| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,658,004 | 0 | A | G | 8.6% | 516.7 / 30.7 | 185 | noncoding (51/69 nt) | arrS | antisense sRNA ArrS, function unknown |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (87/82); new base G (7/9); total (94/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.08e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ATAAGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCGTTGATTACATTGCATAAATATCCGTGTCTCCAGACGCTATATAAAAACCTGAAGACATGAATGCGTTATTTACTCAGGTAATTTCAATGCGTTAAAAGAAAGCTGGCAATCCAATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTAACTTTTTGTTTGCTATTT > NC_000913/3657857‑3658153 | aTAAGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCTTTGATTACATTGCATAAATATCCGTGTCTCCAGAAGCTATATAAAAACCTGAAGACATGAATGCGTTATTTACTCAGGTAATTTCAATGCGTTAAAAGAAATCTGGCAATCCAAt > 2:1388114/1‑150 (MQ=255) aaGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCGTTGATTACATTGCATAAATATCCGTGTCTCCAGACGATATATAAAAACCTGATGACATGAATGCGTTATTTAATCAGGTAATTTCAATGAGTTAAAAGAAAGCTGGCAATCCAATTg > 1:215217/1‑150 (MQ=255) aGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCGTTGATTACATTGCATAAATATCCGTGTCTCCAGACGCTATATAAAAACCTGAAGACATGAATGCGTTATTTACTCAGGTAATTTCAATGCGTTAAAAGAAAGCTGGCAATCCAATTGc > 2:553333/1‑150 (MQ=255) 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acTGGCAATTGGATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTaa > 1:1141928/2‑144 (MQ=255) cTGGCAATCCAATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTAACTTtttg > 2:1106092/1‑150 (MQ=255) cTGGCAATCCAATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTAACTTtttg < 1:197350/150‑1 (MQ=255) ggCAATCCAATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTAACTTtttgtt > 1:1204263/1‑150 (MQ=255) cAATCCAATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCTAACGTTAACTTtttgtttg < 1:354602/150‑1 (MQ=255) 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cAATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTAACTTTTTGTTTGCTAtt < 2:1267743/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTAACTTTTTGTTTGCTAttt > 2:210829/1‑150 (MQ=255) | ATAAGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCGTTGATTACATTGCATAAATATCCGTGTCTCCAGACGCTATATAAAAACCTGAAGACATGAATGCGTTATTTACTCAGGTAATTTCAATGCGTTAAAAGAAAGCTGGCAATCCAATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTAACTTTTTGTTTGCTATTT > NC_000913/3657857‑3658153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |