New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4596517 | 917 (1.020) | 4 (0.000) | 4/266 | NT | 0.44% | coding (528/1023 nt) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase |
? | NC_000913 | = 4596550 | 921 (1.050) | coding (561/1023 nt) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1004 total aligned reads displayed.
GACCCGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGC > NC_000913/4596401‑4596699 | gACCCGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGca > 2:13825689/1‑150 (MQ=255) gACCCGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGca < 2:11738596/150‑1 (MQ=255) gACCCGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGca < 1:12740194/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCAcag < 2:9301589‑M2/150‑4 (MQ=255) ccGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCAcag < 1:8955396‑M2/150‑4 (MQ=255) cGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAgg > 2:2934100/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAggtg > 1:8529180/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAggtgg > 1:4266379/1‑150 (MQ=255) ggcggcAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAggtggt < 1:5535080/150‑1 (MQ=255) ggcAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAggtggtggt < 1:11623499/150‑1 (MQ=255) gcagcaTTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGgtggtggtg > 2:1451070/1‑150 (MQ=255) gcaTTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCg < 2:807192/150‑1 (MQ=255) caTTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCgg > 1:215201/1‑150 (MQ=255) attgattgAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGa > 1:7827162/1‑150 (MQ=255) attgattgAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGa > 1:5177481/1‑150 (MQ=255) tgattgaACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATa < 2:12348619/150‑1 (MQ=255) gattgaACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATAc < 1:11176320/150‑1 (MQ=255) gagtgaACCTTGCGCGAGTCGCGCTCAGGCGGTGCGTCGCGCAGCCAGTGCTCGCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATAc < 2:330600/147‑1 (MQ=255) 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gcgcTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAAc > 1:14971957/1‑150 (MQ=255) gcTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACAt > 1:12487567/1‑150 (MQ=255) cTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACAtg > 2:3823561/1‑150 (MQ=255) tCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACAtgt < 1:4898535/150‑1 (MQ=255) cATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACAtgtg > 2:12449152/1‑150 (MQ=255) tGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGc < 2:5206430/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCaa < 1:13956270/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCaa > 2:6274876/1‑150 (MQ=255) gTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAAcg > 1:4367312/1‑150 (MQ=255) gTCGCGCAGCCAGTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTc < 2:10479905/150‑1 (MQ=255) 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2:8537168/1‑150 (MQ=255) gcggcgGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTtggt < 1:3940695/150‑1 (MQ=255) gcggcgGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTtggt < 2:5963801/150‑1 (MQ=255) cggcggCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTtggtg < 2:4153701/150‑1 (MQ=255) ggcAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGTCGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTc > 2:5699501/1‑150 (MQ=255) gcAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCg < 1:15323191/150‑1 (MQ=255) aaTCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCt > 2:4654896/1‑150 (MQ=255) aTCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTcaatc < 2:11152941/150‑5 (MQ=255) aTCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTg < 2:14787257/150‑1 (MQ=255) tCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTgg < 2:12858253/150‑1 (MQ=255) gCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGgcg > 1:3672451/1‑150 (MQ=255) aGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTtggt > 2:719997/1‑133 (MQ=255) gCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGaaa < 1:6274876/150‑1 (MQ=255) ccGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAg < 1:3418048/150‑1 (MQ=255) ccGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTGACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAg < 2:14156172/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGt > 1:15515932/1‑150 (MQ=255) 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acaGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGAcgc < 2:7657935/150‑1 (MQ=255) | GACCCGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGATGGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGC > NC_000913/4596401‑4596699 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |