| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,199,681 | A→T | 5.5% | *376R (TGA→AGA) | intE ← | e14 prophage; putative integrase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,199,681 | 0 | A | T | 5.5% | 261.3 / 2.4 | 93 | *376R (TGA→AGA) | intE | e14 prophage; putative integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/41); new base T (2/4); total (48/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.25e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCA > NC_000913/1199533‑1199829 | tttCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTcac < 1:919780/150‑1 (MQ=255) cATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAAc < 2:1560480/150‑1 (MQ=255) cATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAAc > 2:408660/1‑150 (MQ=255) aTCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACg < 1:535901/150‑1 (MQ=255) cGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTAGCGTTGTGAACCTTTAAGCATCTCAACGcc > 2:447887/1‑149 (MQ=255) gATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTa > 2:707569/1‑150 (MQ=255) aTTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTAc > 1:487834/1‑150 (MQ=255) tAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTATATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGAGTTGAGATGCTTAAAGGATCACAACGCTACtttt > 1:1039011/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGGCCGCCGCTCACGTAAAGTGGACTTTTTAGTGTTTATCATGTGCGGTGAGATATTCAATGTGGCGGTGAGTTGCTTTAAGGTTCACAACGCTACTTTGCt > 2:281114/1‑150 (MQ=255) ggTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAATGCTACTTTGCt > 2:839941/1‑150 (MQ=255) ggTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCt > 1:1460086/1‑150 (MQ=255) gTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTAGCGTTGTGAACCTTTAAGCATCTCAACGCCACATTgaat < 1:447887/150‑4 (MQ=37) gTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCAGTGAGAAATTCAATGTAGCGTTGTGAACCTTTAAGCATCTCAACGCCACATTgaat < 1:363575/150‑4 (MQ=37) tGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGGCCGCCGCTCGCTTAAAGTCGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAAATCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTcc < 1:918476/150‑1 (MQ=255) gATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTcaa > 1:1035553/1‑148 (MQ=255) tcttctCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATc > 1:1338781/1‑150 (MQ=255) ctctGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCTATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCttt > 2:736294/1‑150 (MQ=255) ctGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTAc < 1:1109560/150‑1 (MQ=255) tgtgATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTAcc > 1:720913/1‑150 (MQ=255) gATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGTCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCg > 2:1295045/1‑150 (MQ=255) gATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCg > 1:976891/1‑150 (MQ=255) atatTTCACGTCTTACCAGAAAATGATATGGCTGTCCGACGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGAGAGAAATTCAATGTAGCTTTAAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGATCCATCCTTTAcataga > 2:1518629/1‑145 (MQ=255) atTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGatc < 2:358916/150‑1 (MQ=255) tttCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGatca > 1:1443106/1‑150 (MQ=255) ttCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGatcat > 2:808804/1‑150 (MQ=255) aCGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATcatcat < 2:1338781/150‑1 (MQ=255) tCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTTGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCTATGTGGCGTTGAGATGCTTAAATGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGAt < 1:1515885/150‑1 (MQ=255) tACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAAc < 2:376438/150‑1 (MQ=255) aGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATc > 2:790121/1‑150 (MQ=255) aCTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGtt < 2:407725/150‑1 (MQ=255) aCTGATATGGCTGTCCGACGCTCGCGTCAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGtt < 1:1136804/150‑1 (MQ=255) cTGATATGGCTGTCCGCCGATCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGATACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGttt < 1:1687847/150‑1 (MQ=255) tGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTTCGGTGTGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGGTCAAGCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttg > 1:1126210/1‑150 (MQ=255) tGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttg < 2:1541827/150‑1 (MQ=255) gATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTCAGATGCTTAAAGTTTCACAACTCTACTTTGCTGCCTCCTTTACATCGATCAACATGATAACGATCGGTttgt > 2:493242/1‑150 (MQ=255) atatGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgtt < 2:976891/150‑1 (MQ=255) atatGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgtt > 1:1709978/1‑150 (MQ=255) tatGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgttg > 2:126915/1‑150 (MQ=255) atGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgttgt < 1:1403196/150‑1 (MQ=255) tGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgttgtt < 2:465736/150‑1 (MQ=255) ggCTGTCGGCCGCTCGCTTATAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCATTGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCAGAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgttgttg < 1:1713422/150‑1 (MQ=255) gTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGtt > 1:400118/1‑150 (MQ=255) ccgccgCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGCAATTCAATGTGGCGGTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGtttt > 1:236597/1‑150 (MQ=255) ccgccgCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGtttt < 1:419827/150‑1 (MQ=255) ccgccgCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGtttt > 1:653394/1‑150 (MQ=255) cgccgcTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTa < 1:707569/150‑1 (MQ=255) gccgcTCGCTTATAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTAt < 1:1684125/150‑1 (MQ=255) gccgcTCGCTTAAAGTGGCCTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAAAGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTAt > 2:888873/1‑150 (MQ=255) gccgcTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTAt < 1:1013487/150‑1 (MQ=255) ccgcTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATg < 2:1460086/150‑1 (MQ=255) ccgcTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGC‑TAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGa > 1:555129/1‑150 (MQ=255) ccgcTCGCTTAAACGGGACCTTTTAGTTTTTATCATGCGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTAATTTGCTCCATCCTATACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATg < 2:1054947/150‑1 (MQ=255) ccgcTCGATTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGATATGCTTAAAGGTTCAAAAAGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATg < 2:310047/150‑1 (MQ=255) ctcgctTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGAcc > 2:1350771/1‑150 (MQ=255) ctcgctTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTAAATCCTATACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGGTGGTGGTTTTTATGAca > 2:301791/1‑149 (MQ=255) aaGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGtt > 2:1387136/1‑150 (MQ=255) aGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGttt < 2:1443106/150‑1 (MQ=255) tGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGGCTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGttttt < 2:1059213/150‑1 (MQ=255) tgACTTTTTAGTTTTTTTCATGTGCGGTGAGAAATTGAATGTTTCGTTTAGATGCTTTATGGTTCTCTACGGTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATGATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtg < 1:307468/149‑1 (MQ=255) gtaCTTTTTAGTTTATATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACTACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtg < 1:90376/148‑1 (MQ=255) ggACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtg > 1:20570/1‑150 (MQ=255) tcTTTTTAGTTTTTATCATGTTCTGTGAGAAATTCATTGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCCTGAGAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtgtg < 2:815406/149‑1 (MQ=255) tttttAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtgtgtg < 1:408660/150‑1 (MQ=255) tttttAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGATTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTACATCCTTTAAATCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTtgtgtt > 1:1280074/1‑149 (MQ=255) gTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACATCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAAc > 1:352082/1‑150 (MQ=255) tttttATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACAAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAAcc > 2:607300/1‑150 (MQ=255) tATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTg > 1:1304698/1‑150 (MQ=255) aTCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGt > 2:1511404/1‑150 (MQ=255) aTGTGCGGTGAGAAATTCTATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCt > 2:939742/1‑150 (MQ=255) aTGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCt < 1:1387136/150‑1 (MQ=255) tgCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTta < 2:400118/150‑1 (MQ=255) gCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTtat > 1:182544/1‑150 (MQ=255) gCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTtat < 2:487834/150‑1 (MQ=255) tGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAg < 1:808804/150‑1 (MQ=255) gagaAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTtata > 1:809735/1‑146 (MQ=255) gagaAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTtata < 2:809735/146‑1 (MQ=255) gagaAATTCAATGCGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTGCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGAAAACGATCGGTTTGTTGGTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGa < 2:1582208/150‑1 (MQ=255) gaAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACg < 1:1350771/150‑1 (MQ=255) aaTTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGtt > 2:85521/1‑150 (MQ=255) aaTTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCT‑CATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTc < 2:1537426/150‑1 (MQ=255) ttCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCa < 2:653394/150‑1 (MQ=255) ttCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCa < 2:1135547/150‑1 (MQ=255) aagtagCGTTGTGAACCTTTAAGCATCTCAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATa > 1:1056884/6‑150 (MQ=255) aTGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCTCAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCCTGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTGTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATa < 2:1039011/150‑1 (MQ=255) gtgGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATACTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATaaa > 1:137342/1‑150 (MQ=255) gaTGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTTCTCCATCCTTTTCCTCGATCATCATGATTACGATCGGTGTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACATTTGCt < 2:1719564/150‑1 (MQ=255) gaTGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCt > 2:1514472/1‑150 (MQ=255) gaTGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACAATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCt > 2:1214516/1‑150 (MQ=255) gCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCAt > 1:935848/1‑150 (MQ=255) cTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATg > 2:924002/1‑150 (MQ=255) tAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGa < 1:1295045/150‑1 (MQ=255) aaGGTTCACTACGCTACTTTGGTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATTAAGACCTTTGCTCATGGAAt < 1:1518629/150‑1 (MQ=255) gTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGAACTTTGCTCATGGAATGTc > 1:1178478/1‑150 (MQ=255) tCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGc > 1:1091747/1‑150 (MQ=255) cacaACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACATTTGCTCATGGAATGTCGCa > 1:647499/1‑150 (MQ=255) | TTTCATCGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCA > NC_000913/1199533‑1199829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |