Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,555,201 | 0 | T | C | 5.6% | 362.0 / 7.7 | 127 | intergenic (‑19/+27) | eutR/eutK | eut operon transcriptional activator, AraC family/putative ethanol utilization carboxysome structural protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/56); new base C (4/3); total (64/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GCATGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGC > NC_000913/2555052‑2555350 | gCATGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGtgtt > 2:1479816/1‑150 (MQ=255) tGTTCATAGACTTCCGTTGTGTGTCGTTGATGAACATTATGCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTATGGGTGCATGATAAATATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTa < 1:419643/150‑1 (MQ=255) ttCATAGCCTTCCGTTGTCTGTCGTGTATGAACATTATCCACTTCGACGATCGGGGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGCTAATGTTGGGGCATATTGGCTGTCCGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAgg < 1:1171103/150‑1 (MQ=255) 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tAATGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTAGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAg > 2:183156/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGGTGTTGTCGTAAACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGcc < 2:1981953/149‑1 (MQ=255) aTGCCGGGTGTTGTAGGACCCCCGGCACCTCCGACCGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGcc < 2:235244/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGGGGGAGTAGGCCACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGCGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGcc < 1:227761/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGACCCGGCAGAAAAGAGATGTTCGAGCGCATTTCTCGCTTTTTCAAGCGGCCAGCCAAAGAGGGCAGCCa > 1:285203/1‑150 (MQ=255) gCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGGAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCAc < 1:338980/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCAc > 1:1630563/1‑150 (MQ=255) gCCGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCAc > 2:1273881/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt > 1:1505569/1‑150 (MQ=255) cGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACtt > 1:1961703/1‑150 (MQ=255) tgttgtAGGACACCCGGCACCTCCGACACGTTAATGGGGCTTGAGACGATACCGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTATTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTcc < 2:447030/150‑1 (MQ=255) tgtAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGCAAAGAGCTGGTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTACAGCGGCCCGCCAAAGTGGGCCGCCCCTTCTCCTGc > 1:1936903/1‑150 (MQ=255) | GCATGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGC > NC_000913/2555052‑2555350 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |