| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4512518 = | 1110 (1.240) | 7 (0.010) | 7/258 | NT | 0.69% | coding (892/999 nt) | fecC | ferric citrate ABC transporter permease |
| ? | NC_000913 | 4512564 = | 968 (1.140) | coding (846/999 nt) | fecC | ferric citrate ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGCTGGCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4512673‑4512518‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggcagTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTCA > NC_000913/4512564‑4512712 TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGC > 1:2746434/1‑150TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGC > 2:7887620/1‑150TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGC > 2:840063/1‑150TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGC > 2:9209526/1‑150TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGC < 1:14752131/150‑1TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGC < 2:5925593/150‑1TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGC > 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1:14368952/150‑1 TGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGCTGG < 2:13520484/150‑1 TGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGCTGG < 2:13520589/150‑1 TGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGACTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGCTGG < 2:12033051/150‑1 GCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGCTGGC > 2:914034/1‑150 GCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGCTGGC > 1:6826859/1‑150 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GCAGTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAG > 2:13663905/1‑112 GCAGTACGTTGCGCTGAACGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCAGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGTACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGT < 2:11146589/150‑1 CAGTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTT > 1:8308781/1‑150 CAGTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTT > 1:6646218/1‑150 AGTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAATCGCCAGCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCTCCAACCAGAAGCAGCAGTAACATATTGTTGTCCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTC > 2:1498898/1‑150 AGTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTC > 1:9889782/1‑150 AGTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTC < 2:6646218/150‑1 AGTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTC > 1:5360703/1‑150 AGTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTC > 1:3522204/1‑150 GTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTCA > 1:11216328/1‑150 GTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTCA < 2:5428048/150‑1 GTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTCA < 1:4913288/150‑1 GTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTCA > 2:13136327/1‑150 GTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTCA < 2:1755684/150‑1 TGCTGCTTCTGGTTGGTGCGTGCGTCAGCGTAGCAGGTCCGGTGGCGTTTATCGGTCTGCTGGTGCCACATCTGGCGCGCTTCTGGGCAGGCTTCGATCAGCGCAACGTACTGCCAGTGAGCATGCTGCTGGGGGCCACGCTGATGCTGCTGGCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4512673‑4512518‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggcagTACGTTGCGCTGATCGAAGCCTGCCCAGAAGCGCGCCAGATGTGGCACCAGCAGACCGATAAACGCCACCGGACCTGCTACGCTGACGCACGCACCAACCAGAAGCAGCACTAACATATTGATGACCAAACGTAGCCTCGTCAGGTTCA > NC_000913/4512564‑4512712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |