| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,687,046 | A→C | 6.7% | intergenic (+21/+24) | hmp → / ← glnB | fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2/regulatory protein P‑II for glutamine synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,687,046 | 0 | A | C | 6.7% | 278.2 / 9.4 | 101 | intergenic (+21/+24) | hmp/glnB | fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2/regulatory protein P‑II for glutamine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/49); new base C (5/2); total (50/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCGACACAGG > NC_000913/2686898‑2687194 | cGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGAGCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAAc < 2:1696981/150‑1 (MQ=255) aaTGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATcc > 1:596419/1‑150 (MQ=255) aTGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGCGAAGCAGGAAAACCTTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATTTTGCCGGATGGTAACATCCg > 1:97428/1‑150 (MQ=255) 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aaCATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCGACACAgg < 1:986334/150‑1 (MQ=255) | CGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCGACACAGG > NC_000913/2686898‑2687194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |