| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2900306 = | 139 (1.160) | 7 (0.070) | 7/164 | 12.7 | 5.7% | intergenic (‑33/‑286) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 2900346 = | 114 (1.140) | intergenic (‑73/‑246) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2900419‑2900306‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaagttacctttctCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTA > NC_000913/2900346‑2900443 TCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGG > 2:812639/1‑99TCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGG < 1:380086/99‑1TCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGG > 1:1855634/1‑99TCACACTGTGATTACGATCACAGTAGCAGTTATGCACTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGG < 2:689554/99‑1 CACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGG < 1:2337939/99‑1 CACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGA > 1:1460569/1‑99 ACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAA < 2:1217130/99‑1 ACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAA < 2:2871213/99‑1 ACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAA < 1:1351643/99‑1 CTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAG < 1:2633321/99‑1 CTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAG < 2:627771/99‑1 CTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAG < 2:628652/99‑1 CTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAG < 2:628822/99‑1 TGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGT < 2:1002531/99‑1 GTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTT < 1:2010547/99‑1 GTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTT < 1:1111149/99‑1 TGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTA > 2:1021180/1‑99 ATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACC > 2:2559329/1‑99 TACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTT > 1:495004/1‑99 GATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCT > 1:988957/1‑99 GATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCT < 2:297543/99‑1 CTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATT > 1:2775838/1‑99 TAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTT > 2:1809629/1‑99 CTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAG > 1:29987/1‑99 AGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAA > 2:509906/1‑99 GTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATC > 1:2741008/1‑99 TAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCA > 1:610151/1‑99 CTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAG > 2:1207976/1‑99 GGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATT > 2:2023435/1‑99 GGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATT < 1:1128303/99‑1 TTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAA > 1:1697038/1‑99 TACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAA > 2:923126/1‑99 TACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAA > 1:496616/1‑99 ACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAAT > 2:2330540/1‑99 ACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAAT > 2:2330379/1‑99 ACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAAT > 2:455772/1‑99 CTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAA > 2:2463924/1‑99 CTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAA < 1:2144459/99‑1 TTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAT > 2:2233284/1‑99 TCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTT < 2:1002670/99‑1 TCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTT < 2:1002418/99‑1 TCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTT < 2:1002343/99‑1 TCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTT < 2:1002325/99‑1 CTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTT < 1:657960/99‑1 TCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTA > 2:401452/1‑99 TCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTA > 2:404862/1‑99 TCACACTGTGATTACGATCACATTAGCAGTTATGCCCTTATGCTAAAAATTATCTCCAGTTACCAGAGATAATGAGAAAGGTAACTTCCCTCTCGCGGGGGAAGTTACCTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2900419‑2900306‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaagttacctttctCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTA > NC_000913/2900346‑2900443 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |