| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,146,763 | 0 | T | C | 5.8% | 360.5 / 8.9 | 121 | intergenic (‑26/+93) | yghW/yghX | DUF2623 family protein/pseudogene, dienlactone hydrolase family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/71); new base C (3/4); total (46/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TGTGAGTAGCCTAATACAAAACCGCGTTTATAATCGGCACAGAATTTTGTCACATTAACCGCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCATCGTTCACCTCATTCGCTATATATTGTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGATCGGCGG > NC_000913/3146616‑3146911 | tgtgAGTAGCCTAATACAAAACCGCGTTTATAATCGGCACAGAATTTTGTCACATTAACCGCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCATCGTTCACCTCATTCGCTATATATTGTCa < 1:1709376/150‑1 (MQ=255)tgtgAGTAGCCTAATACAAAACCGCGTTTATAATCGGCACAGAATTTTGTCACATTAACCGCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCATCGTTCACCTCATTCGCTATATATTGTCa < 1:1456188/150‑1 (MQ=255)tgtgAGTAGCCTAATACAAAACCGAGTTTATAATCTGCACAGAATTTTGTCACATTAACCTCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCATCGTTCACCTCATTCGCTATATTTTGTCa < 1:1422583/150‑1 (MQ=255) 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gCTATATATGACAATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGCCGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCa > 2:463492/1‑150 (MQ=255) atatatTGTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGa < 1:1320240/150‑1 (MQ=255) tatttTGTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGAATTTTCCGCACGATATTTTTTCATACTTGTTTAATACTTAAACCCGAAAGAGATAAACGTATCAGGAGAGTTATTTATCGAACAATTTCATTTTCCTTTGCCAGGCAAGAt > 2:855980/1‑150 (MQ=255) tatTGTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGATcg > 2:1079846/1‑150 (MQ=255) tGTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGATcggcg < 1:77252/150‑1 (MQ=255) tGTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGATcggcg < 1:631372/150‑1 (MQ=255) gTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTg > 1:1211544/1‑133 (MQ=255) gTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGATcggcgg < 1:908632/150‑1 (MQ=255) gTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGATcggcgg > 1:1315327/1‑150 (MQ=255) gTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGATcggcgg > 1:1669570/1‑150 (MQ=255) gTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCAAGGCAAGATcggcgg > 2:1083495/1‑150 (MQ=255) gTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGAAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAAACATTACAATGTCCTTTGACAGGCAAGATcggcgg > 2:1311725/1‑150 (MQ=255) | TGTGAGTAGCCTAATACAAAACCGCGTTTATAATCGGCACAGAATTTTGTCACATTAACCGCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCATCGTTCACCTCATTCGCTATATATTGTCATATATAGCGATATTTTAGGCAAAGAACGACTTTTGCGCACGCTATTTTTTCATGCTTGTTTAAGACGTAATCCCGTAAGAGATAAACCTATCAGGAGAGATATTTATCGAACCATTTCAGTGTCCTTTGCCAGGCAAGATCGGCGG > NC_000913/3146616‑3146911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |