| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,507,114 | C→T | 5.4% | A261T (GCC→ACC) | fryC ← | putative enzyme IIC component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,507,114 | 0 | C | T | 5.4% | 416.8 / 7.7 | 129 | A261T (GCC→ACC) | fryC | putative enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/65); new base T (3/4); total (60/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TGAGCGTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACGTAGTA > NC_000913/2506966‑2507258 | tGAGCGTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACATGCGGCt > 2:333961/1‑150 (MQ=255) aGCGTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCttt > 1:1275985/1‑150 (MQ=255) gCGTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGGCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAAAAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTttg < 2:1631978/150‑1 (MQ=255) gTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGCACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTttgtt > 2:2109507/1‑150 (MQ=255) gTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGGCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTttgtt < 1:1941838/150‑1 (MQ=255) ttGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTttgttg < 2:1880384/150‑1 (MQ=255) ttGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTttgttg < 1:718666/150‑1 (MQ=255) tGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGa < 1:2085914/150‑1 (MQ=255) gAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATACCGCTAGCGATAGAACGAGCGGGGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTGTGTTGAt > 1:309619/1‑150 (MQ=255) aaCAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATATCGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTCTTGaac > 1:2050929/1‑148 (MQ=255) aaCAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAGCCGCAGGTTttgttgcct < 2:2065715/150‑4 (MQ=255) aaCAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATc < 2:908618/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCgg > 2:1763444/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTAGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGc > 1:1342548/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTAAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGc > 1:209760/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGccacca < 1:752628/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAg > 2:1038772/1‑150 (MQ=255) ccGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAgg > 2:929156/1‑150 (MQ=255) aaaCGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGAtt > 1:1523017/1‑150 (MQ=255) aaCGACGGTCGATTATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGGGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTTAATCTGAAGTCAACATAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTg < 2:1945839/150‑1 (MQ=255) aaCGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTg > 2:1561437/1‑150 (MQ=255) aaCGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCACAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTg > 1:551563/1‑150 (MQ=255) acgacgGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACGAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTTGTCTGTGGTAAAGCTGAAGGCAACATTACCTGCGGCTTGGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGc < 2:306394/150‑1 (MQ=255) acgacgGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGc < 1:2201552/150‑1 (MQ=255) acgacgGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGc < 1:1616806/150‑1 (MQ=255) gacgGTCGCTAATGGGCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGCATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTg < 1:1393120/150‑1 (MQ=255) gacgGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTg < 2:2086273/150‑1 (MQ=255) acgGTCGATAATGGTAGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGt > 1:134081/1‑150 (MQ=255) ggTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATACCGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTcg < 2:85218/150‑1 (MQ=255) gTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGAAAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTTGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTTCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTcgc < 1:1317562/150‑1 (MQ=255) aTAATGGTCTCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCcgcg < 2:1414094/150‑1 (MQ=255) aaTGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCgcggc < 2:1751879/150‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGCACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCgcggcg > 1:1485862/1‑150 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCgcggcg < 1:1524055/150‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCgcggcg > 1:662915/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGGCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAACGGCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATcc > 1:384868/1‑150 (MQ=255) gcGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATACAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATcc < 1:1880164/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGCAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCGTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCa > 1:469206/1‑150 (MQ=255) cccAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCg > 2:745905/1‑150 (MQ=255) ccAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTGTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGCTCCCCATTGCGt > 1:1974858/1‑150 (MQ=255) cAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTa > 2:1516380/1‑150 (MQ=255) aGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTAc < 2:1015812/150‑1 (MQ=255) aGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTAc < 2:2162235/150‑1 (MQ=255) aGAACAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGAGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGGCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTAc < 2:1392507/150‑1 (MQ=255) gcccAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACa < 1:1375038/148‑1 (MQ=255) ccAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATc > 2:64427/1‑150 (MQ=255) aaTCGGCGGAATTACGATAGCGATATAACGAGCGGTGACCGGTAATTCGTGGTCAGTGGTAAAGCTGTAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAg < 1:857495/150‑1 (MQ=255) gcggAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAgcgcgc > 1:1892394/1‑150 (MQ=255) cggAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGcc > 1:1688632/1‑150 (MQ=255) ggAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGccc < 1:859769/150‑1 (MQ=255) tAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTtct < 2:134081/150‑1 (MQ=255) tAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTtct > 1:829941/1‑150 (MQ=255) aaaCGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATATGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTtct < 2:1636775/149‑1 (MQ=255) aaCGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTtctc > 2:1039748/1‑150 (MQ=255) aCGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCCCCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCa > 2:592225/1‑150 (MQ=255) cgatagcgatagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCAc > 1:1946338/1‑150 (MQ=255) gatagcgatagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCAcc < 1:226353/150‑1 (MQ=255) gatagcgatagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCAcc < 2:2119328/150‑1 (MQ=255) agcgatagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGc < 2:2102876/150‑1 (MQ=255) cgatagAACGAGCGGGGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCGTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCgg < 1:927246/150‑1 (MQ=255) gatagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGc < 1:1038772/150‑1 (MQ=255) atagAACGAGCGGTGACCGGTATTACGTGGTCAGTGGTAACGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCa < 1:499189/150‑1 (MQ=255) atagAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGGCAGTGGGAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCa < 2:924403/150‑1 (MQ=255) agAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGt < 2:2034212/150‑1 (MQ=255) gAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTc < 2:1548827/150‑1 (MQ=255) aaCGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCa < 2:20539/150‑1 (MQ=255) cGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGc > 1:497500/1‑150 (MQ=255) gTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTa > 1:2149379/1‑150 (MQ=255) gACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGACGGCAACAAAACCTGCGGCGTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACg < 1:1098192/150‑1 (MQ=255) gACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACg > 1:462514/1‑150 (MQ=255) ggTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATa > 1:1735340/1‑150 (MQ=255) tAATACGTGGTCAGTGGTAAAGATGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGGCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATAcc < 1:1387462/150‑1 (MQ=255) cGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGt > 2:868006/1‑150 (MQ=255) cGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGt > 2:1149772/1‑150 (MQ=255) tcgTCAGTGGTACAGCTGAAGGCCACACAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCAATGCGTCCATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTg < 2:1374195/148‑1 (MQ=255) cAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGGCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATcc < 2:1473932/150‑1 (MQ=255) ggTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGcc < 1:2067598/150‑1 (MQ=255) tAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGccac > 1:2075972/1‑150 (MQ=255) aaaGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGccacc < 1:1516583/150‑1 (MQ=255) aaaGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGccacc > 1:721995/1‑150 (MQ=255) aaGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGccacca < 1:2108432/150‑1 (MQ=255) gCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCaaa > 2:974359/1‑150 (MQ=255) cccgatcaacaaAGCCGCAGGTTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAgg > 2:2203344/7‑150 (MQ=255) cgatcaacaaAGCCGCAGGTTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCCCCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAgggg > 2:1517423/5‑150 (MQ=255) gCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGtg > 2:1894582/1‑150 (MQ=255) caacaaAGCCGCAGGTTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGACCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGtga > 2:1695391/1‑150 (MQ=255) caacaaAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATGCAGCCACCAAAGGGGGtga > 2:293694/1‑150 (MQ=255) caacaaAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACAGCCGTTGATACAGCCACCAAAGGGGGtga > 1:592065/1‑150 (MQ=255) caacaaAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGGCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCCGCACAGTACGGATACCGCCGTTGCTCCAGCCACCAAAGGGGGtga > 1:406553/1‑150 (MQ=255) aacaaAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGtgat > 2:1733896/1‑150 (MQ=255) acaaAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGtgatg < 1:1578029/150‑1 (MQ=255) aaaaCCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCACCCACCAAAGGGGGggatgcc > 1:1124023/1‑148 (MQ=255) aaaCCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGCTCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACg > 1:1148915/1‑150 (MQ=255) aaaCCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACg < 1:1763444/150‑1 (MQ=255) aaaCCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACg > 1:1173096/1‑150 (MQ=255) acccTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCAGGCGCCGCGGCGATCGCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACgt < 1:333961/148‑1 (MQ=255) cTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACgtagt > 2:134152/1‑150 (MQ=255) tGCGGCTTTGTTGATCGGTCCACCAAGGTCTATTGCTGGCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACgtagta < 2:2078417/150‑1 (MQ=255) tGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACgtagta < 2:686444/150‑1 (MQ=255) ggcggcgTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGGCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACgtagta < 1:1473547/149‑1 (MQ=255) | TGAGCGTTGAACAGGCGTTTGCCGGTTAAACGACGGTCGATAATGGTCGCCAGCCCCAGACCAATCGGCGGAATAACGATAGCGATAGAACGAGCGGTGACCGGTAATACGTGGTCAGTGGTAAAGCTGAAGGCAACAAAACCTGCGGCTTTGTTGATCGGGCCACCAAGGTCGATTGCTGTCGCCGCGGCGATCCCCATTGCGTACATCAGCGCGCCCTTCTCACCTGCGGCAGTCAGCACAGTACGGATACCGCCGTTGATCCAGCCACCAAAGGGGGTGATGACGTAGTA > NC_000913/2506966‑2507258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |