| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,062,186 | 1 | . | G | 5.3% | 600.0 / 29.5 | 150 | intergenic (+41/‑61) | yihM/yihN | putative sugar phosphate isomerase/MFS transporter family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (76/66); new base G (6/2); total (82/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
GGATGCGCGGTTACGTAAAGAAAAAGAAGATGCAATTAATCAGATAAATCATGTGCGTAACGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATAT‑GAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTT > NC_000913/4062037‑4062335 | ggATGCGCGGTTACGTAAAGAAAAAGAAGATGCAATTAATCAGATAAATCATGTGCGTAACGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAGACCATT‑CATAT‑g > 2:638301/1‑150 (MQ=255) gATGCGCGGTTACGTAAAGAAAAAGAAGATGCAATTAATCAGATAAATCATGTGCGTAACGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATAT‑g > 1:61188/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGTTACGTAAAGAAAAAGAAGATGCAATTAATCAGATAAATCATGTGCGTAACGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATAT‑Gaa > 1:1391866/1‑150 (MQ=255) 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t‑GAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGtt < 1:1010172/150‑1 (MQ=255) t‑GAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTAAAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGtt > 1:1309724/1‑150 (MQ=255) | GGATGCGCGGTTACGTAAAGAAAAAGAAGATGCAATTAATCAGATAAATCATGTGCGTAACGTACTACAACAAATCAAACAAGAGGCAAACCATCTTCTGAACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATAT‑GAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTT > NC_000913/4062037‑4062335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |