| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2710656 = | 106 (1.070) | 5 (0.050) | 5/264 | NT | 5.1% | coding (237/1623 nt) | nadB | quinolinate synthase, L‑aspartate oxidase (B protein) subunit |
| ? | NC_000913 | 2710758 = | 84 (0.890) | coding (339/1623 nt) | nadB | quinolinate synthase, L‑aspartate oxidase (B protein) subunit | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCACGATCCTGTGTGCAATGGCTAATCGACCAGGGGGTGTTGTTTGATACCCACATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTACCATCTGACCCGTGAAGGTGGACATAGTCACCGTCG > NC_000913/2710507‑2710802 | ccgcgttgctgcgctccagcacgcgaatattcggatggttcagcgccttgctcaccagcgtggtttctacttctctaccggtggcgtcggcggcatgaagaatacgacggtgactatgtccaccttcacgggtcagatggtaactttctt < 1:119493‑M1/1‑1 (MQ=255) cgcgttgctgcgctccagcacgcgaatattcggatggttcagcgccttgctcaccagcgtggtttctacttctctaccggtggcgtcggcggcatgaagaatacgacggtgactatgtccaccttcacgggtcagatggtaactttcttc < 2:1703007‑M1/2‑1 (MQ=255) cgcgttgctgcgctccagcacgcgaatattcggatggttcagcgccttgctcaccagcgtggtttctacttctctaccggtggcgtcggcggcatgaagaatacgacggtgactatgtccaccttcacgggtcagatggtaactttcttc < 1:477808‑M1/2‑1 (MQ=255) aGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATc > 2:1262198/1‑150 (MQ=255) aGCATCAGGTCATCGATCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATAGCCGCCGTGTTTGATGAAACTTACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACAATGATTTCCGGGGCTGGTATTTGCGATc > 1:613177/1‑150 (MQ=255) gcgttgctgcgctccagcacgcgaatattcggatggttcagcgccttgctcaccagcgtggtttctacttctctaccggtggcgtcggcggcatgaagaatacgacggtgactatgtccaccttcacgggtcagatggtaactttctTCg > 2:367983‑M1/148‑150 (MQ=255) gcgttgctgcgctccagcacgcgaatattcggatggttcagcgccttgctcaccagcgtggtttctacttctctaccggtggcgtcggcggcatgaagaatacgacggtgactatgtccaccttcacgggtcagatggtaactttctTCg < 2:645687‑M1/3‑1 (MQ=255) gttgctgcgctccagcaagcgaatattcggatggttcagcgccttgctcaccagcgtggtttctacttctctaccggtggcgtcggcggcatgaagaatacgacggtgactatgtccaccttcacgggtcagatggtaactttctTCGcc < 1:1438679‑M1/5‑1 (MQ=255) tCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCa < 2:1439092/150‑1 (MQ=255) aGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATg > 2:438341/1‑150 (MQ=255) aGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATg < 1:363098/150‑1 (MQ=255) gTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACTGAATGTTCAACAGTTTATGCCCAGGGCGGCAGTGCCGCCGGGTGTGCTGAAACTGACAGCAGTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCa < 1:272549/150‑1 (MQ=255) cATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGt > 2:1551403/1‑150 (MQ=255) cATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGATCAACATTTTATGCCAAGGGCGGTATAGCCGCCGAGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGt > 1:15376/1‑150 (MQ=255) aaTCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTCTTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGt < 2:1486114/149‑1 (MQ=255) gTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGaa > 1:859273/1‑150 (MQ=255) ttCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAAt < 2:1205030/150‑1 (MQ=255) tCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGGTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAAtt < 2:733280/150‑1 (MQ=255) 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ccGGGGCTGGTATTTGCGATCGACATTCAGATGAATTTGTCGCCAGCAATGCACGATCCTGTGTGCAATGGCTAAGCGACCAGGGTGTGTTGTTTGATACCCTCATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTACCATCTGACCCGTGAAGGTg < 1:1049833/150‑1 (MQ=255) ggggCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCACGATCCTGTGTGCAATGGCTAATCGACCAGGGGGTGTTGTTTGATACCCACATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTACCATCTGACCCGTGAAGGTgg < 1:605953/149‑1 (MQ=255) ggggCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCACGATCCTGTGTGCAATGGCTAATCGACCAGGGGGTGTTGTTTGATACCCACATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTACCATCTGACCCGTGAAGGTgg > 2:605953/1‑149 (MQ=255) ggggCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCACGATCCTGTGTGCAATGGCTAATCGACCAGGGGGTGTTGTTTGATACCCACATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTACCATCTGACCCGTGAAGGTGGa > 2:203067/1‑150 (MQ=255) ggggCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCACGATCCTGTGTGCAATGGCTAATCGACCAGGGGGTGTTGTTTGATACCCACATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTACCATATGACACGTGAAGGTGGa > 2:682662/1‑150 (MQ=255) 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cGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCACGATCCTGTGTGCAATGGCTAATCGACCAGGGGGTGTTGTTTGATACCCACATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTACCATCTGACCCGTGAAGGTGGACATAGTCACcgtcg > 1:1692709/1‑150 (MQ=255) cGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTAGACAGCAATGCACGATCCTGTGTGCTATGGCTAATCGACCTGGGGGTGTTGTTTGATACCCACATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTTCCATCTGACCCGTGAAGGTGGACATAGTCACcgtcg < 2:613177/150‑1 (MQ=255) | CAGCATCAGGTCATCGTTCTAAGTAAAGGCCCGGTAACGGAAGGTTCAACATTTTATGCCCAGGGCGGTATTGCCGCCGTGTTTGATGAAACTGACAGCATTGACTCGCATGTGGAAGACACATTGATTGCCGGGGCTGGTATTTGCGATCGCCATGCAGTTGAATTTGTCGCCAGCAATGCACGATCCTGTGTGCAATGGCTAATCGACCAGGGGGTGTTGTTTGATACCCACATTCAACCGAATGGCGAAGAAAGTTACCATCTGACCCGTGAAGGTGGACATAGTCACCGTCG > NC_000913/2710507‑2710802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |