| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 693,023 | T→G | 5.3% | K119T (AAG→ACG) | ybeZ ← | heat shock protein, putative NTPase; PhoH‑like protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 693,023 | 0 | T | G | 5.3% | 262.2 / 4.6 | 94 | K119T (AAG→ACG) | ybeZ | heat shock protein, putative NTPase; PhoH‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/50); new base G (2/3); total (41/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.02e-01 | |||||||||||
GAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCA > NC_000913/692874‑693169 | gAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCt > 1:500492/1‑150 (MQ=255) actACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCtt < 1:582452/148‑1 (MQ=255) aaTACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCtt < 2:227268/150‑1 (MQ=255) tACGGCGAATATCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGATTATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTaa < 1:1136180/150‑1 (MQ=255) ggCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGGAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTa > 1:270573/1‑150 (MQ=255) gCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTAc > 2:99477/1‑150 (MQ=255) cGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTAcg > 2:116806/1‑150 (MQ=255) ccTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCAACTTCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCACCGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGAACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTTCGCCGCGtt > 1:540206/1‑150 (MQ=255) cTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTAATTAAGCcgcgcac < 1:769547/150‑4 (MQ=255) cTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTAATTAAGCcgcgcac < 2:55981/150‑4 (MQ=255) tGACGCTCCAGGGCATCACCTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGCTGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAAGTACGCCGCGGTTg > 1:1021796/1‑150 (MQ=255) tGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCTTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTAATTAAGCcgcgcacg < 2:149543/150‑5 (MQ=255) gACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTgg > 1:1418784/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTg < 1:1708446/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTg > 2:1655469/1‑150 (MQ=255) cAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCATGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGATTATTGGCTATTTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTTATTACGCCGCGTTTGGTTTTGat < 2:968863/150‑1 (MQ=255) cAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGat < 1:1205925/150‑1 (MQ=255) cAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGat > 2:374114/1‑150 (MQ=255) gggCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGatat > 2:421818/1‑150 (MQ=255) ggCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATAtt > 2:877507/1‑150 (MQ=255) cATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGat < 2:771617/145‑1 (MQ=255) cATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGat > 1:771617/1‑145 (MQ=255) aTCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCAGTACCCGCCGGGCCAACGCCGTAGGTAATGTCAAGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCGTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGATTTGATATTGAc > 2:25257/1‑150 (MQ=255) 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gCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCg > 2:1222427/1‑150 (MQ=255) ccACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACGCGCCGTGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACt < 1:993556/150‑1 (MQ=255) tGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCgg < 2:1196998/150‑1 (MQ=255) cAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCAc < 1:782200/150‑1 (MQ=255) ggtaggtTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGc > 2:654245/1‑150 (MQ=255) 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aTGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGata < 2:653241/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTg < 1:877507/150‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGa > 1:233571/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGaa < 2:1052247/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGaa < 1:428051/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGGTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGaa < 2:623161/150‑1 (MQ=255) cgcCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAAt < 2:964359/150‑1 (MQ=255) gcCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATc < 1:915119/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCgcgc > 1:709027/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGGTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTCGATCTGTTACGGTTCGATATCCTGAATCTGACCgcgc > 1:60857/1‑150 (MQ=255) gCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCa > 2:489894/1‑150 (MQ=255) ccaaacgcgGCGTAATTAAGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTACGCGCTTTGCTCCAGTACCCGGGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCa > 1:51965/6‑150 (MQ=255) tGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCg > 2:52321/1‑150 (MQ=255) cgcgGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTACGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCggg > 2:927111/1‑150 (MQ=255) gcgGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCgggg < 2:266297/150‑1 (MQ=255) gcgGCTTAATTACGCAGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTAGTCCGGGACGCTCTCCGCGCTTTGCTCGAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCgggg < 2:638240/150‑1 (MQ=255) cgGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGc < 2:556197/150‑1 (MQ=255) cgGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTGCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGc < 2:1299512/150‑1 (MQ=255) ggCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGGGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCa < 1:94183/150‑1 (MQ=255) | GAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCA > NC_000913/692874‑693169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |