| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,648,360 | C→T | 6.4% | noncoding (67/84 nt) | agrB → | antisense sRNA antitoxin for the DinQ toxin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,648,360 | 0 | C | T | 6.4% | 435.2 / 9.8 | 142 | noncoding (67/84 nt) | agrB | antisense sRNA antitoxin for the DinQ toxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (71/59); new base T (6/3); total (79/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACC > NC_000913/3648213‑3648506 | atataCCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTATTTATTGCAATGTTAGACACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTATCTCACTACAGACAGAGCCACCAACTCAGGGATGGAAAGTAAAAAACCGACGCaa > 1:1687406/1‑150 (MQ=38) aaGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGtt < 2:636328/150‑1 (MQ=255) tccctccGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATATGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTa > 2:230281/1‑150 (MQ=255) ccctccGCGAGCTGAAGAAATCGCTAAATCTTGCAATGTTAGCCACTTGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGATCTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACTTTGCGTCGGttttttact < 2:309857/150‑4 (MQ=37) cctccGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACg > 1:1154217/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTcc > 2:1278354/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTcc > 2:739381/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGa < 1:1648119/150‑1 (MQ=255) gaaATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGAcct < 1:1601602/150‑1 (MQ=255) gaaATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTATCTAACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGTCTGGAAAGTAAAAAACCGAAGAAAAGACGGTTTTTTTACGTCATGATTAAGAcaa > 1:731424/1‑148 (MQ=255) cGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCttt > 2:1592219/1‑150 (MQ=255) gCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGTCGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTc > 2:1036031/1‑150 (MQ=255) gCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTc < 1:1592219/150‑1 (MQ=255) gCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTc < 1:665794/150‑1 (MQ=255) gCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTc < 2:1679854/150‑1 (MQ=255) gCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTc > 2:540339/1‑150 (MQ=255) cTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCAATCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGTTTTTTGTACGTCCTGAGTCAGACCTCCTTTCa > 1:253187/1‑150 (MQ=255) tAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCaa > 1:1580517/1‑150 (MQ=255) tttCTTGCAATCTTATCCAATGTCTAATAGTATTGAGGGGTTAGATCATTCCTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCGGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGGCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAAt < 1:1485465/149‑1 (MQ=18) aTTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTTTTTAGCTGTTAGATAAGAACTCTATCTCAACATCAATAGACACCAACTCAGGTCTTGAATGTTAATAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAAt < 2:383927/150‑1 (MQ=25) aTTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGTCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAAt < 1:1157972/150‑1 (MQ=255) cTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGaa < 1:47656/150‑1 (MQ=255) tGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATa > 1:1135118/1‑150 (MQ=255) cAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGc > 1:1353880/1‑150 (MQ=255) cAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGc > 1:860025/1‑150 (MQ=255) actattAGCCAGTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGcc > 2:1676570/5‑150 (MQ=255) aaTGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGcc > 2:897158/1‑150 (MQ=255) tGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTGCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCaa > 2:1172143/1‑150 (MQ=255) aGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCa < 1:1278354/150‑1 (MQ=255) aGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCa > 1:411740/1‑150 (MQ=255) gCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCATAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCaa > 1:1129720/1‑150 (MQ=255) aCTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAAt < 2:54578/150‑1 (MQ=255) aCTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAAt < 2:1328715/150‑1 (MQ=255) gtcTATTAGTATTGAGCTGTTAGATTAGTTCTCTCTCACTCCAGGGAGAGCCACCAACTCAGGGGTTGAAAGTAAAAAACCGACGCAATGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAATATTca < 1:754132/148‑1 (MQ=21) gCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTcac < 2:1353880/150‑1 (MQ=255) aaTAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAA‑CAACAGAAAGTCGGTTTTTTTTCGTCCAGAATCACTCCTCCGTTCAAAAGTATATCCAACTCAAAATTCCCAcca > 2:1037329/1‑149 (MQ=21) tAGTATTGGGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTTGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTa < 1:361696/150‑1 (MQ=255) tATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTa < 2:217813/150‑1 (MQ=255) aTTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTAc < 1:1150567/150‑1 (MQ=255) aTTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTAc > 2:691345/1‑150 (MQ=255) ttGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCCGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGCCCGCATTTCAAATGATTAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTAca > 1:286774/1‑149 (MQ=25) tGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAATTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCt > 1:395854/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCtt > 2:1386221/1‑150 (MQ=255) gCTGTTAGATATGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTcc < 1:230281/150‑1 (MQ=255) gCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTcc > 2:1390728/1‑150 (MQ=255) gCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTcc < 1:691345/150‑1 (MQ=255) cTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCct > 1:1043033/1‑150 (MQ=255) tAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGc > 1:805880/1‑150 (MQ=255) aGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACCCCTATTACCTTCCTCTGCa > 1:1670012/1‑150 (MQ=255) gATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCAc > 1:707381/1‑150 (MQ=255) gATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCAc > 1:807233/1‑150 (MQ=255) aTAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACt > 2:790340/1‑150 (MQ=255) aTAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACt < 2:860025/150‑1 (MQ=255) aTAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACt < 1:1081918/150‑1 (MQ=255) ctctctCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACAt > 1:830165/1‑150 (MQ=255) ctctcACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCATATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTGTGCACTTACTCATTc < 2:396773/150‑1 (MQ=255) ctctcACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTc > 2:947439/1‑150 (MQ=255) ctctcACTAAAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGCTTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTc < 1:121492/150‑1 (MQ=255) tctcACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCg < 1:763902/150‑1 (MQ=255) tctcACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTATCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTAACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACAAATTCg > 1:1492053/1‑150 (MQ=255) ctcACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGATTAGCCAACTCAAATTTCACACCTATTACCTTCCTCTGCCCTTACACATTCGt > 2:743073/1‑150 (MQ=255) ctcACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGt < 2:1135118/150‑1 (MQ=255) tcACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGtt < 1:897158/150‑1 (MQ=255) cTCCAGCCAGAGACACCAACTCAGGGCTGGAAAGAAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACTTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTATGCACTTACACATTCGTTAAg > 2:619580/1‑150 (MQ=255) ccagccagAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAAGAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTc > 1:140793/1‑150 (MQ=255) ccagccagAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCGTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTc > 1:1314083/1‑150 (MQ=255) cagccagAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCa > 2:1277415/1‑150 (MQ=255) gccagAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTGAGCCCTCCTTTCAAATGAATAGCCAAATCAAAATTCACACCTATTACCTACCGCTGCACTTACACATTGGTTAAGTCata > 2:269553/1‑150 (MQ=37) gccagAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCata < 1:1386221/150‑1 (MQ=255) cagAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAACTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACAATCGTAAAGTAatata > 1:12156/1‑150 (MQ=255) gCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGtt > 1:1107298/1‑150 (MQ=255) caACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTGCGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGa < 1:1430552/150‑1 (MQ=255) aCTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACt < 1:1390728/150‑1 (MQ=255) aCTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACt < 2:411740/150‑1 (MQ=255) cTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATGCAGACCTCCTTGCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACCCCTATTACCTTCCTCTGCACTTACCCATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACtt > 2:426917/1‑150 (MQ=255) agtgCTGGAAAGTAAAAAAGCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATc < 2:12156/147‑1 (MQ=255) gggCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATcc < 1:967088/150‑1 (MQ=255) cTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCAAACCTATTACCTTCCTCAGCAATAACAAATTCGATAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCt > 1:291480/1‑150 (MQ=38) cTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTATCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACATTCCTCTCCACTTACACAGTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCt > 2:73214/1‑150 (MQ=255) ggAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTc > 2:595347/1‑150 (MQ=255) ggAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTc < 2:1154217/150‑1 (MQ=255) gacgtaaaaaaaCCGACTTTGCGTCGG‑TTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGa > 2:723188/7‑150 (MQ=255) gAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCg < 2:1534102/150‑1 (MQ=255) gAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCg < 2:813654/150‑1 (MQ=255) aaaGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGa > 1:1059704/1‑150 (MQ=255) aaGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGaa > 1:986580/1‑150 (MQ=255) gTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAaga > 1:94502/1‑150 (MQ=255) gTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAaga < 1:830228/150‑1 (MQ=255) tAAATAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGATTAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagag < 2:1560071/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCGACTTTGCGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagag > 1:1649561/2‑150 (MQ=255) aaaaaaaCCGACTTTGCGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagag > 2:441172/2‑150 (MQ=255) aaaaaaaCCGACTTTGCGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagag > 2:1139943/2‑150 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagaga < 1:678974/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCAAAGTCGGTTTTGTGACGTCCTGAGTCAGCCCTCCTGTCAAATGAATAGCCCCCGCAAACTTCACACCTATTACCTTCCGCTGCACTTACACCTTCGGTAAGGCAGATATGTTTTTGACGTCTCCGCTGCGAagagc > 1:938206/1‑149 (MQ=255) aaCCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGaca < 1:540339/150‑1 (MQ=255) ccGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACt > 2:1089211/1‑150 (MQ=255) cGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACGTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTa > 1:855455/1‑150 (MQ=255) gACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTAc > 1:1101113/1‑150 (MQ=255) aatcAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTAAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTAcc < 2:917005/147‑1 (MQ=255) aCGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTAcc > 1:572554/1‑150 (MQ=255) | ATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACC > NC_000913/3648213‑3648506 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |