| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,199,678 | 0 | T | A | 5.3% | 278.0 / 3.9 | 95 | intergenic (+90/+1) | lit/intE | T4 phage exclusion protein; cell death peptidase, e14 prophage/e14 prophage; putative integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/45); new base A (3/2); total (48/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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TCCTTTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTC > NC_000913/1199529‑1199826 | tCCTTTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCATGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGt < 1:1257440/150‑1 (MQ=255) cTTTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTc < 1:1029061/150‑1 (MQ=255) cTTTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTATTTATCATGTGAGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTc > 2:1515885/1‑150 (MQ=255) 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gaTGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTTCTCCATCCTTTTCCTCGATCATCATGATTACGATCGGTGTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACATTTGCt < 2:1719564/150‑1 (MQ=255) gaTGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCt > 2:1514472/1‑150 (MQ=255) gaTGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACAATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCt > 2:1214516/1‑150 (MQ=255) gCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCAt > 1:935848/1‑150 (MQ=255) cTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATg > 2:924002/1‑150 (MQ=255) tAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGa < 1:1295045/150‑1 (MQ=255) aaGGTTCACTACGCTACTTTGGTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATTAAGACCTTTGCTCATGGAAt < 1:1518629/150‑1 (MQ=255) gTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGAACTTTGCTCATGGAATGTc > 1:1178478/1‑150 (MQ=255) | TCCTTTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTC > NC_000913/1199529‑1199826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |