Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,911,007 | 0 | G | A | 7.6% | 447.4 / 14.2 | 144 | R29C (CGT→TGT) | mazF | mRNA interferase toxin, antitoxin is MazE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/70); new base A (4/7); total (67/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
TACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTG > NC_000913/2910858‑2911154 | ccTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGAt > 2:938411/1‑150 (MQ=255) cTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGATg < 1:681759/150‑1 (MQ=255) cTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGATg < 1:1519253/150‑1 (MQ=255) 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tCAGGACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTg < 1:543292/150‑1 (MQ=255) tCAGGACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTg < 2:1018131/150‑1 (MQ=255) gcgagcaaGCTGGACATCGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCACCCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAg > 1:1018153/8‑150 (MQ=255) gACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAgg < 2:661992/150‑1 (MQ=255) acaacaGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGt < 1:994545/150‑1 (MQ=255) caacaGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGtt < 1:1717897/150‑1 (MQ=255) acaGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGtttt > 2:569899/1‑150 (MQ=255) caGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTc < 2:1274715/150‑1 (MQ=255) aaGCTGGACATCGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTc > 1:346579/2‑150 (MQ=255) cTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCgg < 2:405985/150‑1 (MQ=255) cTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGGACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCgg < 1:108802/150‑1 (MQ=255) aCGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTg < 1:411605/150‑1 (MQ=255) | TACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTCAAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTG > NC_000913/2910858‑2911154 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |