Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,212,476 | 0 | G | C | 7.2% | 449.0 / 18.4 | 136 | intergenic (‑473/+227) | iraM/ycgX | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (72/54); new base C (3/7); total (75/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATGTTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATA > NC_000913/1212327‑1212622 | gATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGtgtg > 2:698601/1‑150 (MQ=255) taataaTGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGc < 1:959517/150‑1 (MQ=255) taatGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCATGGCTAAAATACATATAAACGGATGATGACTAAACCAAAATAAATGTCCGTTAAGTATAGAAACGGACGTGTGGCACg > 1:8379/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |