| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,086,641 | 0 | C | A | 9.1% | 298.2 / 2.9 | 123 | intergenic (+239/‑65) | yqgC/metK | uncharacterized protein/S‑adenosylmethionine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/61); new base A (13/3); total (59/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.90e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGATGCCGTTTTA > NC_000913/3086492‑3086789 | ccACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTCGTAGGATc > 1:105504/1‑150 (MQ=255) cGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTTAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGAAGGAACCGc > 1:277726/1‑150 (MQ=255) gTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCt < 1:590256/150‑1 (MQ=255) 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ccTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGAcc < 1:394995/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGAGTCGTGGTAGGATACCCTAACACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCGAAACAAAATCTCATTAGGTGATATTAAATATGGAAAAAAACCATTTTACGTCCGACTCCGTCGAGGAACGGCATCCTGACAAAATTTCTGaac > 2:1627713/1‑148 (MQ=255) cTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGCGCTAACCAAATTATCTTTAGGTGATATTAAAAATGGGAAAAAACAGTTTTTCTTCCGCGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCa > 2:223537/1‑150 (MQ=255) gTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGATAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCt > 2:703010/1‑150 (MQ=255) gTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCt > 2:1696760/1‑150 (MQ=255) cGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGa < 1:45064/150‑1 (MQ=255) tAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGATGCCg < 1:448876/150‑1 (MQ=255) aGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCAGAGTCCGTCTCTGCAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGATGCCGt > 2:75620/1‑150 (MQ=255) ggATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGATGCCGtt > 2:1162441/1‑150 (MQ=255) gATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGATGCCGttt < 1:223848/150‑1 (MQ=255) gATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGATGCCGttt > 1:1436331/1‑150 (MQ=255) tCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGGCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGATGCCGTTTTa < 1:39130/150‑1 (MQ=255) | CCACGTTTTTAACAGAATGAGACACGATTCAAAAAAAAGTGGAAATAGGGTGAAGAATTGACCTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATTTCTGATGCCGTTTTA > NC_000913/3086492‑3086789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |