| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,165,626 | T→C | 5.0% | intergenic (+105/‑42) | yegP → / → yegQ | UPF0339 family protein/putative peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,165,626 | 0 | T | C | 5.0% | 372.5 / 6.0 | 119 | intergenic (+105/‑42) | yegP/yegQ | UPF0339 family protein/putative peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/59); new base C (3/3); total (57/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GTTAAAGCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGTTA > NC_000913/2165477‑2165768 | gTTAAAGCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtcat > 2:609067/1‑150 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGCCCAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtcata > 2:283861/1‑149 (MQ=255) tAAAGCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTCCCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGAACTCCCCTAACCGCTtcatca > 1:1300018/1‑150 (MQ=255) 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ccTTAAAGTGGGGGCACTCCCCAAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGAt > 1:2042131/1‑150 (MQ=255) ttAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGc < 1:1463609/150‑1 (MQ=255) ttAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCCCTTCATCAGGTGAAGAGGATCTGACCAGACATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTACTTTCCCCGGCGGGAACGCAGAAAAATATGCGTTACTCTATCGCTAATGGCGCAGATGc > 1:605022/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTg > 1:2161313/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAAGATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGctgctg > 2:419799/1‑150 (MQ=255) gCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCgg < 2:1638236/150‑1 (MQ=255) aCTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGc < 1:1196336/150‑1 (MQ=255) aCTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTGTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGCACGCTGACAACTCTGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGc < 1:419799/150‑1 (MQ=255) cTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGcc > 1:2079107/1‑150 (MQ=255) cTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGcc < 1:252738/150‑1 (MQ=255) cTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGcc > 1:1166788/1‑150 (MQ=255) ccTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGcc < 2:1733001/150‑1 (MQ=255) ccTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGcc < 2:1300018/150‑1 (MQ=255) cTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcg > 1:869570/1‑150 (MQ=255) agatccGCTTCACCTGATGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcg > 2:280522/5‑150 (MQ=255) agatccGCTTCACCTGATGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcg > 1:919242/5‑150 (MQ=255) aaCCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcgcg < 2:2200137/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcgcg > 1:1893559/1‑150 (MQ=255) tccGCTTCACCTGATGAAGCGGATCTCACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGt > 2:871505/2‑150 (MQ=255) ccGCTTCATCAGGTGACGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCGGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGtt < 1:854089/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGtt < 2:2178074/150‑1 (MQ=255) cGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGCCCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTATACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTTTCCGGGCACGCGGCGtga > 1:104455/1‑148 (MQ=255) | GTTAAAGCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGTTA > NC_000913/2165477‑2165768 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |