| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4542690 | 146 (1.130) | 8 (0.070) | 8/260 | NT | 5.7% | intergenic (+57/‑425) | fimE/fimA | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/major type 1 subunit fimbrin (pilin) |
| ? | NC_000913 | = 4542986 | 130 (1.070) | intergenic (+353/‑129) | fimE/fimA | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/major type 1 subunit fimbrin (pilin) | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
TGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTT > NC_000913/4542542‑4542839 | ttgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCa > 2:254435‑M1/142‑150 (MQ=255) cGTTATACAGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAAAAAATACAAGACAATTGGGTCCaaaa > 1:280915/1‑149 (MQ=255) ttATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTg < 2:1692408/150‑1 (MQ=255) ttATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTATTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTAGATTAAACTTATTTATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATAGGGCCCAAACTg > 1:1781070/1‑150 (MQ=255) tataCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGt < 2:1630504/150‑1 (MQ=255) ataCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTc < 1:195216/150‑1 (MQ=255) taCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTcc > 1:169425/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCa < 2:994468/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactca > 2:1939873‑M1/1‑140 (MQ=255) ccGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCat > 1:553909/1‑150 (MQ=255) gTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCata < 2:472913/150‑1 (MQ=255) gTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCata < 2:512294/150‑1 (MQ=255) aaTGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataaa > 2:2195917/1‑150 (MQ=255) gctgctCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAATAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataaataa > 1:1229953/1‑150 (MQ=255) ctgctCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAg < 2:421512/150‑1 (MQ=255) gctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAg < 1:1172913‑M1/31‑1 (MQ=255) gctCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGtt > 2:256705/1‑150 (MQ=255) gctCGTTTTGCAGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGtt < 1:883840/150‑1 (MQ=255) tCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTAc < 1:744891/150‑1 (MQ=255) tGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTAttt > 2:1524953/1‑150 (MQ=255) ctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTAtt < 2:1144175‑M1/40‑1 (MQ=255) ccGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTAttttt > 1:1446260/1‑150 (MQ=255) ggATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTtc < 1:981879/150‑1 (MQ=255) ggATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTtc < 1:497439/150‑1 (MQ=255) ggATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTtc > 2:1161990/1‑150 (MQ=255) aaaaactttttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTtct > 1:856099‑M1/105‑150 (MQ=255) ttATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCa < 2:887212/150‑1 (MQ=255) tttttaaagaaaAAAACTCATAAACGAAAAATTAAAAAGATAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATATTAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTTGGGCCATACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAg < 1:1552325/145‑1 (MQ=255) aTGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAg > 1:2002600/1‑150 (MQ=255) gggAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCa > 2:675765/1‑150 (MQ=255) aaagaaaTAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATaa < 1:2193739/150‑1 (MQ=255) aagaaaTAATCTCATAAACGAAAAAATAAAAAGAGAAGCGGTTAGAATTAACTTATTGATTATAAAGTT‑AAAAAAACAACTAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATCAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATaac < 1:1194807/150‑2 (MQ=255) aaaTAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGTCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTAAGTATTTTTTCTAATGCATAAAAat > 1:1577809/1‑150 (MQ=255) aataatCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAata > 2:777356/1‑150 (MQ=255) aataatCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAata < 2:721314/150‑1 (MQ=255) taatCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATAtt < 1:1220405/150‑1 (MQ=255) taatCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATAtt > 1:1529585/1‑150 (MQ=255) taatCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATAtt > 2:767144/1‑150 (MQ=255) aatCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCTAAAAAATATTa > 2:2115172/1‑150 (MQ=255) agctcATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAATAGTTTTTATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGTTGACAAACTCTCCATATCATAAATAAGGTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaa < 1:141760/148‑1 (MQ=255) tctaATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAATAGGTTTGATTTAACTTATTTATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTTGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaa < 1:34247/150‑1 (MQ=255) tcATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaaaa > 1:1085587/1‑150 (MQ=255) acATAAAAGAAAAATTAAAAAGAGAAGATGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaaaa < 1:2156325/149‑1 (MQ=255) aTAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAAc < 2:130614/150‑1 (MQ=255) tAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACg < 2:1818722/150‑1 (MQ=255) aaaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATTAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGa < 2:1807089/150‑1 (MQ=255) aaaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGa < 2:551319/150‑1 (MQ=255) aaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGAc < 1:2066482/150‑1 (MQ=255) gAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAAAATTAAAAAACGACaaa > 1:1656079/1‑150 (MQ=255) aaTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGc < 2:1077407/150‑1 (MQ=255) aaTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGc < 2:1082499/150‑1 (MQ=255) aTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCa < 2:1651395/150‑1 (MQ=255) gtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATc < 2:823399‑M1/82‑1 (MQ=255) aaaaaGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTGTTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCt < 1:630241/150‑1 (MQ=255) aaaaaGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCt < 2:945293/150‑1 (MQ=255) aaaaaGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCt < 2:293602/150‑1 (MQ=255) aaaaaGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATAGGGGCCAAACTGTCCAAATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTATCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCt > 2:652841/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTa < 2:1986034/150‑1 (MQ=255) gagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttata > 1:951887‑M1/1‑66 (MQ=255) gagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGa < 2:244763/150‑1 (MQ=255) agGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatag < 1:1506765‑M1/150‑86 (MQ=255) ggTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttataga > 1:1694971‑M1/1‑64 (MQ=255) gTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatagat > 1:823399‑M1/1‑63 (MQ=255) tGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTa < 2:1461307/150‑1 (MQ=255) taTTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTTTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTa < 1:1334703/149‑1 (MQ=255) taTTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTaa > 1:1353985/2‑150 (MQ=255) acgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTATCAATCATAAAAATATTAAAAAAAGACAAAAAGCATCTAACTGTATGATATGTaa < 2:683024‑M1/100‑1 (MQ=255) aTTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTaaa > 2:694150/1‑150 (MQ=255) ttAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAatt < 2:1874664/150‑1 (MQ=255) ttATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc < 1:1009992/150‑1 (MQ=255) tATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCt < 1:739189/150‑1 (MQ=255) aTTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTa > 2:40127/1‑150 (MQ=255) taataaAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTa < 1:1878144/150‑1 (MQ=255) ataaAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTaaa > 2:1834427/1‑150 (MQ=255) acactgcacagttttacaccaaaagatgaaacatTTGGTGACAAACTGTCCATATCATAAATAATTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTaa > 1:208565‑M1/35‑150 (MQ=255) aGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAaattaa > 2:1807839/1‑150 (MQ=255) gTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAaattaat > 1:204683/1‑150 (MQ=255) tt‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTTGGGACAAACTGTACATATAATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAaattaatt < 1:256705/150‑1 (MQ=255) tt‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAaattaatt < 2:1127759/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTc < 2:592496/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTc > 2:1716117/1‑150 (MQ=255) aaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTcaca > 2:1205817/1‑150 (MQ=255) aaataaatACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTATCAAGCATAAAAATATTAAAAATCGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCAcc < 2:381751/150‑1 (MQ=255) caaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTc > 1:1144175‑M1/16‑150 (MQ=255) taaataCAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCAAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTcc < 1:842855/150‑1 (MQ=255) taaataCAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGAATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTcc > 2:1757193/1‑150 (MQ=255) aataCAAGACAAATTGGGACAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTGGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGc < 1:411491/150‑1 (MQ=255) cAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACATCCGCtata > 2:1240790/1‑150 (MQ=255) aaaGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAATTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCtata < 1:896166/149‑1 (MQ=255) aGACAATTGTGGCCAAACTGTCCATATAATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATg < 2:1606008/150‑1 (MQ=255) gACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGt > 1:2146888/1‑150 (MQ=255) aaTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTaaa < 2:2002600/150‑1 (MQ=255) TGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCt > 2:803803‑M1/1‑150 (MQ=255) TGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCt > 2:978231‑M1/1‑150 (MQ=255) ggggCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatagatgtttatattgcatgaggtggtttttggagagaagaatgaggaagatgcgtcgagcc < 1:1802971‑M1/150‑144 (MQ=255) GGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTa < 1:40431‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATAACCTACGCTATATGTAAAGCTa < 2:131738‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAAc > 1:779131‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCCAAACTGTACATATCATAAATAAGTTAAGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAAc > 1:195990‑M1/1‑150 (MQ=255) GCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCGCAAGCATAAAAATATTAAAATACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAAGTAATTTCACATCACCTCCGCTAGATGTTAAGCTAACg < 2:142109‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTT > NC_000913/4542542‑4542839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |