| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3493578 | 108 (1.090) | 6 (0.060) | 6/262 | NT | 5.6% | coding (1011/1182 nt) | tsgA | putative transporter |
| ? | NC_000913 | = 3493634 | 99 (1.060) | coding (1067/1182 nt) | tsgA | putative transporter | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CCAGCGCGATCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGG > NC_000913/3493487‑3493782 | ccAGCGCGATCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGtc < 1:392672‑M2/150‑3 (MQ=255)ccAGCGCGATCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGGCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGtc > 1:387595‑M2/1‑148 (MQ=255) cgcgATCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGtccgca > 1:783148‑M2/1‑144 (MQ=255) cgATCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGtccgcagg < 2:454532‑M2/150‑9 (MQ=255) aTCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAggcg < 1:180025/150‑1 (MQ=255) aTCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAggcg > 1:1557308/1‑150 (MQ=255) aTCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACAGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAggcg < 2:275333/150‑1 (MQ=255) cTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAggcggc < 2:1579512/150‑1 (MQ=255) ataCCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCAc > 2:118948/1‑150 (MQ=255) ataCCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCAc < 1:596846/150‑1 (MQ=255) accaccATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTg > 2:919829/1‑150 (MQ=255) accaccATCATCAACCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTGTGTGGTTACCGGCCCGATAGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGCCACTg > 2:877525/1‑150 (MQ=255) gccccaTCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCACGATCGATGGACCTAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGc > 1:867614/4‑150 (MQ=255) ccaccaTCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGCCCTTTGTGGTTAACGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGc > 1:867612/1‑150 (MQ=255) accaTCATCCCCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCtt > 2:812803/1‑150 (MQ=255) accaTCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCtt > 2:1265093/1‑150 (MQ=255) catcatCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTTGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCTCAGGCGGCACTGCTTAc < 2:1460044/150‑1 (MQ=255) catcatCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTAc < 1:1487774/150‑1 (MQ=255) catcatCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTAc < 1:1176989/150‑1 (MQ=255) catcatCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTAc > 1:1093756/1‑150 (MQ=255) tcatgaCCCTGCGGTCCCAGCAGACCATAGTACCGTCGCCAAAACTGCTCAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCAGCGGTACTATGGTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGACCATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAg < 2:1607241/150‑1 (MQ=255) tcatcaCCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAg < 2:1093756/150‑1 (MQ=255) catcaCCCTGGGTTCACACCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGGGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGc < 1:216334/150‑1 (MQ=255) 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gCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCgg > 2:1391944/1‑150 (MQ=255) ccGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGAc < 2:458795/150‑1 (MQ=255) ccGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGAc > 1:1064579/1‑150 (MQ=255) cGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCCCCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACg > 1:76827/1‑150 (MQ=255) gATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACgg < 1:1373117/150‑1 (MQ=255) tGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTAt < 2:1408809/150‑1 (MQ=255) tGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTAt > 2:372494/1‑150 (MQ=255) gAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTAtc > 1:1081671/1‑150 (MQ=255) aTAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTAtcgtcg < 2:1482500/150‑1 (MQ=255) aTAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTAtcgtcg < 2:891590/150‑1 (MQ=255) tAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATcgtcgt > 2:156709/1‑150 (MQ=255) ggTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGGCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTGTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCgg < 1:1439974/150‑1 (MQ=255) | CCAGCGCGATCTATACCACCATCATCACCCTGGGTTCACAGCAGACCAAAGTACCGTCGCCAAAACTGGTTAACTTTGTCCTGACCTGCGGAACCATCGGTACTATGTTGACCTTTGTGGTTACCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGG > NC_000913/3493487‑3493782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |