| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,512,728 | C→A | 6.0% | intergenic (‑22/‑314) | mntH ← / → nupC | manganese/divalent cation transporter/nucleoside (except guanosine) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,512,728 | 0 | C | A | 6.0% | 390.5 / 9.0 | 137 | intergenic (‑22/‑314) | mntH/nupC | manganese/divalent cation transporter/nucleoside (except guanosine) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (77/51); new base A (5/4); total (82/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GAATATTGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACA > NC_000913/2512580‑2512877 | atatTGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACGCTCAACGCGATAGTTCGGCATCTTGTGCCTCTAAACCATAGCCttt > 1:1646308/1‑150 (MQ=255) atTGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGc < 1:1617263/150‑1 (MQ=255) ttGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCCACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCt > 1:427542/1‑150 (MQ=255) ggTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTAt < 1:867797/150‑1 (MQ=255) gTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATg > 1:359632/1‑150 (MQ=255) gTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATg > 2:1417226/1‑150 (MQ=255) tCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGt > 2:1845536/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGTTACCGGGATAGATATAACCAATCACCGCAATGAACGCAGGGCCCATTAATGCGCGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGtt < 2:92594/150‑1 (MQ=255) gCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGttt < 1:478831/150‑1 (MQ=255) aaGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCAAAGGCTATGttttag < 2:330998/150‑4 (MQ=255) aGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATg < 1:233501/150‑1 (MQ=255) gTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCACCGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCAAAGGCTATGttttagag < 1:2141561/150‑6 (MQ=255) gTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGc > 2:1825986/1‑150 (MQ=255) actgtaTCGATATAACCAATCGCCGAAATGAACGCAGGAACCATTACTGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCTGTTATACTCTCAACGCGCTAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATg < 2:1048412/145‑1 (MQ=255) aTCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTTCTCTCACCGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTTCTATGTGTCATGCTATGCCaaa > 2:124028/1‑150 (MQ=255) gATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACga > 2:857054/1‑150 (MQ=255) gATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACga > 1:2043005/1‑150 (MQ=255) gATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCAGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTGTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgc > 1:1134226/1‑149 (MQ=255) atatAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgag < 1:1253369/150‑1 (MQ=255) atatAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgag > 2:632928/1‑150 (MQ=255) atatAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgag > 1:2017114/1‑150 (MQ=255) atatAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCATTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACgag > 2:1008947/1‑150 (MQ=255) ataACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCTAGCCTCATCTTGCGCGACGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTTAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAATCGAGaa < 1:1269433/150‑1 (MQ=255) taACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAAt < 1:175586/150‑1 (MQ=255) ccAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGAt < 1:23301/150‑1 (MQ=255) cAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGAtt > 1:538551/1‑150 (MQ=255) cAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCATCATCTTGCGCGACGCCCGTCCGCTGGTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGAtt < 1:1420520/150‑1 (MQ=255) aaTCGCCGCAATGATCGCAGGTGCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATTCTATGCCAAACGAGAATGATTa < 1:559926/150‑1 (MQ=255) aaTCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTCGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCCTGCTATGCCAAACGAGAATGATTa > 2:1161873/1‑150 (MQ=255) gccgcAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCaa > 1:2090402/1‑150 (MQ=255) aaTGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCa > 1:1912583/1‑150 (MQ=255) tGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCAtt > 2:20359/1‑150 (MQ=255) tGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCAtt < 2:1931618/150‑1 (MQ=255) gAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCAttt > 1:448657/1‑150 (MQ=255) gAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCAttt > 1:153639/1‑150 (MQ=255) tcAGGTACCATTAATGCGAGCCTTATCTTGCGCTCCGCCCGTCATCTTCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTTCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTAATGCTATGCCAAACGATAATGATTATCAAATTCATTTAAAt < 2:80056/149‑1 (MQ=255) cAGGTCCCATTAATGCTAGCCTCATCTTGCGCGACGCACGTCCGCTGCTACTCTCACCGCGATAGTTCGGAATATTGTGCCTCTATAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGGCACACGAGAATGATTTTGATAATCAttatcgtt < 2:541574/150‑7 (MQ=255) cAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATg < 2:153639/150‑1 (MQ=255) cAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATg < 2:448657/150‑1 (MQ=255) gTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTATCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGAt > 1:890916/1‑150 (MQ=255) cccATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATtg > 1:1028776/1‑150 (MQ=255) cccATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATtg > 1:427298/1‑150 (MQ=255) cATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATtgtg > 1:705111/1‑150 (MQ=255) aTTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATATTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTgtgg < 2:1206601/150‑1 (MQ=255) ttAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTgtggt < 2:170400/150‑1 (MQ=255) aaTGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGa > 1:961829/1‑150 (MQ=255) gCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGAttt > 2:1421339/1‑150 (MQ=255) aGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATTATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTtctc < 1:597955/150‑1 (MQ=255) gCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTGTGCTATGTTTCCTGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTctct > 1:1335390/1‑150 (MQ=255) cATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATATTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATa < 2:1912583/150‑1 (MQ=255) aTCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATat > 2:1250326/1‑149 (MQ=255) aTCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAg > 2:493383/1‑150 (MQ=255) aTCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCACAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATATCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGACAg < 2:1397697/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGAc > 2:1862595/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGAc > 2:231277/1‑150 (MQ=255) tGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCa > 1:1795946/1‑150 (MQ=255) gcggcgCCCGTCCGCTGCTAATCTCATCGCGATATTTCGTCATCTTGTGCCTCTATAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCGAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGa < 1:1295933/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGa < 2:245998/150‑1 (MQ=255) gccgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGAtt > 2:492962/1‑150 (MQ=255) ccgccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTAGGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTa > 1:1419566/1‑150 (MQ=255) cgccCGTCCGCAGCTACTCTCAACACGATAGTTCGTCATCTTCTGCCTCTAAAACAAAGCCTTTGCTATGTTACATGCTAAGCCAAACGAGAAAGATTATCAAATAAAAATAAATGGATTGTGGTGATTTCTAAGATAGACCAGtattat > 1:421792/1‑150 (MQ=255) gccCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATg < 2:529544/150‑1 (MQ=255) cccGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGa > 2:1351532/1‑150 (MQ=255) gTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTa > 2:592750/1‑150 (MQ=255) tgctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGaaaa > 2:1485382/1‑150 (MQ=255) gctACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAACACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTAATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACAAGGATTATGACTCCGAAAAg > 2:362174/1‑150 (MQ=255) ctctCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATtg > 2:682555/1‑150 (MQ=255) ctcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATtgat > 1:334013/1‑150 (MQ=255) ctcAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCAATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGAAATCCCAGGATTATGACTACGAAAAGATtgat > 1:1411946/1‑150 (MQ=255) aaCGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGAc > 2:190811/1‑150 (MQ=255) aaCGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTATGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGAc > 1:1724293/1‑150 (MQ=255) aCGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACt < 1:544290/150‑1 (MQ=255) gATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGaa < 2:1535050/150‑1 (MQ=255) tAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAAGATAGGCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATg < 2:1701346/150‑1 (MQ=255) aGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgt > 1:328874/1‑150 (MQ=255) ttCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTCTGGTGATTTATCTGATAGACAAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATAACTTGAATgtta > 2:130074/1‑150 (MQ=255) cGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatg > 2:809812/1‑150 (MQ=255) tCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggt > 1:692824/1‑150 (MQ=255) tCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACAAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggt > 1:2110467/1‑150 (MQ=255) tCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATgttatggttat > 1:175553/1‑150 (MQ=255) ttGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGt < 1:1845536/150‑1 (MQ=255) gtgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGttt > 2:948073/1‑150 (MQ=255) gtgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGttt < 1:2178200/150‑1 (MQ=255) gtgCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGttt > 2:2201395/1‑150 (MQ=255) gCCTCTAAAACATAGCCTTTTCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTaa < 1:124028/150‑1 (MQ=255) ccTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAAt < 1:1177662/150‑1 (MQ=255) ccTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAAt < 1:632928/150‑1 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATg > 1:1751472/1‑150 (MQ=255) ctctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAAGGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAAtt > 1:1482187/1‑149 (MQ=255) acatgaaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATg > 1:1433795/6‑150 (MQ=255) catgaaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGt > 1:1615281/5‑150 (MQ=255) catgaaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGt > 1:1036919/5‑150 (MQ=255) catgaaaCATAGCAAAGGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGt > 2:703496/5‑150 (MQ=255) ctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGtt < 2:538551/150‑1 (MQ=255) ctAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGtt < 1:654648/150‑1 (MQ=255) aaaCATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGc < 2:654577/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACAttt > 1:1863466/2‑150 (MQ=255) gCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTa < 2:1028776/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTAc > 1:116118/1‑150 (MQ=255) cTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACa > 1:1949906/1‑150 (MQ=255) | GAATATTGGTCGCAAAGTTACCGGGATCGATATAACCAATCGCCGCAATGAACGCAGGTCCCATTAATGCGAGCCTCATCTTGCGCGCCGCCCGTCCGCTGCTACTCTCAACGCGATAGTTCGTCATCTTGTGCCTCTAAAACATAGCCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGATTGTGGTGATTTCTCTGATAGACCAGGATTATGACTACGAAAAGATTGATGACTTGAATGTTATGGTTATGTTTAATGTTAGCACATTTACA > NC_000913/2512580‑2512877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |