑150 (MQ=255) cGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACaga < 1:2909782/150‑1 (MQ=255) cGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACaga < 2:1317808/150‑1 (MQ=255) gCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACagag > 2:231496/1‑150 (MQ=255) cAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAgg > 1:1550193/1‑150 (MQ=255) aaaaTTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGa > 1:2415849/1‑150 (MQ=255) aaaaTTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGa > 2:2851531/1‑150 (MQ=255) ttAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTg > 2:1227200/1‑150 (MQ=255) agcagcTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCgg > 2:2706802/1‑150 (MQ=255) agcagcTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCgg > 2:635634/1‑150 (MQ=255) agcagcTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCgg < 2:1671461/150‑1 (MQ=255) gcagcTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCggg > 2:171549/1‑150 (MQ=255) cagcTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCgggg > 2:313094/1‑150 (MQ=255) agcTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGt > 2:237095/1‑150 (MQ=255) agcTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGAGAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGt > 2:228505/1‑150 (MQ=255) cTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTg > 1:1096569/1‑150 (MQ=255) ttGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTgcgc > 1:791657/1‑150 (MQ=255) ttGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTgcgc > 1:791792/1‑150 (MQ=255) gATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCaa > 1:1193913/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAg > 2:127615/1‑150 (MQ=255) cAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAgcgc > 1:1028010/1‑150 (MQ=255) cAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAgcgc > 2:2350979/1‑150 (MQ=255) cAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAgcgc > 1:1994967/1‑150 (MQ=255) ttGGTGCCGCAAGTGATACTGTCGGTCGTGGCGATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGCTACCGGGCTTATTGATAAAGAAGAAGATGAATTTCTTGTCCGTACACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCaga < 2:1592333/150‑1 (MQ=255) ccGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTATTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAg > 1:538433/1‑150 (MQ=255) gCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGcc > 1:1509745/1‑150 (MQ=255) aaTTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCga < 2:2112006/150‑1 (MQ=255) aaTTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCga < 2:1283321/150‑1 (MQ=255) aaTTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCga < 2:945593/150‑1 (MQ=255) aCTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGcc < 1:2652072/150‑1 (MQ=255) tcgACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACt > 1:1116429/1‑150 (MQ=255) cgACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACtt < 1:1977694/150‑1 (MQ=255) gACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCTATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTtg < 2:2779955/150‑1 (MQ=255) gACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCTATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTtg < 2:1529826/150‑1 (MQ=255) gACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCTATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTtg < 2:1529816/150‑1 (MQ=255) gACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTtg < 1:1589131/150‑1 (MQ=255) cGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTtgct < 2:2618329/150‑1 (MQ=255) gCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTtgctg < 2:2936217/150‑1 (MQ=255) cTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTtgctgc < 1:2491369/150‑1 (MQ=255) tCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCt > 1:2767323/1‑150 (MQ=255) gAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTcag < 2:2067869/150‑1 (MQ=255) aaTTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTcagc < 2:1456431/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGACTTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTcagca > 1:928976/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTcagca > 1:928741/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTcagca < 1:1440933/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTcagca < 2:1838539/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAACAAGAATATGAATTACTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTcagca < 1:2305919/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAgcgc < 1:1790863/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAgcgc < 2:2706169/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAgcgc < 2:182936/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAgcgc < 2:182846/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAgcgc < 2:2706166/150‑1 (MQ=255) tttttCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAGCGCAg < 2:467794/150‑1 (MQ=255) ttCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAGCGCAGGCt > 2:1309059/1‑150 (MQ=255) cGATACAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAGCGCAGGCTCa < 2:957422/150‑1 (MQ=255) | GGAAACTGCTGCAAATAGCGCAGGGAAAGTGACTAAGGCAACAGAAGATGAGAAGAACGCGCTCGCAAAATTAAAAGCAGCTATTGATCCAGTTGGTGCCGCAATTGATACTGTCGGTCGACGCTATTCTGAATTAAAGAAATTTTTCGATAAAGGGCTTATTGATAAAGAAGAATATGAATTTCTTGTCCGTAAACTTAATGAAACCACAGAGGAATTGAGCGGGGTTGCGCAAGCGCAGAGAGAAGCCGAGAAGGCCGGAAAACTTGCTGCCGCTCAGCAGGAAGCGCAGGCTCA > NC_000913/1426558‑1426854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |