| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,513,638 | A→G | 5.7% | V199V (GTA→GTG) | nupC → | nucleoside (except guanosine) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,513,638 | 0 | A | G | 5.7% | 365.3 / 9.1 | 123 | V199V (GTA→GTG) | nupC | nucleoside (except guanosine) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/61); new base G (5/2); total (60/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CTTTATTGCCTATAAAGATATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAA > NC_000913/2513491‑2513785 | tATTGCCTATAAAGATATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGaa < 2:229615/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTATAAAGATATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAAc < 1:598051/150‑1 (MQ=255) ttGCCTATAAAGATATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCCCCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACa > 1:1541935/1‑150 (MQ=255) 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tcgtTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTc > 1:879572/1‑150 (MQ=255) cgtTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCt < 1:1139340/150‑1 (MQ=255) cgtTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTAACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGAAGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGACCTTCTACGAAATGCAGGGTGAATACAATca > 2:1655767/1‑149 (MQ=255) gctgcGCTGGTACGGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCGGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAATAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCCCGAAGGTAAGAGCTTATTCGAAATGCGGGGTGAATAAATTCTGGCa > 2:1286898/1‑150 (MQ=255) cgataaaggTGCTGAACATGTTCAGTACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAg > 2:1004729/8‑150 (MQ=255) 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ggTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCaa > 2:1099155/1‑150 (MQ=255) gTACTGACCATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGGCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCaaa < 2:98223/150‑1 (MQ=255) | CTTTATTGCCTATAAAGATATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTTTCAAA > NC_000913/2513491‑2513785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |