| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,204,409 | 0 | T | A | 7.4% | 215.1 / 4.8 | 90 | pseudogene (6/1134 nt) | aaaE | pseudogene, phage terminase protein A family, e14 prophage;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/46); new base A (3/4); total (40/50) | |||||||||||
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GATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTAAGGCGCGTCGCCAGGGTGATGGTTCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAGGGGCCGTGCTA > NC_000913/1204260‑1204558 | gATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTAAGGCGCGTCGCCAGGGTGATGGt > 1:1621413/1‑150 (MQ=255) ttCAGTACTGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTAAGGCGCGTCGCCAGGGTGATGGTtca < 2:1488341/150‑1 (MQ=255) ttCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTAAGGCGCGTCGCCAGGGTGATGGTtca > 2:1674177/1‑150 (MQ=255) 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cAGGGTGATGGTTCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAg > 1:1210881/1‑150 (MQ=255) ggggTGATGAACCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAgg > 2:530915/2‑150 (MQ=255) ggggTGATGAACCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAgg > 1:756040/2‑150 (MQ=255) ggTGATGGTTCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAgggg < 2:946919/150‑1 (MQ=255) ggTGATGGTTCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGAAGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAgggg < 2:1602456/150‑1 (MQ=255) tGGTTCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAGGGGCCGTg > 1:320603/1‑150 (MQ=255) tGGTTCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAGGGGCCGTg < 2:439580/150‑1 (MQ=255) ggTTCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAGGGGCCGTGc > 1:950425/1‑150 (MQ=255) ttCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAGGGGCCGTGCTa > 1:1404191/1‑150 (MQ=255) | GATTTCAGTAATGACGAAGGTGTGTGCTGGCCATCAATTGAAACCATTGCCCGTCAGATTGGCGCGGGGATGAGTACCGTCAGAACGGCTATCGCACGGCTGGAAGCAGAAGGCTGGTTAACGCGTAAGGCGCGTCGCCAGGGTGATGGTTCATCACCCCACTGTGCCGTGGTGGATGAATATCACGAGCACGCCACAGATGCGCTTTACACCACGATGCTTACCGGGATGGGGGCGCGACGCCAGCCACTGATGTGGGCCATTACCACCGCCGGGTACAACATTGAGGGGCCGTGCTA > NC_000913/1204260‑1204558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |