| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,959,924 | A→T | 9.0% | intergenic (‑111/+88) | ppiC ← / ← yifN | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C (rotamase C)/PemK toxin family pseudogene |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,959,924 | 0 | A | T | 9.0% | 386.1 / 18.7 | 140 | intergenic (‑111/+88) | ppiC/yifN | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C (rotamase C)/PemK toxin family pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (63/64); new base T (8/5); total (71/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
TTTTACAAGGATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTGCAACCA > NC_000913/3959775‑3960073 | taaaaGGATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAGTAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGAATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAAt > 1:527981/4‑150 (MQ=255) cAAGGATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATcc > 2:865231/1‑150 (MQ=255) cAAGGATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATcc < 2:714804/150‑1 (MQ=255) cAAGGATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATcc > 1:938221/1‑150 (MQ=255) aaGGATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCg < 2:899975/150‑1 (MQ=255) aGGATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCgg > 2:1427579/1‑150 (MQ=255) gATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGc < 2:370045/150‑1 (MQ=255) atGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGATTTTCCGGGCttt < 1:803571/150‑2 (MQ=255) tGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCg > 2:1471700/1‑150 (MQ=255) tcAGTGGGGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGGTCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGATTTTCCGGGCttttg < 2:158826/149‑4 (MQ=255) gCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGc > 1:1101029/1‑150 (MQ=255) cAGGGCTGCTGCTCTTTTTTCTATGATCGTTCCTTGAGTTAATAATTGGCAGGCGTCGATTTTAGAATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGGCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCa < 2:158499/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTTTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAgg < 1:313080/150‑1 (MQ=255) tgctgctgcTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGt > 1:1294789/1‑150 (MQ=255) tgctgctgTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATTATCCGCAGATGCTTACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTacc > 2:908304/1‑150 (MQ=255) gctgctgTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCt > 1:1645555/1‑150 (MQ=255) tgctgTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCa > 1:454766/1‑150 (MQ=255) ctgTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAg > 1:586968/1‑150 (MQ=255) ttttGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGga > 1:977629/1‑150 (MQ=255) ttttGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGga < 2:385337/150‑1 (MQ=255) gCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGaaa > 1:1107859/1‑150 (MQ=255) ccATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGaaaa > 1:1162310/1‑150 (MQ=255) ccATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGaaaa > 1:417604/1‑150 (MQ=255) cATGATCGGTCCTTTAGTGTATAATTGTCAGGAGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAAc < 2:1433126/150‑1 (MQ=255) aTCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAACCTTAg > 1:1520412/1‑150 (MQ=255) cGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAggg < 2:1002449/150‑1 (MQ=255) cGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGGCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAggg < 2:1015881/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGc > 2:397913/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGATTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGcc > 1:88045/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGcc < 2:134772/150‑1 (MQ=255) tGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGcc < 2:498761/150‑1 (MQ=255) tGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAACCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGcc < 2:674986/150‑1 (MQ=255) gAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCt < 1:1265224/150‑1 (MQ=255) taatTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACa < 1:1404620/150‑1 (MQ=255) aatTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACaa < 1:612850/150‑1 (MQ=255) aatTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCAGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACaa > 2:334892/1‑150 (MQ=255) tGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGATTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGt < 2:88045/150‑1 (MQ=255) cgATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCggg < 2:454766/150‑1 (MQ=255) gATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCgggg > 1:648664/1‑150 (MQ=255) ttttAGGATGATACTCAGATTCTTACGTTATTGTGAGTCTGGGATTGTATTGTACATATATGGCAAATGAACTGATAATCCGGGGTTCGCATGTCACTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGTGCTACAAAGTCTTTATCGTGGAt < 2:650456/150‑1 (MQ=255) tAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGt > 1:1350585/1‑150 (MQ=255) aGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGtt > 2:358769/1‑150 (MQ=255) aGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGtt > 1:1456189/1‑150 (MQ=255) gCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGtta > 1:1377060/1‑150 (MQ=255) gCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGtta < 2:1395689/150‑1 (MQ=255) gATCCGCAGATGCTAACGTAATT‑TCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGttatttta > 2:1605128/1‑150 (MQ=255) cGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTg > 1:1591087/1‑150 (MQ=255) cGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGGCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTg < 2:586968/150‑1 (MQ=255) tGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGTAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTAGAAAGTCATTATCGGGGATGGGTATTTTATTGTCAAtt < 1:68029/150‑1 (MQ=255) cTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGTGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTa < 2:1234464/150‑1 (MQ=255) cTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTa < 1:1385327/150‑1 (MQ=255) cTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTa > 1:472492/1‑150 (MQ=255) atAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCTGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTa < 2:1325080/149‑1 (MQ=255) aaCGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATg > 1:1021262/1‑150 (MQ=255) aaCGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATg < 2:648664/150‑1 (MQ=255) cGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAg < 2:1477276/150‑1 (MQ=255) gTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGc < 1:865231/150‑1 (MQ=255) gTAATT‑TCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCg < 1:1605128/150‑1 (MQ=255) tAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGTGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCg < 2:1221149/150‑1 (MQ=255) tAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCg > 2:809933/1‑150 (MQ=255) aaTTGTCAGTCAGGGAGTGGCAGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGACATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGataga > 1:627227/1‑146 (MQ=255) tGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGatat < 1:1385924/150‑1 (MQ=255) cagtcagGGAGTGGCGTGTACATATATCGCAAAAGCCCGGAAAATCAGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGc < 2:1101029/150‑1 (MQ=255) cagtcagGGAGGGGCTTGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGc < 2:1256778/150‑1 (MQ=255) agtcagGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCa > 1:299918/1‑150 (MQ=255) ggAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCattgatt < 2:1591087/150‑1 (MQ=255) gAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCattgattg > 2:150286/1‑150 (MQ=255) gTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGAc < 1:814880/150‑1 (MQ=255) gTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGAc < 2:113701/150‑1 (MQ=255) tGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACt > 1:1712056/1‑150 (MQ=255) cTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTtga > 1:500032/1‑150 (MQ=255) ggTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTtgatg < 2:1587257/150‑1 (MQ=255) gTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTtgatga < 1:397913/150‑1 (MQ=255) aCATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGAcc > 1:1488615/1‑150 (MQ=255) cATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCg < 2:1517117/150‑1 (MQ=255) cATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTAAGGGCTACAAAGGCATAATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCg > 1:977639/1‑150 (MQ=255) tatatGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGTAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCTcc > 1:458700/1‑150 (MQ=255) tatatGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGcc > 2:1153663/1‑150 (MQ=255) tatGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCATCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTAGTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGccat > 1:938787/1‑148 (MQ=255) tGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTAAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCctct < 1:1502290/150‑1 (MQ=255) cctgcgaaGCCCGGATTTTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATTTGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCctct > 2:1348540/7‑150 (MQ=255) cctgcgaaGCCCGGATTTTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCctct > 1:1537047/7‑150 (MQ=255) ctgcgaaGCCCGGATTTTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCTCCCTCTg > 1:259664/6‑150 (MQ=255) ctgcgaaGCCCGGATTTTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTg > 2:1197187/6‑150 (MQ=255) gcgaaGCCCGGATTTTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTa < 2:259664/147‑1 (MQ=255) cAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACCAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGCGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTa > 2:255567/1‑150 (MQ=255) cAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCCTTATCGGGGATGCTTATGTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTa > 1:890253/1‑150 (MQ=255) cAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTa > 1:1307830/1‑150 (MQ=255) cAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTACGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATCGGCTACAAAGCCATGATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCGCTGtt > 1:75343/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATg > 2:177478/1‑150 (MQ=255) aaGCCCGGATTTTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCTTCTGTATGt > 2:371799/1‑150 (MQ=255) aGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTc < 2:1162310/150‑1 (MQ=255) cccGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGGCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTg < 2:59798/150‑1 (MQ=255) cccGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTTTATGTCTg > 1:1429176/1‑150 (MQ=255) cccGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTg > 2:804100/1‑150 (MQ=255) ccGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTGc > 2:1183786/1‑150 (MQ=255) ggAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTGcaa > 2:646775/1‑150 (MQ=255) gAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTGcaac < 2:1712056/150‑1 (MQ=255) aaaTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGTGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTGcaacca < 2:1104264/150‑1 (MQ=255) aaaTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTGcaacca < 2:299918/150‑1 (MQ=255) | TTTTACAAGGATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCTGCAACCA > NC_000913/3959775‑3960073 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |