| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,006,041 | C→A | 5.0% | P60T (CCT→ACT) | recQ → | ATP‑dependent DNA helicase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,006,041 | 0 | C | A | 5.0% | 398.1 / 3.7 | 126 | P60T (CCT→ACT) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/56); new base A (4/3); total (67/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CCGGAGCTAAACAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGTGATGACA > NC_000913/4005895‑4006190 | ccGGAGCTAAACAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTg < 1:1286523/150‑1 (MQ=255) taGCTAAACATGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACAAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCt < 2:982854/149‑1 (MQ=255) tAAACAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTAtt > 2:800187/1‑150 (MQ=255) aaaCAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTg < 2:640945/150‑1 (MQ=255) aCAGGTTTTACAAGAAAACTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAAATAACGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCAATAAAACTTGGGGCGGAAAATAACTTTTCTATAAAATCAATGCCTTATTGCt > 1:289728/1‑150 (MQ=255) cAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTa < 2:1543823/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTa < 2:741124/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGCCGGAAAATCCCTTTGCTAACAAATCCCTGCCTTATTGCTa > 1:992260/1‑150 (MQ=255) cAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGACCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATAAAATCCCTGCCTTATTGCTa < 1:716315/150‑1 (MQ=255) ttttACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAAATATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACg < 2:467638/150‑1 (MQ=255) tACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGcc > 2:1311747/1‑150 (MQ=255) aGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCACCTCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTAc > 2:1394773/1‑150 (MQ=255) aGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTAc > 1:1614619/1‑150 (MQ=255) aaCCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGt > 1:1366158/1‑150 (MQ=255) aaCCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGt > 1:820108/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGgt < 2:571017/150‑1 (MQ=255) tttGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGgtt < 1:709308/150‑1 (MQ=255) tGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATGGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCC‑TACCGTGgttgtt < 2:70987/150‑1 (MQ=255) ggCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGgttgtt > 2:465917/1‑150 (MQ=255) ggCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCGTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGgttgtt > 1:197884/1‑150 (MQ=255) gCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGTAAATCCCTTTGCTATCAAATCACTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGttt > 2:852841/1‑150 (MQ=255) cTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTc > 2:1376889/1‑150 (MQ=255) cTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATAGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTc < 1:1027525/150‑1 (MQ=255) ccAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCAcc < 2:1617990/150‑1 (MQ=255) cAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTg < 2:1705173/150‑1 (MQ=255) gTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGAt > 1:1421522/1‑150 (MQ=255) gCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGt > 2:1522665/1‑150 (MQ=255) cccGGCCAGGAAGAAAATATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGGGGCGGAAAATCCCTTGGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTACACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTtg < 1:955965/150‑1 (MQ=255) ccGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTtga > 2:43169/1‑150 (MQ=255) ccGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTtga < 1:882193/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTtgat < 2:375508/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTtgat < 1:1522665/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTtgatg < 1:592297/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGaa < 1:1674218/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGaaa > 1:364495/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGaaa > 1:1523562/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAAGCCCTTTGCTATCAAATCACTGACTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGaaa > 2:1106816/1‑150 (MQ=255) aGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGTCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAg > 2:1056252/1‑150 (MQ=255) aGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAg > 2:209343/1‑150 (MQ=255) gaagaaATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGACTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGAt > 2:867004/1‑150 (MQ=255) gaagaaATTATCGACAATGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGAGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTATCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGaa > 2:932488/1‑149 (MQ=255) aTTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTg > 2:635508/1‑150 (MQ=255) ttATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTgg > 2:1278482/1‑150 (MQ=255) 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cTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGa > 1:534110/1‑150 (MQ=255) cTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGa > 2:735012/1‑150 (MQ=255) tCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGt < 2:1282114/150‑1 (MQ=255) tCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGt > 1:891854/1‑150 (MQ=255) tCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGt < 2:1446857/150‑1 (MQ=255) tCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGt < 2:1523562/150‑1 (MQ=255) cAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGtg > 1:1202064/1‑150 (MQ=255) aaaTCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGtga < 2:1366158/150‑1 (MQ=255) aaaTCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGtga < 1:742249/150‑1 (MQ=255) aaaTCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGtga > 1:1030915/1‑150 (MQ=255) aTCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGtgatg < 1:1335960/150‑1 (MQ=255) ccTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGCCGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGTGATGACa > 1:1543569/1‑150 (MQ=255) | CCGGAGCTAAACAGGTTTTACAAGAAACCTTTGGCTACCAACAGTTTCGCCCCGGCCAGGAAGAAATTATCGACACTGTGCTTTCCGGCCGCGATTGCCTCGTCGTCATGCCCACTGGTGGCGGAAAATCCCTTTGCTATCAAATCCCTGCCTTATTGCTAAACGGCCTTACCGTGGTTGTTTCACCGCTGATTTCGTTGATGAAAGATCAGGTGGATCAACTGCAAGCCAACGGCGTGGCGGCGGCGTGCCTTAACTCGACGCAAACCCGCGAACAGCAACTTGAAGTGATGACA > NC_000913/4005895‑4006190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |