| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 429,554 | A→T | 7.2% | Y17F (TAT→TTT) ‡ | secF → | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 429,554 | 0 | A | T | 7.2% | 384.8 / 12.9 | 137 | Y17F (TAT→TTT) ‡ | secF | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (60/66); new base T (6/4); total (66/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.16e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CGACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGCT > NC_000913/429406‑429702 | cGACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTAt < 2:349621/150‑1 (MQ=255) gACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCCCGGCCGTAAAGTCTATg > 2:632285/1‑150 (MQ=255) gACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATg > 2:1481037/1‑150 (MQ=255) aCGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGa < 2:352359/150‑1 (MQ=255) cGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCAGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATCTACTGTTGCACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGAc > 1:350794/1‑150 (MQ=255) tCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACtt < 2:1347696/150‑1 (MQ=255) tCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACtt > 2:484830/1‑150 (MQ=255) cGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACttt > 1:1086797/1‑150 (MQ=255) gATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTa < 1:486320/150‑1 (MQ=255) aTGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTTCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTAt < 2:1711515/150‑1 (MQ=255) tGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATg < 2:386121/150‑1 (MQ=255) gTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCATAGACTTTacgg < 1:1384153/150‑4 (MQ=255) tttACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATgcg < 1:341236/150‑1 (MQ=255) ttACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATgcgc < 1:1356659/150‑1 (MQ=255) ttACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATgcgc < 2:796448/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCATAAAGTCATAGACTTTacggccgt < 1:1690670/150‑8 (MQ=255) cgcgATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTggg > 2:1630705/1‑150 (MQ=255) cgATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGac < 1:508055/150‑1 (MQ=255) tCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTgg < 2:805734/150‑1 (MQ=255) cGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTggg > 1:702155/1‑150 (MQ=255) ggTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGc < 2:1277497/150‑1 (MQ=255) ggTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGc > 1:859547/1‑150 (MQ=255) ggTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCGGGCAATCTGAGGAGGGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGc < 2:1284281/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTc > 1:909116/1‑150 (MQ=255) gcgTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCAGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATTCTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCg > 1:235468/1‑150 (MQ=255) cgTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTTTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCgg < 1:1429540/150‑1 (MQ=255) tGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACCGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCa < 1:1449498/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTATAAGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGGCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctg < 1:119120/150‑1 (MQ=255) tGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCAAGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCAGCTCTGGTctgctg > 2:1073524/1‑150 (MQ=255) gCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGt > 2:1009554/1‑150 (MQ=255) gCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGt < 2:489147/150‑1 (MQ=255) cTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGtt < 2:169369/150‑1 (MQ=255) cTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGtt < 1:676277/150‑1 (MQ=255) tataTGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTa > 2:1674243/1‑150 (MQ=255) cggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctg < 1:1309317/150‑1 (MQ=255) cggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctg > 1:649915/1‑150 (MQ=255) ggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctgc < 1:828528/150‑1 (MQ=255) ggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctgc < 2:205157/150‑1 (MQ=255) ggcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACCAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctgc < 2:194021/150‑1 (MQ=255) gcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctgct > 1:43590/1‑150 (MQ=255) gcAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctgct > 2:1266057/1‑150 (MQ=255) gcAAGCGAGTCAAGAAGATGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctgct < 2:946955/150‑1 (MQ=255) cgcgTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGt < 1:732608/150‑1 (MQ=255) gcgTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGtt < 1:1204101/150‑1 (MQ=255) cgTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGtga > 1:42653/1‑148 (MQ=255) cgTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGATGTTAATCGCTGCTATCGtta > 1:229192/1‑150 (MQ=255) cAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCTCAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTGCGGCATCTCTGGGCTGCTGTTAAGCGCTGCTATCGttattt > 1:99073/1‑149 (MQ=255) cAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGttatta > 1:1121685/1‑150 (MQ=255) cAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGttatta < 1:964653/150‑1 (MQ=255) cAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGGTAATCGCTGCTATCGttatta > 2:1397771/1‑150 (MQ=255) aagaagCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTtattat > 2:1705085/1‑150 (MQ=255) agaagCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATg > 2:363718/1‑150 (MQ=255) gCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTTGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCg > 2:1418250/1‑150 (MQ=255) gCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCg > 1:1134969/1‑150 (MQ=255) cTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGt > 2:1108919/1‑150 (MQ=255) gTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTgc > 1:466988/1‑150 (MQ=255) gTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTgc < 1:1481037/150‑1 (MQ=255) cAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTgcgc > 1:551488/1‑150 (MQ=255) tGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCtt < 1:420418/150‑1 (MQ=255) taggatggCGAGGTGGCACAGGAATATAATGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTGCGGCATCTCTGGTCTGCGGTTATTCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCttt < 2:1251113/143‑1 (MQ=255) gTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTg > 2:199598/1‑150 (MQ=255) gCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTggg < 2:1085050/150‑1 (MQ=255) gCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGGCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTggg < 1:940571/150‑1 (MQ=255) tgtgGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCt < 2:551488/150‑1 (MQ=255) ggggCACAGGAATATACTGTTGAACAACTACACCACGGCCGTAAAGTCACTGACTTTATGCGCTGGGACTAGTGTGCTTTCGGCTTCTCTGGTCTGCTGTTTCTCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTg < 1:249140/148‑1 (MQ=255) tgGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCTCGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTgg < 2:1455253/150‑1 (MQ=255) tgGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTgg > 1:652622/1‑150 (MQ=255) ggCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGa > 2:1115859/1‑150 (MQ=255) ggCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGa < 1:1115859/150‑1 (MQ=255) caGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTc < 2:1134969/150‑1 (MQ=255) caGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTc < 1:1566931/150‑1 (MQ=255) gtaaTATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGTCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATgggg < 1:822512/116‑2 (MQ=255) ggAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGc > 2:822512/1‑118 (MQ=255) gAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCAcc < 1:544126/150‑1 (MQ=255) taCTGTTGAACAACTAAACCCCGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTAGTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCggtgg > 2:821292/1‑150 (MQ=255) taCTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCggtgg < 2:51601/150‑1 (MQ=255) caacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTAtt < 1:1231813/150‑1 (MQ=255) aacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTg > 1:960658/1‑150 (MQ=255) aacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTg < 2:43590/150‑1 (MQ=255) acTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGa < 1:574752/150‑1 (MQ=255) cTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGaa < 1:1009554/150‑1 (MQ=255) aaaCCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGTTGTTAGGGGTATTGAAAt > 2:306453/1‑150 (MQ=255) aaCCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAAtt < 1:199598/150‑1 (MQ=255) aaCCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCAGCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAAtt < 2:702155/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTAc < 1:1705085/150‑1 (MQ=255) cACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACg < 2:42055/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGGCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGc < 1:1104125/150‑1 (MQ=255) cGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCt > 1:207266/1‑150 (MQ=255) gcgcatAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGAAGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACtctc > 1:278982/6‑150 (MQ=255) cgcatAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCTTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCg > 2:12927/5‑150 (MQ=255) cgcatAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCg > 2:661633/5‑150 (MQ=255) ccGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGATGGTTTACACCGGTGGTACGGTATTTAAAATTCCGcacaa > 2:1216073/1‑146 (MQ=255) catAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGaa > 2:1188775/3‑150 (MQ=255) catAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTCGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACCGTTATTGAAATTACGCTCGaa > 2:776757/3‑150 (MQ=255) cGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTTTTGAAATTACGCTCGaa > 1:1512752/1‑150 (MQ=255) tccaggcTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTTATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGTGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGaaaa < 2:601753/144‑1 (MQ=255) tAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGaaaa < 2:909116/150‑1 (MQ=255) cTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGc > 2:1182577/1‑150 (MQ=255) cTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGc > 2:311847/1‑150 (MQ=255) tATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGCt < 2:743052/150‑1 (MQ=255) | CGACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGCT > NC_000913/429406‑429702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |