| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,165,628 | A→T | 5.5% | intergenic (+107/‑40) | yegP → / → yegQ | UPF0339 family protein/putative peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,165,628 | 0 | A | T | 5.5% | 356.8 / 5.9 | 119 | intergenic (+107/‑40) | yegP/yegQ | UPF0339 family protein/putative peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (54/58); new base T (3/4); total (57/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TAAAGCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGTTATTCCCTGCG > NC_000913/2165479‑2165777 | tAAAGCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTCCCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGAACTCCCCTAACCGCTtcatca > 1:1300018/1‑150 (MQ=255)tAAAGCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtcatca < 2:1361629/150‑1 (MQ=255) gCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTg > 2:214947/1‑150 (MQ=255) cAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCTTCAGGTGaa > 2:1595679/1‑150 (MQ=255) aTGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCACACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGc < 1:1934653/150‑1 (MQ=255) aTGCCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGc < 2:1547722/150‑1 (MQ=255) ggCACAAGCCAGACGTTGAAAGACAATACGTACTTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGTCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCACCTGATGAAGCgg < 1:851503/150‑1 (MQ=255) ggCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCgg > 2:1889308/1‑150 (MQ=255) gCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTCCCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCAATCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGactcggt > 2:2055884/1‑144 (MQ=255) ccacaAGCCAGACGGTGTAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCACCTGATGAAGCggt < 1:1123925/149‑2 (MQ=255) caAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGc > 1:2010492/1‑144 (MQ=255) caAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCt < 1:1694246/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGGGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCACCTGATGAAGCggttagg < 1:50089/150‑6 (MQ=255) aGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGa < 1:1482795/150‑1 (MQ=255) aGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGa > 1:377860/1‑150 (MQ=255) gCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGGCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGAc < 1:1707434/150‑1 (MQ=255) ccAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTGGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGTcc < 2:1869324/150‑1 (MQ=255) ccAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGGTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGAcc < 2:217993/150‑1 (MQ=255) cAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCt > 2:1031712/1‑150 (MQ=255) cAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCt > 2:2063421/1‑150 (MQ=255) aGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTg < 2:1135143/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGtcat > 1:2178074/1‑150 (MQ=255) gTGATAGTCAATACGTAATTACGATGCGGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGGTACAATGCCCGCCCTTTAAGTGGGGGCACTCACCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGtcatc < 2:1501968/150‑1 (MQ=255) gTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGtcatc < 1:80557/150‑1 (MQ=255) gTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTGGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGtcatc < 1:1657884/150‑1 (MQ=255) aaaGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGa > 2:754767/1‑150 (MQ=255) cGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAAt > 2:1368652/1‑150 (MQ=255) cGTAAATACGATGCCGGGCGAGGGTTGTTGCCCTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATCCCCACCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCATAACCGCATAATAAGGTGAAGCGGATCAGACCTGTCAACAGAACGACAGAAt > 2:559199/1‑150 (MQ=255) tAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGATTTa < 1:697690/150‑1 (MQ=255) tAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTa > 2:700427/1‑150 (MQ=255) aTTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATg < 2:16513/150‑1 (MQ=255) aTTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATg < 2:932923/150‑1 (MQ=255) ttACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGt < 1:1355306/150‑1 (MQ=255) aCGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGttt < 1:2086754/150‑1 (MQ=255) cGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTa > 2:1042239/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCGTGGGTTGTCGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGCATTATGTTTAAAcc > 1:1673484/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCg > 2:2199149/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGTGGGTTGTTGGCGGCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCg < 2:50035/150‑1 (MQ=255) tGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTcc < 2:1254970/150‑1 (MQ=255) gggTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGTGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCt < 1:1552525/150‑1 (MQ=255) gCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCcggc > 1:1081725/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCcggcgg < 2:1674133/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGa > 2:2036142/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGa > 1:1899432/1‑150 (MQ=255) cGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCAGCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAGCTCCTTTCCCCGGCGGGaa > 2:1139264/1‑150 (MQ=255) ggCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGCCCTGTCATCAGAACGAGAGAAGTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAAc > 1:83295/1‑150 (MQ=255) gcgcTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACg < 1:813520/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACg > 1:1913700/1‑150 (MQ=255) gcTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGcg > 1:2066600/1‑149 (MQ=255) cTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTATAGTGGGGGCACTCCCCTACCCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGATTTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTg < 2:937539/150‑1 (MQ=255) ttACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGaa < 1:1276978/150‑1 (MQ=255) aCCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGaata > 2:1047112/1‑148 (MQ=255) aCCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGaaaa < 1:886050/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCCCCCACAGCGCTACAATGCGCGGCCTTAATGTGTGGGCTCTCCCCTATGCGCTTCATCTGGTGAAGCGGTTCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGATTTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCTGCGGGAACGCTGAAAAat < 2:1515585/150‑1 (MQ=255) agCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATg < 1:875309/150‑1 (MQ=255) gCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGc > 1:1638236/1‑150 (MQ=255) cccccACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGCACGGTGAAAAATATGCGt > 2:303746/1‑150 (MQ=255) ccccACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGtt < 1:1384740/150‑1 (MQ=255) cccACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTa > 2:38966/1‑150 (MQ=255) cacaGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACg > 2:979151/1‑150 (MQ=255) caGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCt > 2:817457/1‑150 (MQ=255) gcgcTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGGGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATAATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCttt < 1:960306/150‑1 (MQ=255) cTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGc > 1:1011086/1‑150 (MQ=255) cTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGACATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGc > 2:805376/1‑150 (MQ=255) tACAATGCCCGCCCTTAAAGTTGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCt < 1:1206757/150‑1 (MQ=255) tACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCt > 2:1685118/1‑150 (MQ=255) gggagtGCCCCCACTTTAAGGGCGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCt > 1:1066187/6‑150 (MQ=255) tGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATgg > 1:1803019/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATgg < 1:1889308/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATgg < 2:1221536/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGAGGATCTGACCTGTCTTCAGAACGAGACAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATgg < 1:559199/150‑1 (MQ=255) gcccgcccTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGgc < 1:1491744/150‑1 (MQ=255) gcccgcccTTAAAGGGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGgc < 1:1484307/150‑1 (MQ=255) cgcccTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCa < 2:2114622/150‑1 (MQ=255) cgcccTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCa < 2:1948156/150‑1 (MQ=255) ccTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGAt < 1:1938009/150‑1 (MQ=255) ccTTAAAGTGGGGGCACTCCCCAAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGAt > 1:2042131/1‑150 (MQ=255) ttAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGc < 1:1463609/150‑1 (MQ=255) ttAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCCCTTCATCAGGTGAAGAGGATCTGACCAGACATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTACTTTCCCCGGCGGGAACGCAGAAAAATATGCGTTACTCTATCGCTAATGGCGCAGATGc > 1:605022/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTg > 1:2161313/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAAGATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGctgctg > 2:419799/1‑150 (MQ=255) aGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGtt < 1:483311/150‑1 (MQ=255) aCTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGc < 1:1196336/150‑1 (MQ=255) cTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGcc < 1:252738/150‑1 (MQ=255) cTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGcc > 1:2079107/1‑150 (MQ=255) cTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGcc > 1:1166788/1‑150 (MQ=255) ccTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGcc < 2:1300018/150‑1 (MQ=255) ccTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGcc < 2:1733001/150‑1 (MQ=255) agatccGCTTCACCTGATGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcg > 1:919242/5‑150 (MQ=255) agatccGCTTCACCTGATGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcg > 2:280522/5‑150 (MQ=255) tAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcgc < 2:614839/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCcgcg > 1:1893559/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCAAGCCGCGt > 1:649679/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCATCAGGTGACGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCGGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGtt < 1:854089/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGtt < 2:2178074/150‑1 (MQ=255) cGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGCCCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTATACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTTTCCGGGCACGCGGCGtga > 1:104455/1‑148 (MQ=255) caGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGTTATTCCCTGc > 2:1330890/1‑150 (MQ=255) caGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGTTATTCCCTGc < 2:1081725/150‑1 (MQ=255) aGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGTTATTCCCTGCg < 2:652038/150‑1 (MQ=255) aGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGTTATTCCCTGCg < 1:1685118/150‑1 (MQ=255) | TAAAGCCAATGGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCCTTTCCCCGGCGGGAACGCTGAAAAATATGCGTTACGCTTTCGCTTATGGCGCAGATGCTGTTTATGCGGGCCAGCCGCGTTATTCCCTGCG > NC_000913/2165479‑2165777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |