| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,172,439 | 0 | A | T | 5.8% | 328.3 / 5.0 | 110 | intergenic (‑228/‑91) | ygiZ/mdaB | inner membrane protein/NADPH quinone reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/52); new base T (2/5); total (53/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
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2:1421805/1‑124 (MQ=255) tGCTAAATTCGCAAAAGACTTTGCACATTTTGCTAATTTCACCGTACCGCTCTGTGACGTACTATAGTCGGCAAACGTCTCACCTTGAGGTTAAAAAATGAGCAACATCCTGATTATCAACGGCGCGAAAAAATTCGCCCACTCCAATgg > 1:1321146/1‑150 (MQ=255) ttAAATTCGCATAAGACTTTGCACATTTTGCTAATTTCACCGTACCGATCTGTGACGTACTATAGTCGGCAAACGTCTCACCTTGAGGTTAAAAAATGAGCAACATCCTGTTTATCAACGGCGCGAAAAAATTCGCCCACTCCAATGGTc < 2:1614569/149‑1 (MQ=255) cTAAATTCGCAAAAGACTTTGCACATTTTGCTAATTTCACCGTACCGCTCTGTGACGTACTATAGTCGGCAAACGTCTCACCTTGAGGTTAAAAAATGAGCAACATCCTGATTATCAACGGCGCGAAAAAATTCGCCCACTCCAATGGTc > 1:253144/1‑150 (MQ=255) tAAATTCGCAAAAGACTTTGCACATTTTGCTAATTTCACCGTACCGCTCTGTGACGTACTATAGTCGGCAAACGTCTCACCTTGAGGTTAAAAAATGAGCAACATCCTGATTATCAACGGCGCGAAAAAATTCGCCCACTCCAATGGTCa > 2:1642700/1‑150 (MQ=255) tAAATTCGCAAAAGACTTTGCACATTTTGCTAATTTCACCGTACCGCTCTGTGACGTACTATAGTCGGCAAACGTCTCACCTTGAGGTTAAAAAATGAGCAACATCCTGATTATCAACGGCGCGAAAAAATTCGCCCACTCCAATGGTCa > 2:1118269/1‑150 (MQ=255) aTTCGCAAAAGACTTTGCACATTTTGCTAATTTCACCGTACCGCTCTGTGACGTACTATAGTCGGCAAACGTCTCACCTTGAGGTTAAAAAATGAGCAACATCCTGATTATCAACGGCGCGAAAAAATTCGCCCACTCCAATGGTCAACt > 1:925132/1‑150 (MQ=255) | TATTTTCAATCCCCAAAAAAACCGAACCAAACGTGTAAATTATTCCGGTGCGAGTAAGAATTATGAGGAATGGCTATCAGTATTGTCATTTTCAGAAAATATTTATCCTGCATCGGTGAGTCAGAGTAAGATCAGACTTTTGCTAAATTCGCAAAAGACTTTGCACATTTTGCTAATTTCACCGTACCGCTCTGTGACGTACTATAGTCGGCAAACGTCTCACCTTGAGGTTAAAAAATGAGCAACATCCTGATTATCAACGGCGCGAAAAAATTCGCCCACTCCAATGGTCAACT > NC_000913/3172293‑3172588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |