| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,560,996 | G→T | 21.6% | intergenic (+98/‑372) | yffL → / → yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,560,996 | 0 | G | T | 21.6% | 112.8 / 7.7 | 70 | intergenic (+98/‑372) | yffL/yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/28); new base T (7/10); total (31/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGC > NC_000913/2560849‑2561143 | gggAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGTAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTGCGGCCTTTTCTTTGACTTATTTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCCTTTGTGGTGGNTCAAAAGNTGCCttt > 1:1668906/1‑150 (MQ=255)gggAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAATTTGACGtt > 1:1677976/1‑150 (MQ=255) ggAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGGGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 2:1131941/150‑1 (MQ=255) ggAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGATCCCGCCGTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 2:66225/150‑1 (MQ=255) ggAGTGCAAAGAATACCAGTTATTAATCAAGCCGTACAACATGAACTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGACTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGGGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 2:1178756/150‑1 (MQ=255) gTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg < 2:776319/150‑1 (MQ=255) gCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGTTTGGTAAAAATTTGCCTTTaatgag > 2:269156/1‑146 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGGTAGTGGTGGGTCAAAAGGTGCCGTTAAgggggg < 2:1973263/150‑1 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATAATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCACCCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTGTTTGCCTTAATTCCATGACTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg < 2:306783/150‑1 (MQ=255) cGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTAGACGTTAAGgtgtgta > 2:1022898/1‑149 (MQ=255) tACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 2:2070679/150‑1 (MQ=255) tACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 1:1882480/150‑1 (MQ=255) gTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCCGGCGTTCAATTTTACCTCCTTTTCTTTGCCTAAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAATTTGACTTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:2176801/150‑1 (MQ=255) tattatTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 2:1041847/150‑1 (MQ=255) ttattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt < 1:780142/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTCTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTATAGGAGGGTCAAAAGTTTACGGTAAggg > 2:708450/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCAGCCTTTTCTTTGACTTAATACCATGAATTCACGTGGGTCAAAAGTTGCCGTAAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTATAAGTTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGt > 1:381228/1‑150 (MQ=255) cGTACAACATGAAATAACGGAAACAGGCGTGCAATTTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGGGGGTCAAAAGATGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc < 1:177380/150‑1 (MQ=38) caacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGCCGTGAAGGTGGGTCaaat > 2:1916669/1‑149 (MQ=255) tGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGACGTTAAGGTGTCTCAAAAGTTTACGATAACGTGTGTCaaaattaga > 2:380102/1‑145 (MQ=255) gAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 1:750791/150‑1 (MQ=255) gAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTAAAAATTTGCCTTTAAGGTGTGTCAAAATTTGAATTTAAGGTGTGTCTAAATTTgaa > 2:1840783/1‑148 (MQ=255) aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCATTTAAGGAGAGTCAAAATTTGAAGTTAACGTGGCGCAAAATTTgaag > 2:2176023/1‑147 (MQ=255) ttAACTGAATCAGGCGGGCAATGTTGCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAg < 1:1540043/149‑1 (MQ=255) aTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCAGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGAGTGTCAAAAGTTACCGTTAAGGTGGCTCAAAAGTTgaaaag > 2:1492644/1‑145 (MQ=38) tAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGTGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGACGAGt > 2:1909441/1‑150 (MQ=255) cGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGCCGAGTAAg > 2:795137/1‑150 (MQ=255) cGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAg < 1:1723439/150‑1 (MQ=255) acAGTCGTGCACTCTTCTCGCCTTGATTTTGCCTTAATTACATGAAGTCAGGATGGTACAAAGTTGCCCTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCCAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTc < 1:294268/149‑1 (MQ=21) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAATGTTGCCGAGTAAGAATTcta > 1:1750503/1‑150 (MQ=255) gtcGGGCAATGATCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGTTGGGTCAAAAGTAGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctac < 1:1835102/148‑1 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTAAAAATTTGCCTTTAAGGAGCGTCAAAATTTGAAGAAAAGGTGGCGCAAAATTTGCCGCGAAAGAATTgtaa > 2:1618148/1‑149 (MQ=25) ggCAATCATCCCGCCTTTTCTTTTCCATAATTCCATGAATTCCGGTGGGTCAAAAGTAGGCGTTAGTGGGGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAtt < 1:2159610/150‑1 (MQ=37) aaTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAATTTGAAGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGAAGAGTAAGAATTATACTATTaaa > 2:1850021/1‑149 (MQ=37) gTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGTTATGGTGGGTCTAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTTTTAAGAAt > 1:1157992/1‑150 (MQ=255) tcaagacTTTTTTTTTCCATAAATAAATGAATTCATGTGGGTGAATAGTTGGCGTTTATTGTGGGTAATAAGTTGCCTTTAAGTTGGGTAAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc < 1:1295425/144‑1 (MQ=19) ccGTCTTTTATTTTCCTTAATTACATGAATTCATTGTTCTTAAAAGTTGCCGTTAGTGGGGGGTATAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 2:1994331/150‑1 (MQ=25) cGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAg > 1:503314/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTCAAAATTAGCCTTAAAGGAGTGTCAAAATTTGACGTAAAGGTGGGTCAAAAGTTGACTCGTAAGAATTGTAAAATAAATAATTATATGCGACggc > 2:1995224/1‑149 (MQ=255) tGCCTTAAATCCATGAATACCGTCTGGTCAAAATTTCCCTTTCGTGGGGGGTCAAAAGCCGCCGTTTAGGTGGCTAAAAAGTTGCCCTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGt < 1:2126743/150‑1 (MQ=25) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAGTGGAGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGAGTGTGAAAATTTGAAGAAAAGCGGGGGGAAAATTTGACTAGTAAGAATTAAACAAGTAAGAATACTAGGCGACGGGATTTTTTTAgagtt > 2:1939208/1‑146 (MQ=255) ggAATTCCGGTGGGTCAAAAGTCGGCGTTAGTGGTGGCTCAATAGTAGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTccc < 1:1150031/149‑1 (MQ=38) ctggggggTAAAAAGGAGCCCTTTGTGGTGGGTCAAATGTAGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggtcgg < 1:909449/145‑1 (MQ=37) gggTCAAAAGTCGCCGTTATTGGGGGGTAAAAAGCTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATa < 1:846233/150‑1 (MQ=38) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTATAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGAAGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTATGCTACGGGAGATTTTTATCCTAAAGGTCGGTCATaga > 2:1428873/1‑150 (MQ=25) aaaaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGTTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagagag < 2:2010035/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTTAGTGGGGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGcc < 1:1022898/150‑1 (MQ=255) tggcGTTATTGTTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt < 1:1994398/147‑1 (MQ=255) tGCCTTTAGTGGTGGGTAAAAACATGCCGTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt < 2:1663097/150‑1 (MQ=38) gCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTa > 1:1721888/1‑150 (MQ=255) gTTAGTGGGGGCGCAAAACATGCCCTTAAGTTCGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACAATTAAGACTTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTagag < 1:69311/150‑1 (MQ=255) tAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGTTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGtt > 2:1855948/1‑150 (MQ=255) atttgtggGTCAAAACTTGCCTTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa < 2:1126872/146‑1 (MQ=255) aGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGTGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa < 1:995642/150‑1 (MQ=255) gtggggTCAATACTAGCCGTTACGGTGGTGAAATCGTCGCCGTTCAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCAAGGCGACGGGATTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 2:1844096/147‑1 (MQ=255) ggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGATTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCTTAGAGAGTCGCCTAGAGTTATAc > 1:325089/1‑150 (MQ=255) ggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGCAGTATTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc > 2:1310903/1‑150 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAAGTCGACTAGTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGGCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACcga > 1:93008/1‑150 (MQ=38) ggTCAAAAGTCGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaa < 1:874426/150‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaag > 1:126809/1‑150 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAgaagaa > 2:488788/1‑150 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAgaagaa > 1:1652055/1‑150 (MQ=255) tttgTTTCCTTTTAGTTGGGTCAATTGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAatt < 2:159384/147‑1 (MQ=255) atgTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAatta < 2:1239824/148‑1 (MQ=255) aaGGTGCCTTTAAGGTGGTTCAAAAGTAGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAATAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAatta < 1:1065583/150‑1 (MQ=39) atttGCCTTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAattat < 2:1650567/148‑1 (MQ=255) tGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTc > 1:574521/1‑150 (MQ=255) gacGTTAAGTTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcg < 1:1388866/148‑1 (MQ=255) gCCTTTACGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcg < 1:251607/150‑1 (MQ=255) ccGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgc > 1:1578287/1‑150 (MQ=255) ccGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTcgc > 1:1162617/1‑150 (MQ=255) | GGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGC > NC_000913/2560849‑2561143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |