Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,648,363 | 0 | A | C | 6.1% | 428.9 / 12.3 | 142 | noncoding (70/84 nt) | agrB | antisense sRNA antitoxin for the DinQ toxin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (72/60); new base C (6/3); total (78/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
AAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACCTGCA > NC_000913/3648221‑3648510 | aaGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGtt < 2:636328/150‑1 (MQ=255) ccctccGCGAGCTGAAGAAATCGCTAAATCTTGCAATGTTAGCCACTTGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGATCTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACTTTGCGTCGGttttttact < 2:309857/150‑4 (MQ=37) cctccGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACg > 1:1154217/1‑150 (MQ=255) 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tAAATAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGATTAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagag < 2:1560071/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCGACTTTGCGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagag > 2:441172/2‑150 (MQ=255) aaaaaaaCCGACTTTGCGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagag > 2:1139943/2‑150 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAagaga < 1:678974/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCAAAGTCGGTTTTGTGACGTCCTGAGTCAGCCCTCCTGTCAAATGAATAGCCCCCGCAAACTTCACACCTATTACCTTCCGCTGCACTTACACCTTCGGTAAGGCAGATATGTTTTTGACGTCTCCGCTGCGAagagc > 1:938206/1‑149 (MQ=255) aaCCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGaca < 1:540339/150‑1 (MQ=255) cGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACGTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTa > 1:855455/1‑150 (MQ=255) gACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTAc > 1:1101113/1‑150 (MQ=255) aatcAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTAAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTAcc < 2:917005/147‑1 (MQ=255) aCGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTAcc > 1:572554/1‑150 (MQ=255) aaaGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACCTGca > 2:546931/1‑150 (MQ=255) aaaGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACCTGca > 2:38459/1‑150 (MQ=255) | AAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGCACTTACACATTCGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACCTGCA > NC_000913/3648221‑3648510 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |