Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 935,584 | A→T | 12.5% | P787P (CCA→CCT) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 935,584 | 0 | A | T | 12.5% | 119.2 / 3.8 | 69 | P787P (CCA→CCT) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/20); new base T (3/6); total (42/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.38e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACCGA > NC_000913/935435‑935732 | ccTGGACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCca < 1:1518297/150‑1 (MQ=255) tGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCcaca < 2:991754/150‑1 (MQ=255) tGTACAGCAGCCGCAACAACCGGATGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCcaca < 1:36339/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGCTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCAcagca < 2:1071199/150‑1 (MQ=255) caccacccGCAACACCCGGATGCACCGCAGCAGCAAGAGCACCAGCCGCACCAACCACGTCCGCCGCAGCCGCAGTCTCAGCAGCCACAACAGCCGCTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCAcagcag < 1:348754/144‑1 (MQ=21) agcagcCGCATGATCCGTTTGCAGGGCAGGAGCATTATCAGCAGCCTCATCAACATCTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACACCAGCCGGTTGCTCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACagcagc < 2:132121/150‑1 (MQ=18) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACagtagc < 1:17568/150‑1 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACACTATCAGCAGCCGCAACAACCGGATGCGCCCCCgcagca > 1:28658/1‑150 (MQ=255) atacGCATCATCCGTTTGCTCTGCTGCAGGATTATCATCAGCATCAACAAATATATCCGCAGCAGGATGATTTTCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCATCCACAATTTCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAat < 2:71448/147‑1 (MQ=12) gcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCCGCCACCACAGCCCGTTGCGCCGCAGCCACTTGATCAGCGGAAGCCGCCAGCGGGTGCGCCAcagcagggggg > 1:1293009/1‑145 (MQ=17) gcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCAAGATCAGCAGCAGCCACACCCGGTTGCGCCACACCAGCaaga > 1:1009478/1‑148 (MQ=21) cGCAACAACCGGTTGCAGCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCCACAACCATATCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCTGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATc < 2:1794030/150‑1 (MQ=21) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATc < 2:12771/150‑1 (MQ=255) acaacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAAGAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATcagca < 1:495552/150‑1 (MQ=255) acaacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACCGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCACTATCCGCAGCCGCAACACCCGGTTGCGCCACAGCCGCAAAATccgcc > 2:2001324/1‑149 (MQ=18) cACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCAACAACAGCCGGTTGCGCCTCATCCCCAATATCAGCAGCAGCAACAGCCGGTTGAGCGAAATCAGCAATAACAGCTGAAGcaacagc > 2:2068221/1‑148 (MQ=18) cACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCAACAACAGCCGGTTGCGCCTCATCCACACTATCCGCAGCAGCATAAACCGGATACGCCGCAGCCGGAAGTTCAGCAGCTGCaaccac > 2:2154489/1‑150 (MQ=18) gcagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACCGCCGGTTGCGCCGCATCACCAATATCCGCAGCATCAAAAACCGGTGGCGCCACAGCAGCAAAATCAGAAGCAGccacccccgac > 2:1584846/1‑143 (MQ=18) agcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTg > 1:1262645/1‑150 (MQ=255) caATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGCTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGcgccg < 1:1870549/150‑1 (MQ=255) atatCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCAATATCAGCAGCAGCAACCACCGGTTGCGCCACAGCAGCAAAAACAGCAGCAGCAACAACCGCATACGCCgca > 1:1780976/1‑150 (MQ=25) ctcaacaaCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATc < 1:1653699/148‑1 (MQ=255) ggctcaacCTCTTCCGCCGGAGCAGCAGTATCATCACCAACCTCAGCTGTATGCGTTGCAGGAACATTATCAGCAGCAGCAACATCCTTTTGCGCCACAGCACCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATca < 2:222647/146‑1 (MQ=12) catcaacCACATCCGCCGCAGCCGCAGTATCATCAGCCACCTCATCAGTTTGCGCCGCAGCCACAATCTCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATcag < 1:1744791/147‑1 (MQ=21) caacaaCCTCATCCGCCGCAGCCGCAGGATCAGCAGCCACCACAGCCGTTTGCGACGCAGCAACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATcag < 1:1736093/150‑1 (MQ=21) caacCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCAATATCAGCAGCATCAACACCCGGTTCAGCCTAAGCGCGACAATCGGCCGAGGCATCAACCGGGGGCGCCGCAGCAGAAGGAGcagaag > 2:1202675/1‑150 (MQ=16) acCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCGACAGCTGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGcc > 1:999118/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACACCCGGTTGCGCCACATCACCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGATGCGCCGCAGCCGCCGGATCAGCAGccgc > 2:1289663/1‑148 (MQ=18) gTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAACCCCAGTATCCGCAGCCGCAACCCCAGGTTGCGCCTAAGCACCACAAACAGCCGCAGCAACAACCGCTTACGCCGCAGCCTCAGAagcagcagcagcca > 2:793340/1‑145 (MQ=16) tCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTTGCAGCAGCCacaacc > 1:708729/1‑149 (MQ=255) cgcagccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAg > 1:706554/1‑150 (MQ=255) cgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCCGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTgcgc > 2:706637/1‑150 (MQ=255) cgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCAGCAACAACAGGTTGAGCCACAGCCGGAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGATGCGCCGCAGCCGAAGAATCATCAGCCGCCACAGCCAGTTgcgc > 2:626991/1‑150 (MQ=18) gcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACTGGCTGTTgtggc < 2:1948874/150‑5 (MQ=255) tCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAAcc < 1:1962788/150‑1 (MQ=255) agcagcCACAACCGCCGGGTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTCCGCCACAGCCCCAATAACAAAAGGCGCCTCAACCGGTTGCGCCGCAGCAGGATGATCAGCATCCGCACCAGCCTGTGACGCCTCAACAGc > 2:888290/1‑150 (MQ=12) agcagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCTCAACAACAGGTTGCGCCTAAGCAGCAAAATCAGCAGACGCAACAACCGTATGCGCCGCAGCCGAAGAATCAGAAGCACCCACAGCCAGTTACGCAACAACAGc > 2:1172411/1‑150 (MQ=255) tgagcCAGAACACCCGGATGCGCTGCTGGCTCAATATCAGCAGCCGCAACAACCTTTTGCGCCTCAGCAGCAATATAAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCa < 2:1022703/148‑1 (MQ=18) gcagcCACAACAGCCTGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATAACAGCAGCCGCATCAACCGGTTGCGCCGAAGCATCAGAAAAAGCAGCCACAACAGCCAGATGCGCACCAACCGCa > 2:1451860/1‑150 (MQ=21) gcagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCa > 2:1230771/1‑150 (MQ=255) ccACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACCGCCAGTTGCGCCACAACCGCCGGAt > 1:2210206/1‑150 (MQ=255) cacaACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCCGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGTTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCCGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCCCACCCGCAggctc > 2:1070265/1‑147 (MQ=18) aGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCCGCCACATCAGCCAGTTGCGCCCCAACCGCAGGATACCCTGc > 2:66405/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGc < 1:681865/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCt > 2:603559/1‑150 (MQ=255) tgTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGACGAAACAACCGGTTGCGCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCa < 2:28658/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCa > 1:700605/1‑150 (MQ=255) gccgcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCt > 2:666674/1‑150 (MQ=255) gcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGtt > 2:1650114/1‑150 (MQ=255) aGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGa < 1:1983583/150‑1 (MQ=255) ccACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATg < 1:1243920/150‑1 (MQ=255) ccACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATg > 2:387417/1‑150 (MQ=255) aaTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCCGGATCCCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTa > 2:1807063/1‑150 (MQ=255) accgcagcCGCAACAACCTGTTGCTCATCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATgg < 2:1480060/147‑1 (MQ=25) cagcagCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACCACAGCCAGTTGCGCCACCACCGCAGGATACACTGCTTCATCCGCGGTTGAGGAGAAATGGc > 1:261028/1‑150 (MQ=21) agcagcCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCg > 2:1648206/1‑150 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCg > 1:1264720/1‑150 (MQ=255) cagcCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCCGCAGCAGTATCAGCCGCCACCACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCGGCATCCGCTGTTGATGCTTAATGGCGAc > 1:1085883/1‑150 (MQ=25) cagcCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCCTCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGAc > 1:1092941/1‑150 (MQ=255) gcCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGAAGCAATATCCGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTATTGTTGCGTAATGGCGACAg > 2:1355029/1‑150 (MQ=255) actcaacaaCCGGTTGCTCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGc < 1:1575510/147‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGcc > 1:941633/1‑150 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGccg > 1:1813294/1‑150 (MQ=255) caacaaCCGGTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGccgt < 1:2068221/150‑1 (MQ=255) aaacCTGTAGCGCCCGCGCAGCTATATCCCCATCCGCATCCACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGccgtccg < 1:1550639/149‑1 (MQ=37) ccGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCCGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTg > 2:987855/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTg < 2:1262645/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGCCTCATCAGAAATATCAGCAGCCGCATCAACCTGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCa < 2:1840938/150‑1 (MQ=37) ggTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACTGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCa > 2:585402/1‑150 (MQ=255) gTTGCTCCTGAGCATCAATTTCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCAt < 2:576158/150‑1 (MQ=37) cgcCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAAc > 1:725674/1‑150 (MQ=255) ccACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATCCCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACcg > 2:207486/1‑150 (MQ=255) cacaGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACcgc > 1:1237143/1‑149 (MQ=255) cacaGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGATGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACcga > 1:480405/1‑150 (MQ=255) | CCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACCGA > NC_000913/935435‑935732 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |