| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 78,831 | 0 | T | A | 7.8% | 382.9 / 13.0 | 136 | intergenic (+32/+17) | setA/leuD | broad specificity sugar efflux system/3‑isopropylmalate dehydratase small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (63/62); new base A (8/3); total (71/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.12e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GCTGGCGTTATTCAGGGAGCAATTGCACAAAGTTGGGGGCACTTTGCTGTCTACTGGGTAATTGCGGTTATTTCTGTTGTCGCATTATTTTTAACCGCAAAGGTTAAAGACGTTTGATGACGTGGACGATAGCGGAAAGCCCGGTCATTTGACCGGGCAAGGGGATTAATTCATAAACGCAGGTTGTTTTGCTTCATAAGCGGCAATGGCGTCGTCGTGCTGCAAGGTAAGCCCAATACTGTCCAGACCGTTCATCATGCAGTGGCGGCGGAAGGCATCGATGGTAAAGCGATAGGTT > NC_000913/78683‑78980 | gctggcGTTATTCAGGGAGCAATTGCACAAAGTTGGGGGCACTTTGCTGTCTACTGGGTAATTGCGGTTATTTCTGTTGTCGCATTATTTTTAACCGCAAAGGTTAAAGACGTTTGATGACGTGGACGATAGCGGAAAGCCCGGTCAttt < 2:1489368/150‑1 (MQ=255) ggcGTTATTCAGGGAGCAATTGCACAAAGTTGGGGGCACTTTGCTGTCTACTGGGTAATTGCGGTTATTTCTGTTGTCGCATTATTTTTAACCGCAAAGGTTAAAGACGTTTGATGACGTGGACGATAGCGGAAAGCCCGGTCATTTGAc > 2:1275882/1‑150 (MQ=255) cGTTATTCAGGGAGCAATTGCACAAAGTTGGGGGCACTTTGCTGTCTACTGGGTAATTGCGGTTATTTCTGTTGTCGCATTATTTTTAACCGCAAAGGTTAAAGACGTTTGATGACGTGGACGATAGCGGAAAGCCCGGTCATTTGACCg > 2:1345238/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |