| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,230,415 | T→A | 5.2% | intergenic (‑30/‑209) | dusC ← / → yohJ | tRNA‑dihydrouridine synthase C/UPF0299 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 2,230,415 | 0 | T | A | 5.2% | 449.6 / 8.4 | 150 | intergenic (‑30/‑209) | dusC/yohJ | tRNA‑dihydrouridine synthase C/UPF0299 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (88/52); new base A (4/4); total (94/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
AGTTGATCCACCACGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAATGTGAT > NC_000913/2230267‑2230564 | gTTGATCCACCACGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGt > 1:2129458/1‑150 (MQ=255) gTTGATCCACCACGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGt > 1:774824/1‑150 (MQ=255) gaaccaccaCGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAg > 1:1382038/4‑150 (MQ=255) gATCCACCACGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTat > 2:729081/1‑149 (MQ=255) aTCCACCACGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACCCGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAgc > 1:1634320/1‑150 (MQ=255) caccacGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGGCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCAcc < 2:1095743/150‑1 (MQ=255) cacGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTAAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCACTCGGTGCCAGTAACACCCGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCAAt > 1:390666/1‑150 (MQ=255) cgcgGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATgg < 2:1889519/150‑1 (MQ=255) 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atcaCCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGGCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGaaaa < 2:2164292/150‑1 (MQ=255) tcccccGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGAGTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTACTGCCGGGGAGCGaaaaa > 1:582468/4‑150 (MQ=255) caCCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGaaaaaa < 1:602057/150‑1 (MQ=255) aCCCGCAAAAATATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAAt < 2:640963/150‑1 (MQ=255) cccGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTTTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATa < 2:316022/150‑1 (MQ=255) cccGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATa > 2:1857223/1‑150 (MQ=255) cAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAgcg < 2:1764548/150‑1 (MQ=255) cAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAgcg > 1:1814779/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaTGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAgcgc > 1:2048631/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCt < 1:1927499/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCt > 1:7950/1‑150 (MQ=255) aaaaTGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGa > 1:488018/1‑150 (MQ=255) aaaaTGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATAACTCTCTATGCTTGATGGATGCCTGAGTTAGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGa > 1:1277115/1‑150 (MQ=255) tGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGAttta > 2:468830/1‑149 (MQ=255) tGAGGCGCTATGCTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGGCTGCAAAGAGCGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTGCGCTGCGCATTGCGCAATGCCGGGGATCGAAAAAATAAGCGCTGATTTc < 2:1766993/150‑1 (MQ=255) ataGGCGCTAACATAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTc > 1:499344/3‑150 (MQ=255) taGGCGCTAACATAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCt > 2:418739/2‑150 (MQ=255) gAGGCTCTATGTTAGCGACTATTGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCt < 2:712800/150‑1 (MQ=255) gAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCt > 2:1843910/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGCATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCt < 2:1012690/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGGCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTTCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCtt < 1:10412/150‑1 (MQ=255) cgcTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGTGCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTTTGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTTAt < 1:1351598/150‑1 (MQ=255) gcTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAAtg < 2:151220/150‑1 (MQ=255) gcTATGTTAGCGCCTATGGGCAGCGGATTAAAGGGCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAAtg < 2:798580/150‑1 (MQ=255) ctttGTTAGCGCCTATTGTGAGCGGATTAAAGGTCTGCCAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCTATCCCTCTCTATGCTTGATGTCTGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGTGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAAtgt < 2:1389619/147‑1 (MQ=255) cTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCTGGGAGCCAAAAAATTAGCGCTGATTTCTTAAtgt > 1:388863/1‑150 (MQ=255) tGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAATGTGAt < 1:2079753/150‑1 (MQ=255) | AGTTGATCCACCACGCGGACAAACTCGGTGATGCACAGATCGTAGTCGTTAACTTCGGTCAGCAATTCACGCACCAGAGAGTCAAGCACTCCCTCCATCGGTGCCAGTAACACACGCATATCATCACCCGCAAAAAAATGAGGCGCTATGTTAGCGCCTATGGTCAGCGGATTAAAGGTCTGCAAAGAGGGATTGCTGCAAACTGCAATCCCTCTCTATGCTTGATGTATGCCTGAGTTCGCTGCGCATTGCGTAATGCCGGGGAGCGAAAAAATAAGCGCTGATTTCTTAATGTGAT > NC_000913/2230267‑2230564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |