Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,002,402 | G→A | 9.0% | intergenic (+26/+17) | corA → / ← yigF | magnesium/nickel/cobalt transporter/DUF2628 family putative inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,002,402 | 0 | G | A | 9.0% | 430.8 / 17.8 | 143 | intergenic (+26/+17) | corA/yigF | magnesium/nickel/cobalt transporter/DUF2628 family putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/69); new base A (9/4); total (70/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATA > NC_000913/4002253‑4002549 | tGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTgg > 2:827379/1‑150 (MQ=255) tGGCATGAACTTTGAGTTTAAGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGAGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTgg < 2:871879/150‑1 (MQ=255) ggCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTggg > 1:1000905/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |