| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,906,826 | T→C | 8.4% | intergenic (‑259/+27) | bglG ← / ← phoU | transcriptional antiterminator of the bgl operon/negative regulator of PhoR/PhoB two‑component regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,906,826 | 0 | T | C | 8.4% | 361.2 / 17.6 | 131 | intergenic (‑259/+27) | bglG/phoU | transcriptional antiterminator of the bgl operon/negative regulator of PhoR/PhoB two‑component regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/64); new base C (3/8); total (59/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGCGGTCGCCAAT > NC_000913/3906678‑3906975 | tataACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAAtt > 2:1204127/1‑150 (MQ=255) cATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCACAGCGCTATTGATAAAAATCTGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTAAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAACTTATTg > 2:268893/1‑150 (MQ=255) cATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTTACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTg > 1:147078/1‑150 (MQ=255) cATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTg > 2:38239/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGa > 2:1710222/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGAGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGa < 2:1284764/150‑1 (MQ=255) aGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGAtt < 1:701199/150‑1 (MQ=255) aGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGAtt < 2:432066/150‑1 (MQ=255) ggTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTTTTGATAAAAATATGACCATGCTCGCTGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAACTTATTTATTGGGAttt < 2:916884/150‑1 (MQ=255) ggTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGAttt < 1:1060648/150‑1 (MQ=255) ttCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGt < 1:453259/150‑1 (MQ=255) tCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGtt < 1:653081/150‑2 (MQ=255) tCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGAT‑AAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGtta < 1:759039/150‑3 (MQ=255) ggAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGTATTTGTCTg > 2:1486136/1‑150 (MQ=255) ggAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTg > 2:869859/1‑150 (MQ=255) ggAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTg > 1:555232/1‑150 (MQ=255) ggAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTg > 2:1307249/1‑150 (MQ=255) gAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTgg < 2:981914/150‑1 (MQ=255) aattaattTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTAGTAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTg < 2:748839/150‑1 (MQ=255) taatttaattGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCTCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAat < 2:508986/150‑1 (MQ=255) aatttaattGCGTTCAGAGAAAATAGCAATGCGATATTGAAAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTAATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAatt < 1:244321/150‑1 (MQ=255) aatttaattGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAatt > 2:506882/1‑150 (MQ=255) atttaattGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAatta > 1:1119809/1‑150 (MQ=255) ttaattGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAattatt < 1:1634799/150‑1 (MQ=255) taattGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTAttt < 2:1355087/150‑1 (MQ=255) attGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGt > 1:1506253/1‑150 (MQ=255) tGCGTTCAGTGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATTCTCGCATTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCg < 2:306886/150‑1 (MQ=255) tGCGTTCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCg > 2:227786/1‑150 (MQ=255) tGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCg > 1:1319787/1‑150 (MQ=255) gCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGc < 1:376466/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCt < 2:1319787/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCt < 1:38239/150‑1 (MQ=255) gTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTa < 1:162203/150‑1 (MQ=255) aaTAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCg < 2:263238/150‑1 (MQ=255) gCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAATTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCcag < 2:1473838/150‑1 (MQ=255) gCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCcag > 1:846263/1‑150 (MQ=255) cAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCcagc > 1:1422705/1‑150 (MQ=255) cAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATACCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCcagc > 1:1630963/1‑150 (MQ=255) aaTGCTCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCcagca < 2:30263/150‑1 (MQ=255) gcgcTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGtt < 1:1214063/150‑1 (MQ=255) gcTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTa > 1:438512/1‑150 (MQ=255) cTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTTGGAATTTATAATGTTATATATAACAAATCCCAATATTTTAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGAAGTTTAt > 1:102692/1‑150 (MQ=255) aTTTATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATcc < 2:103489/150‑1 (MQ=255) aTTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATcc < 1:530656/150‑1 (MQ=255) ttGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCa < 1:295322/150‑1 (MQ=255) ttGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCa < 2:614811/150‑1 (MQ=255) ttGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCa < 2:903500/150‑1 (MQ=255) aaTATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCg < 1:1718605/150‑1 (MQ=255) aaTATGACAATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCg < 2:305461/150‑1 (MQ=255) tGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCAc > 2:478877/1‑150 (MQ=255) gACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCAcc > 1:1296135/1‑150 (MQ=255) ccATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGa > 1:592926/1‑150 (MQ=255) ccATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGa < 1:1204127/150‑1 (MQ=255) cATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTTTAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTTGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGAc < 1:1240213/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACg < 2:1535453/150‑1 (MQ=255) ttattaACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAATTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAAt < 2:1540699/150‑1 (MQ=255) ttattaACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAAt > 1:463123/1‑150 (MQ=255) tattaACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTTAATTATTTGTCTCTATCTTTCCCCGACAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCTACGTGACGGAAAta > 1:221924/1‑149 (MQ=255) attaACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTATGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATcc > 1:1533667/1‑150 (MQ=255) ttaACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCt > 1:759761/1‑150 (MQ=255) ttaACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTATCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCCCAGACGTGACGGAAAACCt > 2:31222/1‑150 (MQ=255) aaCTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGc > 1:1343848/1‑150 (MQ=255) aaCTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGc > 1:1049876/1‑150 (MQ=255) aaCTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTCTTATTTTTATGGTTAATTATTTTTCTCTATCTTTAACCGCCAGCAGTTTATGAATCTCATCTCCACAGACTTGACGGAAATCCTGc > 1:1034463/1‑150 (MQ=255) aaCTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGGTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGc < 1:1486136/150‑1 (MQ=255) cTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGATATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCAAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGccc > 2:191964/1‑150 (MQ=255) tgtgTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCtt > 1:1360697/1‑150 (MQ=255) gtgtAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTc < 2:1714434/150‑1 (MQ=255) tgtAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATTACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCTCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCa < 2:96410/150‑1 (MQ=255) tgtAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCa > 2:1223151/1‑150 (MQ=255) tgtAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCa > 2:231763/1‑150 (MQ=255) tgtAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCa < 1:1009042/150‑1 (MQ=255) ttttAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACgtag < 1:628955/150‑1 (MQ=255) tttAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTTGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACgtagt < 2:1506253/150‑1 (MQ=255) ttAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACgtagta < 1:987042/150‑1 (MQ=255) ggAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTagaa > 2:1678062/1‑150 (MQ=255) ggAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTagaa < 2:1642119/150‑1 (MQ=255) ggAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTagaa < 2:1472204/150‑1 (MQ=255) ggAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTagaa > 2:1309732/1‑150 (MQ=255) aaTTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTagaaga > 2:1551618/1‑150 (MQ=255) aaTTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTagaaga > 2:1279394/1‑150 (MQ=255) aaTTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTagaaga > 2:389437/1‑150 (MQ=255) aTTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCATTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGAt > 1:1365205/1‑150 (MQ=255) tataAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATaaa > 1:1140504/1‑150 (MQ=255) tataAAGTTATATATAACAAATCCCAAGAATTTAGTTATTGGGATTTGGCTGGTGATTTATTTGTCGCTATCTTTCCCCTCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATaaa > 1:584479/1‑150 (MQ=255) ttATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACaa < 1:1307249/150‑1 (MQ=255) taACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATATGTAGCTATATTTCCACGCAAGCAATTTATCAAGCTCATCGACACCGACGTAACAGAAAACATACCACTTCACGTAGTAGAACATAAACTCACAAATATTCt > 2:68172/1‑150 (MQ=255) aCAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTTATTTATTTGTCGCTATCTTTACCCGCTAGCAGTTTATACAGCTCCTCGCCACCGACGTGACGGAACTCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTgg < 1:268893/150‑1 (MQ=255) aCAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCGTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTgg > 1:1196747/1‑150 (MQ=255) cAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGc > 2:743657/1‑150 (MQ=255) cAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGc < 2:438512/150‑1 (MQ=255) cAAATCCCAATAACTTAATTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGc > 1:828182/1‑150 (MQ=255) aTCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGc < 2:592926/150‑1 (MQ=255) aTCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGc > 2:1645713/1‑150 (MQ=255) ccAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGCGGt < 2:1047307/150‑1 (MQ=255) aaatTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGATTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATACTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGCTGTCGcc > 1:607883/2‑150 (MQ=255) aatTACGTTATTGGGATTTGTCTGGTGACTTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCACCTCCTCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGCGGTCGCCa < 2:120660/150‑1 (MQ=255) atTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGCGGTCGCCaa > 1:1109541/1‑150 (MQ=255) ttAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGCGGTCGCCAAt < 1:1052349/150‑1 (MQ=255) ttAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGCGGTCGCCAAt > 1:47977/1‑150 (MQ=255) | TATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTATATATAACAAATCCCAATAATTAAGTTATTGGGATTTGTCTGGTGAATTATTTGTCGCTATCTTTCCCCGCCAGCAGTTTATCCAGCTCATCGCCACCGACGTGACGGAAATCCTGCCCCTTCACGTAGTAGAAGATAAACTCACAAATATTCTGGCAGCGGTCGCCAAT > NC_000913/3906678‑3906975 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |