Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 580,727 | 0 | G | T | 7.1% | 2490.5 / 40.3 | 792 | intergenic (‑282/‑107) | ylcI/nohD | DUF3950 family protein, DLP12 prophage/DLP12 prophage; DNA packaging protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (418/291); new base T (5/78); total (423/369) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.64e-22 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 808 total aligned reads displayed.
CGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTT‑CCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGA > NC_000913/580578‑580876 | tgACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTT‑CCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGtattt > 2:11080757/1‑150 (MQ=255) gACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTT‑CCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGtattta < 1:10981418/150‑1 (MQ=255) gTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTT‑CCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTaa > 1:7590048/1‑150 (MQ=255) 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gTATTTATTTAAAATACCCCCTCAAAATAAAGCAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGa < 1:3464879/150‑1 (MQ=255) | CGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTT‑CCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGA > NC_000913/580578‑580876 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |