| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 151,688 | C→G | 9.3% | V182L (GTA→CTA) | yadL ← | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 151,688 | 0 | C | G | 9.3% | 2494.5 / 35.5 | 793 | V182L (GTA→CTA) | yadL | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (436/265); new base G (2/86); total (439/354) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.18e-30 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 811 total aligned reads displayed.
AAAACAGTAATGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGA > NC_000913/151539‑151837 | aaaaCAGTAATGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTAc > 2:5071043/1‑150 (MQ=255)aaaaCAGTAATGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTAc > 1:8078994/1‑150 (MQ=255) aaaCAGTAATGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACg < 1:3299643/150‑1 (MQ=255) aCAGTAATGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGt < 2:6041248/150‑1 (MQ=255) aGTAATGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGttt < 2:2173656/150‑1 (MQ=255) tAATGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTa < 2:6664098/150‑1 (MQ=255) aaTGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAt < 2:10448328/150‑1 (MQ=255) acagaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAttttt < 1:948961/150‑1 (MQ=255) acagaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAttttt > 1:4705731/1‑150 (MQ=255) cagaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAtttttt < 2:3669240/150‑1 (MQ=255) agaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTGAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAttttttt > 2:2912755/1‑150 (MQ=255) agaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAttttttt < 2:7634812/150‑1 (MQ=255) agaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAttttttt < 1:1963942/150‑1 (MQ=255) agaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAttttttt > 1:12048000/1‑150 (MQ=255) agaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACAGTGTTTACGGTTTTAttttttt > 2:10691892/1‑150 (MQ=255) gaaacagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTc < 1:13733141/150‑1 (MQ=255) cagaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACg < 2:8710039/150‑1 (MQ=255) agaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGa < 2:1300123/150‑1 (MQ=255) agaaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGa > 1:6545120/1‑150 (MQ=255) aaTTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGAcc < 2:8423063/150‑1 (MQ=255) ttattCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTAGAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAg > 1:15491360/1‑150 (MQ=255) attCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGc < 2:12628050/150‑1 (MQ=255) attCTCGTCATCAGGTTACGTTGAGTGGGATGCTTATTTAGTTCCTGATTCTGTTAGTCTGTTAGTTATTGGTTACTGTAATTGTGGCTGGTGCAGAAATCTTACCCGCAGTGACTTTGTTTACGTTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGc < 1:14374854/150‑1 (MQ=255) ttCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCg > 2:6136542/1‑150 (MQ=255) ttCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCg > 2:6877249/1‑150 (MQ=255) tctTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGc > 1:8578949/1‑150 (MQ=255) tctTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGc > 1:10037569/1‑150 (MQ=255) tctTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGc > 2:1188175/1‑150 (MQ=255) atcaGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCa > 2:7880716/1‑150 (MQ=255) caGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATc < 1:756874/150‑1 (MQ=255) cTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTAGTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAATCTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGa > 1:10880826/1‑150 (MQ=255) ttACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCggtg > 2:970/1‑148 (MQ=255) ttACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGat > 1:7330919/1‑150 (MQ=255) ttACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGat > 1:132185/1‑150 (MQ=255) gTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGataata > 2:13708492/1‑150 (MQ=255) gTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGataata > 2:1340748/1‑150 (MQ=255) gTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAACGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGataata > 1:4054206/1‑150 (MQ=255) ttGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGAtaataa < 1:4353802/150‑1 (MQ=255) tGAGTGGGATGCATCTCTAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAATTGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATaaa < 2:13205636/150‑1 (MQ=255) tGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATaaa < 1:2682852/150‑1 (MQ=255) tGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTAGAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATaaa < 1:6045483/150‑1 (MQ=255) gAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAAc > 2:2418356/1‑150 (MQ=255) gAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAAc < 1:8735692/150‑1 (MQ=255) ttttGCATATTTTTTTCGTTAATCTGTATGTCTTTTTTTTATAGTTTACTGTATTTGTGGCTGGTGCATAAAACTTACCCGCTGTGACTTTTTTTAGGTTTTTATTTTTTCCCACGACCAGGCGTGCACTCTTCGGATAATAAACGACCg < 2:8197996/147‑1 (MQ=255) ggATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCg > 1:13949183/1‑150 (MQ=255) atatatAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTgg > 1:5301093/1‑150 (MQ=255) atatatAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTgg > 2:5842809/1‑150 (MQ=255) aGTTCCTCAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAg > 2:2661547/1‑150 (MQ=255) gTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGt > 2:4378034/1‑150 (MQ=255) ttCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGGAGAAAACTTACCCGCAGTGAGATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCAGTCATCTGATAATAATCGACCGCTTTGGCTGCAGTg > 2:14889140/1‑150 (MQ=255) ccTGAATCTGTATGTCTGTTAGTTTTAGTTTACTGTAATTGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCTGTTACATTGTTTACGTTTTTATTTTTTTCCACGACCCGGCGTGCACTCATCGTATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGga < 2:3244914/150‑1 (MQ=255) catGAATCTTTAAGTCTTTTAGTTATAGTTTACTGTAATTGTGGATGGTGAAGAAAACTTACCCGAATTGACTTTTTTTACTTTTTTTTTTTTTTCCACGACAAGGCGTGCACTCATCTGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGga < 2:11322800/148‑1 (MQ=255) cTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAATCTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTggtg > 2:7226311/1‑148 (MQ=255) cTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGAACAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAAAGACCGCATTGGCTGAAGTGgag > 2:10888922/1‑150 (MQ=255) tGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAATTGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTACACGACCAGGCGTGCACTCATCGGTTAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGgaga > 1:12569832/1‑150 (MQ=255) gAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGAt > 1:564147/1‑150 (MQ=255) aaTCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGAtt < 2:3922930/150‑1 (MQ=255) gTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTAc > 2:740352/1‑150 (MQ=255) tCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCtt > 1:6254522/1‑150 (MQ=255) tCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCtt > 2:1769589/1‑150 (MQ=255) tCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTACCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCtt < 2:4768444/150‑1 (MQ=255) gtgtttgttATCGGTTACTGTAAATGTGGGTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTAGGTTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGTATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTtg < 2:15312480/149‑1 (MQ=255) gtGTTAGTTATCGGTTACTGTAATTGGGGGTGGTGCAGAAAACTTACCCGCCGTGACTTTGTTTCGGTTTTTATTTTTTTCCACGACCCGGCGGGCACCCATCGGATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTtg < 2:12247466/149‑1 (MQ=255) gttagttaTAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTtgtg > 1:10368587/1‑150 (MQ=255) ttaTAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCt > 1:5060773/1‑150 (MQ=255) ttaTAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCt > 1:11522436/1‑150 (MQ=255) ttaTAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGAGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTCCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCt > 2:9250021/1‑150 (MQ=255) tttgtttACTGTAATTGTGGCTGGTGAATAAAACTAACCCGCTGTTACTTTTTTTTCGTTTTTATTTTTTTCCACGACCTGGCGTGCACACATCGTATAAAAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTgg < 1:8323354/145‑1 (MQ=255) ataGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTgg > 2:14494582/1‑150 (MQ=255) gTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGtt > 1:14942448/1‑150 (MQ=255) tGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTAcaca > 2:7989254/1‑150 (MQ=255) tAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGGGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGc > 1:7853444/1‑150 (MQ=255) gtgGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAAt > 1:3039428/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGCATAAAACTTACCCGCTGTGACATTTTTTACGGTTTTATTTTTTCCCACGCCCTGGCGTGCACTCATGGTATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATtgt < 1:15258392/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATtgt > 2:12011213/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATtgt > 2:15527054/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATtgtg < 2:14088825/150‑1 (MQ=255) tGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTTACTTTTTTTAGGTTTTTATTTTTTCCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGTATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTgtgt < 1:9996358/150‑1 (MQ=255) ggTGCATAAAACTTACCCGCTGTGACTTTGTTTTGGTTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGGGTGCACTCTTGGTATAAAAAACGACCGCATTGGCTGCGGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGtt < 1:9753461/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGAAAACTTCCCCGCTGTGACTTTGTTTAGGGTTTTTTTTTTTTCCCCGACCGGGGGTGCACTCCGCGGATACTACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGtt < 1:11746443/150‑1 (MQ=255) gCATAAAACTTCCCCGCAGTGACATTGTTTCCGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCa < 2:12481982/150‑1 (MQ=255) aGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACt > 2:1941023/1‑150 (MQ=255) gAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTc > 1:6883034/1‑150 (MQ=255) aCTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTg > 1:9141127/1‑150 (MQ=255) ttACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGtt > 2:13934143/1‑150 (MQ=255) cccGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGGACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGcc > 1:13487001/1‑150 (MQ=255) ccGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCg > 2:11702840/1‑150 (MQ=255) ccGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCg > 2:4159932/1‑150 (MQ=255) ccGAAGTTACATTTTTTACTTTTTAATTTTTTACCACCACCAGGCTTGCAAAAATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCg < 1:1739382/150‑1 (MQ=255) gCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGa > 1:2200890/1‑150 (MQ=255) gTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGtt > 1:3640797/1‑150 (MQ=255) tGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTa < 2:10231285/150‑1 (MQ=255) taaaTTGTTTAGGGTTTTATTTTTTCCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTAc < 2:6344305/147‑1 (MQ=255) actttttttAGGTTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGTATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACa < 2:5618898/144‑1 (MQ=255) tGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCCGGCGTGCACTCATCGGATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGc < 1:11440413/150‑1 (MQ=255) gTTTAGTGTTTTATTTTTTCCCACTACCCGGCGGGCACCCATCGTTTAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCt < 2:5309107/150‑1 (MQ=255) tttACGGTTTTAGTTATTTCCCCGACCAGGCGTGCACTCAGCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTc < 1:8441563/150‑1 (MQ=255) ttACGGTTTTATTTTTTCCCACGACCCGGCTTGCACTAATCGTATAATACACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTcc < 1:5798377/150‑1 (MQ=255) tACGGTTTTATTTTTGTCCACGACCAGGCGTGCACTCCTCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCa < 2:9020187/150‑1 (MQ=255) aCGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAg > 2:9430126/1‑150 (MQ=255) | AAAACAGTAATGACAGAAACAGAATTATTCTCTTCATCAGCTTACGTTGAGTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGTTACACAGCTAAATTGTGTTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTGCTCCAGA > NC_000913/151539‑151837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |