Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 665,094 | G→C | 5.1% | P33A (CCT→GCT) | rlpA ← | septal ring protein, suppressor of prc, minor lipoprotein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 665,094 | 0 | G | C | 5.1% | 325.4 / 6.0 | 97 | P33A (CCT→GCT) | rlpA | septal ring protein, suppressor of prc, minor lipoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/40); new base C (3/2); total (54/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
AGTCCCGCCTGGCTAAATCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGTGGGTGTGGATTGAC > NC_000913/664946‑665243 | aGTCCCGCCTGGCTAAATCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGATAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGc > 1:311833/1‑150 (MQ=255) ccGCCTGGCTAACTCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTAAAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCg < 2:1568234/150‑1 (MQ=255) cGCCTGGCTAAATCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCgg > 2:1413327/1‑150 (MQ=255) cGCCTGGCTAAATCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCgg > 2:642719/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCTAAATCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGt < 1:694939/150‑1 (MQ=255) tGGCTAAATCGAGACGGATGCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCGTGCAATCCTGATATGCCGTCGCGTGCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGCCTGCGGTatg < 1:1235692/150‑3 (MQ=255) ggCTAAATCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGCCTGCGGTatgt < 1:1052926/150‑4 (MQ=255) cTAAATCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTAAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACtt > 1:863845/1‑150 (MQ=255) cTAAATCGAGACGGATCCTGCACGAATTTGTAGCTTTTAACGTCGCCCAGGTAATCCTGATATCCCGTCGCGTACAGTAGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCCCTAATTACAACTATAGGGCCGTAACATACCGCAGGCTGCGGTacacat > 1:893886/1‑148 (MQ=255) aTCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CGCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACCCTTACCg > 2:88176/1‑150 (MQ=255) aTCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCg < 2:927570/150‑1 (MQ=255) cGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTc > 2:439075/1‑150 (MQ=255) cGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTc > 2:1405908/1‑150 (MQ=255) gATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGACGTCGCTTTCACTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCAGTTACATACCGCAGGCTGCGGTCCACTTACCGTCTGTTGCt > 1:70533/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGAc < 2:1419343/150‑1 (MQ=255) cTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGAcc < 1:1676255/150‑1 (MQ=255) cGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACcatcat > 2:237372/1‑150 (MQ=255) cGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACcatcat < 1:1093925/150‑1 (MQ=255) cGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACcatcaa > 2:451862/1‑149 (MQ=255) cGATTTTGTAGCTTTAACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGTCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACcatcat < 1:235178/150‑1 (MQ=255) tttGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCt < 1:750976/150‑1 (MQ=255) ttGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑GCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTATGTTTCTGACCATCATAGCtt > 1:1493461/1‑150 (MQ=255) tGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTg < 1:1462077/150‑1 (MQ=255) tGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTg > 2:145670/1‑150 (MQ=255) gTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGt < 1:642719/150‑1 (MQ=255) aGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTAc > 1:1160528/1‑150 (MQ=255) gCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACa > 2:541415/1‑150 (MQ=255) cTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTTATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACAt > 1:1079165/1‑150 (MQ=255) cTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTAAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CGCCGCTAATTTAAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTAAACTTAACGTCTGATGCTGACCATCATCGCTTGttaat > 1:1058052/1‑146 (MQ=255) tACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCcg < 2:1023608/150‑1 (MQ=255) ccGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCcgcg < 2:779171/150‑1 (MQ=255) ccGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCcgcg > 2:1266633/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGc > 1:444055/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGCGCAt > 1:80710/1‑150 (MQ=255) cgcTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCAtt > 1:358145/1‑150 (MQ=255) gcTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTc > 2:378617/1‑150 (MQ=255) gcTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTc > 2:1161115/1‑150 (MQ=255) cTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTcc < 2:164048/150‑1 (MQ=255) cTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTcc > 2:1443915/1‑150 (MQ=255) cTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTcc < 2:1264504/150‑1 (MQ=255) cTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCAGTTGCAGACCATCCTCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTcc > 2:1283353/1‑150 (MQ=255) ggTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTg < 1:221758/150‑1 (MQ=255) ggTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTg > 2:1223411/1‑150 (MQ=255) tAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGcc < 2:587575/150‑1 (MQ=255) aTCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCcgc > 1:362202/1‑150 (MQ=255) aTCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCcgc < 1:857359/150‑1 (MQ=255) aTCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCcgc > 1:1496157/1‑150 (MQ=255) cTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGAt > 1:42835/1‑150 (MQ=255) gATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGc > 2:588105/1‑150 (MQ=255) aTTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCa > 2:1497330/1‑150 (MQ=255) tttGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAg > 1:1236716/1‑150 (MQ=255) tttGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAg < 1:428410/150‑1 (MQ=255) agacgacgcgTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATATCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTAACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACAAGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGAt < 1:1667824/144‑1 (MQ=255) ccGTTGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATcc < 1:614087/150‑1 (MQ=255) ccGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATcc > 1:404707/1‑150 (MQ=255) gTCGCGTTCAGTGGTGCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCg < 2:30923/150‑1 (MQ=255) gcgcgTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCCGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGa < 1:1255862/149‑1 (MQ=255) cgcgTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAg > 2:1294596/1‑150 (MQ=255) cgcgTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAg < 1:1087035/150‑1 (MQ=255) gcgTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGc > 1:965528/1‑150 (MQ=255) cgTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTGCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGcc > 1:317162/1‑150 (MQ=255) ttCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCAc < 2:1236716/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTg > 2:599665/1‑150 (MQ=255) gTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTAc < 1:1112822/150‑1 (MQ=255) ttCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCGTCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACg > 1:423814/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGc < 1:1198488/123‑1 (MQ=255) aaCGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGc > 2:1198488/1‑123 (MQ=255) ggTCCGCCCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCAc < 1:548436/150‑1 (MQ=255) ggTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCAcc < 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g‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCATGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTAAGCATTGCGCACCTCTTa > 2:1109739/1‑150 (MQ=255) ccccGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTTCATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTac < 2:1693883/150‑1 (MQ=255) cccGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTaca < 1:588105/150‑1 (MQ=255) cTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCt < 1:1413327/150‑1 (MQ=255) aaTTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCttt < 1:1497330/150‑1 (MQ=255) aaTTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGCCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGAGCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCTCCTCTTACACGCttt > 1:1266784/1‑150 (MQ=255) tttCAACTATATGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGCCCATCATCGCTTGTACATTCCTCGAGCATTCCTGCCTCGATGCTGATCACGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCATACACGCtatta > 2:1034671/1‑149 (MQ=255) tttCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTc < 2:584382/150‑1 (MQ=255) ttCAACTATAGGTCCGTTACTTCCCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCGGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCAGCCCCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCg < 1:88176/150‑1 (MQ=255) cAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGac > 2:1378866/1‑150 (MQ=255) aaCTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATTCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCTTTGAGCACCTCTTACACGCTTTTCGaaa > 2:1420473/1‑148 (MQ=255) aaCTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGaca < 2:863845/150‑1 (MQ=255) aaCTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGaca > 2:1413912/1‑150 (MQ=255) ataGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACAt < 1:281849/150‑1 (MQ=255) gggCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACAtttt > 1:19003/1‑150 (MQ=255) ccGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCt > 1:841318/1‑150 (MQ=255) cGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCtg > 2:518570/1‑150 (MQ=255) aCATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTAAATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGGAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGTggg < 1:1283353/150‑1 (MQ=255) tgtACCGCAGCCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGAGGgt > 1:411316/3‑150 (MQ=255) gtACCGCAGCCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATACCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGTGGgtg > 2:647033/2‑150 (MQ=255) tACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGTGGgtgt > 2:385385/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGTGGGTGTgg > 2:1305057/1‑150 (MQ=255) gCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGTGGGTGTGGAt > 2:1692139/1‑150 (MQ=255) ggCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAAAATTTTCCTGTGGGTGTGGATTGa > 1:1382885/1‑150 (MQ=255) ggCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATAGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGATTACGCATTGCGCACATCTTACACGCTATTCGACAACATTTTCCTGTGGGTGTGGATTGa > 1:911481/1‑150 (MQ=255) gCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCCTCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGTGGGTGTGGATTGAc < 2:423814/150‑1 (MQ=255) | AGTCCCGCCTGGCTAAATCGAGACGGATCCTGCACGATTTTGTAGCTTTTACCGTCGCGCTGGTAATCCTGATTTGCCGTCGCGTTCAGTGGTTCGAAACGCGGGTCCG‑CCCCGCTAATTTCAACTATAGGGCCGTTACATACCGCAGGCTGCGGTACACTTACCGTCTGTTGCTGACCATCATCGCTTGTACATGCCGCGAGCATTCCTGCCGCGATGCAGATCCCGAGCCACTGCTTACGCATTGCGCACCTCTTACACGCTTTTCGACAACATTTTCCTGTGGGTGTGGATTGAC > NC_000913/664946‑665243 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |