Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,568,917 | 0 | A | T | 6.0% | 473.4 / 14.2 | 133 | intergenic (‑94/+37) | yddW/gadC | liprotein, glycosyl hydrolase homolog/glutamate:gamma‑aminobutyric acid antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/59); new base T (2/6); total (68/65) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.59e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TAGTATCGCTGGTCTTCTAATCGTTAATTTCTTGTTTCGGGAGCAGATATCCATATGTGCTGGTTTCCGGTAAACAGATGTGCGCTCATTCTCGTACTTATCCCCGTTAAGTCAATACGACAGCAAGCACGAAAAAGGGAGCGATGAATTATCGCTCCCTTGTCTTATAACCATTCAGACATGGTTAGTGTTTCTTGTCATTCATCACAATATAGTGTGGTGAACGTGCACGCGGGTGCAGGAAGAAGTGACCTTTTGGTGCGTTCTGACTGTTGATTGGCTCCAGAGTGACGCCG > NC_000913/1568770‑1569065 | tAGTATCGCTGGTCTTCTAATCGTTAATTTCTTGTTTCGGGAGCAGATATCCATATGTGCTGGTTTCCGGTAAACAGATGTGCGCTCATTCTCGTACTTATCCCCGTTAAGTCAATACGACAGCAAGCACGAAAAAGGGAGCGATGaagt > 2:2438851/1‑148 (MQ=255) tAGTATCGCTGGTCTTCTAATCGTTAATTTCTTGTTTCGGGAGCAGATATCCATATGTGCTGGTTTCCGGTAAACAGATGTGCGCTCATTCTCGTACTTATCCCCGTTAAGTCAATACGACAGCAAGCACGAAAAAGGGAGCGATGAAtt > 2:2495113/1‑150 (MQ=255) gTATCGCTGGTCTTCTAATCGTTAATTTCTTGTTTCGGGAGCAGATATCCATATGTGCTGGTTTCCGGTAAACAGATGTGCGCTCATTCTCGTACTTATCCCCGTTAAGTCAATACGACAGCAAGCACGAAAAAGGGAGCGATGAATTAt < 2:1911912/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |